Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 458,790 | IS186 (–) +6 bp :: Δ1 bp | intergenic (+90/‑93) | clpX → / → lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 458790 = | 1 (0.020) | 55 (0.880) | 47/278 | 0.3 | 98.1% | intergenic (+90/‑98) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | 608008 = | NA (NA) | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 458795 | 0 (0.000) | 65 (1.040) | 51/276 | 0.2 | 100% | intergenic (+95/‑93) | clpX/lon | ATPase and specificity subunit of ClpX‑ClpP ATP‑dependent serine protease/DNA‑binding ATP‑dependent protease La |
? | NC_000913 | = 609351 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458655‑458795 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609351‑609206 GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTACCCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTCTTCCTCTATTCTCGGCCTTCAATGCGGGGGAAACCTC > 2:852864/1‑143 TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 1:780461/1‑143 TGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGGTAACCAAAAAGGGGGGACTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC > 2:263725/1‑143 TGATTGATGGTAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCGGGGGAATAATTAGCCAGTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCC < 2:782740/143‑1 GATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAGAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCA < 2:609742/143‑1 TGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCCTTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCG < 1:88148/143‑1 GGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACACATGGGTCACAAGTAGTTAACCAATCAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGC < 1:789460/143‑1 AAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTATATCTCCCATTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAA > 1:875399/1‑143 GCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAACAGGGGGCATTTTATCACCCATTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAACCCACAAGCACTAACa > 2:869326/1‑142 CGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCGTTTAATTTTTCCTCTATTCGCGGCGGTGAATGTGGGGGAAACAGCCCCTAAGCGCTAAGTTg > 1:290691/1‑142 GAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGTGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCGCACTTAAG > 1:267189/1‑143 GAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCCGCGTTGAATGTGGCGGACACATCCCATAAGCCCTACCTTAcg > 1:1071506/1‑141 AAGCGCAACAGGCATGTGGTGAATAATTAACCATGCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:1060207/143‑1 AAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGG < 1:380109/143‑1 AGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACGAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGG > 1:267014/1‑143 GCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACCTAAGGGT > 2:428300/1‑143 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTG < 2:992758/143‑1 GCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCAATACAATTAGGTAACCAAAAAAGGGGGATTTTAACACCCCTTTCATTTTTCCTCTATCCCCGGCGTTGAATGCGGGGGCAACATCCCATACGCGATAACTTCAGGGTTG > 2:999206/1‑143 GCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATC > 1:795228/1‑143 CATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACGATCT > 2:962144/1‑143 ATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTTCTCTGTTCTCCCCTGTGAATGGGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCggccg > 1:1150712/1‑138 CTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAA < 1:1069244/143‑1 TGGTGAATAATTAACCATTCCCATCCAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTACTTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGTGGAAACATCCCATAAGCCCTAACTTAAGCGTTGAGCCATCcgcac > 2:1099046/1‑138 TGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAG > 2:329143/1‑143 GTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAA < 1:820785/143‑1 GTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTCTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAA > 2:290510/1‑143 caagacaAACCAGACCCATACAATGAGTCAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGC < 1:394464/136‑1 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCCTCTGACGAATGCGCCGC > 1:407227/1‑143 TTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGC > 1:470390/1‑143 ACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGCTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTC > 2:967942/1‑143 CATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCACATAAGCGCTGACTTACGGGGTGAACCAGCTGCAGAATGCGACGCCTCGc > 2:635436/1‑142 ATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTTTCGGTGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCTTCGGT > 1:56734/1‑143 TCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTCGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGC < 1:85505/143‑1 CCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCT > 1:478294/1‑143 TTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTACTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCCCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGCCGCCTCGGTGCCCCGctcaca > 2:1107386/1‑137 tcAACCAAGAAGTGGGTATTTTATCTCCCCTTTAATGTTTCCGCTATTCTCGGCGTGGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAT < 2:800581/141‑1 TAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATG < 2:342939/143‑1 AACCAAAGAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 2:618227/143‑1 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 1:505461/143‑1 AACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGC < 1:806383/143‑1 GGGGGGTTGTAGCTCCCGGTTAATGTGTCCCCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAGGCGCTAAGTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCT < 2:1138760/143‑1 GGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCT < 2:870886/143‑1 GGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCATCTAATCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTAGCGTACTTCc > 2:414227/1‑142 GATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCCCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCca > 2:403425/1‑141 GATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGAGTTGAATTTGGTTTGTACATCCCATAAGCGCTCACTTTAGGGTTGATCCATCTGAAGAATGCGACGCGTCGGTGCCTCGTTATGACGATACCTCGCGTTCTTCcg > 2:825077/1‑141 TTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAAAATCCCATAAGCGCTCACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGGCTCGTTAAGACGAAGCCAAGCGTTCTTtcatt > 2:425054/1‑138 TTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGC > 2:10104/1‑143 TCCGCTTGAATTTTTCCTCTATTCACGGCGTTGAGTGTGGGGGAAACGTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTT < 2:475919/143‑1 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATACGCGCTGACTGAAGGGGCGTACCATGTGAAGGATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGGGTTTTTCCATGGCGGTTT > 2:1007791/1‑143 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCCATTGCGTTTT > 1:456120/1‑143 TCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTCTT > 2:268986/1‑143 gCCTGTAGTTGTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAATCATGCCATGAGCGCTAACTTAAGGGGTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAGGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGT < 2:745620/142‑1 CCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTGCTTCAATTGCGTTTTGTA > 1:279250/1‑143 TTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT < 2:462152/104‑1 TTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTT > 1:462152/1‑104 TCTATGCTCGGCGTGGAATGAGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGTATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATGGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATA < 1:55570/143‑1 TTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAGGGGTTGAAGCATCTGAAAAATAAGATCCCTGTCGACCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTCCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGCTACTGT > 1:537848/1‑143 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC < 1:329143/143‑1 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC > 2:843430/1‑143 TCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATACCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCC < 2:166113/143‑1 CGGCGTTGGATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 2:669490/143‑1 CGGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCA < 1:1139639/143‑1 GGCGTTGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCAC < 1:742792/143‑1 ggTGAATGTGGGGGAAACAGTCCATTAGCGCTAAGTTATGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCGTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAA < 2:44963/141‑1 TGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATG < 2:59503/143‑1 TGAATGTGGGGGAAACATCCCATAAGAGCTAACTTAATTGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATG < 1:1089773/143‑1 GTGGGGGAAACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCACCACCACAACGTGCTGTTTTGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCAC < 1:263725/143‑1 ACATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCCTCCATTGCGTTTTGTCGGCTGTCAGCGATACTGTCCCCCGCATGGCCACCTTTCAGCT > 2:621604/1‑143 ATCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGGCTCGCGTTATTCAATTGTGTTTTGTAGGCTGTCAGGGCTACTGTCTCACGCATGGCCACCTGTAAGCTCC > 2:193062/1‑143 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCGCGCGCGCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTGCCACGACTGGCCCCCTGTAAGCTCCg > 2:647778/1‑142 TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGCTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCCGTCACGGATACTGTCCCACGCATGGCCACCTGTAAGCTCCA > 2:1048382/1‑143 CCCATACGCGCTAACTTACGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG < 1:296830/143‑1 CCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAG > 2:317462/1‑143 CCCATAAGCGCTAACTTAAGCGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCACGTTCCTCAACTGCCTTTTGTAGACTGTCAGGGATACCGTCCCACGAATGGCCACCTGTCAGCTCCAG < 1:1115295/143‑1 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGAAGCATCGCGGTCTTCAAGTGCGTCTTGTGGGCTGTCAGGGCTCCTGTCCCACGCATAGCCGCCTGTCAGCTCCAGA > 2:1146847/1‑143 CCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAACAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCCCGCGTTCTTCAATTGCGTCTTGTAGGCCGTCAGGGACACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTCGGCCCCAGA > 2:757855/1‑143 CATGAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATTCGACGCCTCGGTGCCTGGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTGCAATGGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < 1:284702/143‑1 CATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCAGCTGTAAGCTCCAGct > 1:361203/1‑141 GCTGATTTATGGCAAGCCGGAAGCGCAACAGGCATCTGGTGAATAATTAACCATTCCCATACAATTAGTTAACCAAAAAGGGGGGATTTTATCTCCCCTTTAATTTTTCCTCTATTCTCGGCGTTGAATGTGGGGGAAACAtccc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/458655‑458795 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGAACCATCTGAAGAATGCGACGCCTCGGTGCCTCGTTAAGACGATGCCTCGCGTTCTTCAATTGCGTTTTGTAGGCTGTCAGGGATACTGTCCCACGAATGGCCACCTGTAAGCTCCAGAT < NC_000913/609351‑609206 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |