| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 4,049,903 | IS2 (–) +5 bp | noncoding (5‑9/109 nt) | spf → | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4049903 = | 0 (0.000) | 91 (1.870) | 68/282 | 0.0 | 100% | noncoding (5/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| ? | NC_000913 | 4498181 = | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 4049907 | 0 (0.000) | 105 (2.150) | 76/282 | 0.0 | 100% | noncoding (9/109 nt) | spf | Spot 42 sRNA antisense regulator of galK translation, Hfq‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 4499511 | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGAACATGCCTTTTTTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATG > NC_000913/4049761‑4050040 | ttccggtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctag > 2:558571‑M1/143‑143 (MQ=255)tGAACATGCCTTTTTTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGCTATGGCTATTAGAACTTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAgg < 1:242435/143‑1 (MQ=255) gAACATGCCTTTTCTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAggg < 1:511956/143‑1 (MQ=255) tgtgtggtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTAc > 1:340839‑M1/139‑143 (MQ=255) cATGCCTTTTTTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTAAAAAACTAAATCTAAAATTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTAc > 1:646720/1‑143 (MQ=255) cgcggtaggccgtctgcgttcttcctgccctaagacatcagtcatctgttctccaatgacgagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggtggtctggagattcagggggccagtctaGGTACag > 2:282451‑M1/137‑143 (MQ=255) gCCTTTTTTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAAAAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGGACtgg > 1:847472‑M1/1‑140 (MQ=255) gtacgccgtctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGt < 2:92958‑M1/11‑1 (MQ=255) tttCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgc < 1:776402‑M1/143‑10 (MQ=255) tCGTAAGTAAGCAACATATGCTGTCACATTTTGCGAAGGCTAATAGAAACTCCTATGCAACGACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGACTAAGCAATAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgccc < 2:486268‑M1/143‑12 (MQ=255) gtaagtaaGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccct > 2:46575‑M1/1‑130 (MQ=255) taagtaagCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgccccta > 1:304987‑M1/1‑129 (MQ=255) gctgcgtgtttccggacctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGtt > 2:755897‑M1/125‑143 (MQ=255) ctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTc > 1:584415‑M1/124‑143 (MQ=255) ctgcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTc > 2:10901‑M1/124‑143 (MQ=255) gcgtttctccggcgctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTa > 2:422836‑M1/122‑143 (MQ=255) gcgtttctccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTa < 2:316013‑M1/22‑1 (MQ=255) gCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctctatttcc > 1:459234‑M1/1‑122 (MQ=255) tccggccctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagactaaagactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCa > 2:306445‑M1/115‑143 (MQ=255) aCATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccaga > 2:44994‑M1/1‑119 (MQ=255) aaGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatcttgccagacatc > 1:310822‑M1/1‑115 (MQ=255) aGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTAATATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatct < 1:449735‑M1/143‑30 (MQ=255) ctaagacatcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtactaagactatcacttatttcactgatattggttgtctggagattcaggggtccaatctaTGTACAGAGGTCAGATCTTCTATCTTCCACACcttc < 2:807295‑M1/36‑2 (MQ=255) ttatacatcactcatctgttctccaatgactcgtctaataactagtattaatactatcacttatttaagtgatattcgttttctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCtttt > 1:696155‑M1/107‑143 (MQ=255) aagacatcaatcatctgttctccaatgcctagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTa > 1:225863‑M1/106‑143 (MQ=255) tCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttat > 1:640079‑M1/1‑109 (MQ=255) aCGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGTGTAAtggatttgcctctatatttccaggcatctgttatca > 1:119510‑M1/1‑107 (MQ=255) aCGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatca > 1:399092‑M1/1‑107 (MQ=255) atcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCa < 1:515229‑M1/43‑1 (MQ=255) atatagagatggataTTAGAAATTCCAATGCAAAAACAGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcact < 2:869970‑M1/136‑39 (MQ=255) ttttGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatcggctatcgctt > 1:691142‑M1/1‑104 (MQ=255) tcaatcatctgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCAc > 1:211060‑M1/100‑143 (MQ=255) ggggatgGCTACTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAAGTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAACAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaac < 2:820676‑M1/140‑43 (MQ=255) gtgATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacc > 1:282351‑M1/1‑100 (MQ=255) gATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 2:118527‑M1/143‑46 (MQ=255) gATGGCTATTAAAAATTACTATGTAACAACTAAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 2:179870‑M1/143‑46 (MQ=255) gATGGCGATTAGACATTCCTATGCAACAAGTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaaccca < 2:179916‑M1/143‑46 (MQ=255) aTGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccat < 2:70802‑M1/143‑47 (MQ=255) tgttctccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGa < 1:402973‑M1/53‑1 (MQ=255) ggCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatta < 1:709558‑M1/143‑49 (MQ=255) ccaatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGc < 2:66620‑M1/59‑1 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCt < 2:251576‑M1/60‑1 (MQ=255) caatgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGCAatgggatctcgct < 2:137562‑M1/60‑7 (MQ=255) caacgactaggctgaaagttagtattaagactatcactgagttaagtgagattggttgtctggagattcagcgggccagtctaGGTCCAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCt > 2:227827‑M1/84‑143 (MQ=255) atgactagtctaaaaactagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGa < 1:701104‑M1/62‑1 (MQ=255) cTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgc > 1:546306‑M1/1‑80 (MQ=255) tATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagccatctgttatcccttaacccattacaagcccgctgccgca > 2:192979‑M1/1‑79 (MQ=255) tATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgca < 1:534080‑M1/143‑65 (MQ=255) aTGCAACAACTGGAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgtcatcacttaacccattacaagcccgctgccgcag > 1:843396‑M1/1‑78 (MQ=255) tGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga < 1:398417‑M1/143‑67 (MQ=255) tGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcaga < 1:606939‑M1/143‑67 (MQ=255) tGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccatgacaagcccgctggggcaga > 1:362400‑M1/1‑77 (MQ=255) actagtattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGccc > 1:16947‑M1/67‑143 (MQ=255) acTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattccc < 1:46575‑M1/143‑74 (MQ=255) gAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGCGCTGCACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtg < 2:623820‑M1/143‑77 (MQ=255) tattaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATCTCTTAGCCGCCCcagtc < 2:53615‑M1/82‑1 (MQ=255) aaaaaaaTTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggc < 1:10930‑M1/143‑79 (MQ=255) ttaagactatcagttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTCCTTCTCGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCcagtcag > 2:397090‑M1/60‑143 (MQ=255) ttaagactatcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCcagtcag < 1:167038‑M1/84‑1 (MQ=255) gactatcactcatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAAt > 1:736011‑M1/56‑143 (MQ=255) aaTTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcg > 1:794309‑M1/1‑60 (MQ=255) ctagcacttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGTTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGa > 2:277065‑M1/54‑143 (MQ=255) cacgtatgtaggtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTgg > 2:706789‑M1/50‑143 (MQ=255) aaaaaGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacc < 2:840704‑M1/143‑90 (MQ=255) acttatttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTggg > 2:699265‑M1/49‑143 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGtt < 1:574532‑M1/100‑1 (MQ=255) tttaagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGtt < 1:324536‑M1/100‑1 (MQ=255) aataagtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATCTTTTAGCCGCCCCCGTCAGCACTGACTGGGgcgct < 2:340017‑M1/100‑3 (MQ=255) gCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgca < 1:27915‑M1/143‑97 (MQ=255) ttCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcacta < 2:844233‑M1/143‑100 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcaggggtccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTa > 1:883097‑M1/40‑109 (MQ=255) agtgatattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTa < 2:883097‑M1/70‑1 (MQ=255) tCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactat > 1:194316‑M1/1‑43 (MQ=255) ctgaaccgaaCACAAAAGAGTAGAGTCAGTCGCGGAGGGTACtggatgtgcccctatatttcgagacatctgttatcacttaacgcattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagtgataacccagcgcactatg < 2:356421‑M1/143‑102 (MQ=255) tgaactgaacAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgc > 1:479023‑M1/1‑41 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGGTATCATACAGCACGTGATAGGTTTGGTCTAAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTg > 1:412319‑M1/36‑143 (MQ=255) atattggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTg > 1:92958‑M1/36‑143 (MQ=255) cattgggtggctggaggttgaggggggcagtctaGGTACGGAGGTAAGGTGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACGTCCCGTAATCGGATTTGGGTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTgg > 2:76858‑M1/35‑143 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTggg > 1:624144‑M1/34‑143 (MQ=255) attggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACGTCACGTAAGCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTACTGACTGGGGCGTTTTTTATTggg > 2:733595‑M1/34‑143 (MQ=255) attggttgtcgggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTggg > 2:562670‑M1/34‑143 (MQ=255) ttggttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAATATGTCCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGc > 1:616770‑M1/33‑143 (MQ=255) gaacAAAAAAGAGTAAAGTTCGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgc < 1:719174‑M1/143‑109 (MQ=255) gttgtctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCgaa < 1:655536‑M1/114‑1 (MQ=255) cAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcacgtggcgagcgataaccaagcggactatgcggatgccat > 2:279721‑M1/1‑32 (MQ=255) cAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgccactatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcccactatgcggatcccat > 2:597181‑M1/1‑32 (MQ=255) tctggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCTGCCCcagt < 1:432425‑M1/81‑1 (MQ=255) aaaaaGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattc > 1:745616‑M1/1‑30 (MQ=255) ggagattcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGacagaaaag < 2:591143‑M1/121‑1 (MQ=255) agTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagagattcccgcggcgagcgataacccagcgcactctgcggatgccattcgttata > 2:365796‑M1/1‑24 (MQ=255) gTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataa < 1:753889‑M1/143‑121 (MQ=255) gTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgacattcgatataa > 2:212340‑M1/1‑23 (MQ=255) ttcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCg > 2:570181‑M1/18‑143 (MQ=255) ttcagggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCg > 1:628925‑M1/18‑143 (MQ=255) gggggccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAAt > 1:66620‑M1/14‑143 (MQ=255) gTTAGTCGCGTAGGGTGCtggatgtgcccctatatttccagacatcttttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagtgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctc < 2:160259‑M1/143‑126 (MQ=255) gtacgcgtagCGTACtggatttgcccctatattccccgacatctgttatcacttaacccattacaagccgcctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaa < 1:343445‑M1/140‑129 (MQ=255) gccagtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCt < 1:55789‑M1/134‑1 (MQ=255) gtctaGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATg < 1:373989‑M1/138‑1 (MQ=255) cgTAGGGTACtggatttgcccctatatttccagacatctgttatcacttaacccattacaagcccgctgccgcagatattcccgtggcgagcgataacccagcgcactatgcggatgccattcgttataatgctcgaacgcct > 1:564964‑M1/1‑10 (MQ=255) | TGAACATGCCTTTTTTCGTAAGTAAGCAACATAAGCTGTCACGTTTTGTGATGGCTATTAGAAATTCCTATGCAACAACTGAAAAAAAATTACAAAAAGTGCTTTCTGAACTGAACAAAAAAGAGTAAAGTTAGTCGCGTAGGGTACAGAGGTAAGATGTTCTATCTTTCAGACCTTTTACTTCACGTAATCGGATTTGGCTGAATATTTTAGCCGCCCCAGTCAGTAATGACTGGGGCGTTTTTTATTGGGCGAAAGAAAAGATCCGTAATGCCTGATG > NC_000913/4049761‑4050040 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |