New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2566839 = | 45 (0.800) | 4 (0.070) | 4/270 | 8.0 | 9.1% | coding (46/1404 nt) | eutA | reactivating factor for ethanolamine ammonia lyase |
? | NC_000913 | 2566937 = | 37 (0.690) | coding (1171/1227 nt) | eutH | ethanolamine transporter | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATC > NC_000913/2566702‑2566974 | gCCCTGTTTATCGACAGCGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAGTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGc < 2:425297/143‑1 (MQ=255) cccTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCCGCAAGTTTTTCGTTTAATGAATTAGTAGCTCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGcc < 1:961303/143‑1 (MQ=255) tttATCGACAGGTGTAAAGAACACCGGTCTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGatat < 2:562015/143‑1 (MQ=255) tttATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGatat < 1:927127/143‑1 (MQ=255) ttactgACAGGGGTCATGTACACTGGGCTTTGCCAGCTACTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGTACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATc < 2:372430/138‑1 (MQ=255) aTCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGa > 1:71907/1‑143 (MQ=255) gACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATAc < 2:580694/143‑1 (MQ=255) tAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGCGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTc > 1:712835/1‑143 (MQ=255) gaggcgacCGGACGTGGCCAGGTAATTGCGCGGTTAAGGGTTTCGTAGGGCGGCGCCTGCGACGCCGCCGCACGGTTGACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCaa < 2:359252/137‑1 (MQ=255) aaCACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAg > 1:810172/1‑143 (MQ=255) acCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTg > 1:377741/1‑143 (MQ=255) cGGACTTTGCCAGCTAATGTCGCGTTTAATGAAGTCGGAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCCGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGc < 1:926405/143‑1 (MQ=255) gccTTTGCCTGCTAATTTCGCGTTTAATGAATCCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGa < 2:843216/141‑1 (MQ=255) gCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGATGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGa < 2:778851/143‑1 (MQ=255) aTTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATtgt < 1:381846/143‑1 (MQ=255) aTTTCGCGTTTAAGGAATTCGTAGCGCGTCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATtgt < 2:317866/143‑1 (MQ=255) ttCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGACACTCACCTGGGTGGCGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGCGTTCACGATTTTGc > 1:418398/1‑143 (MQ=255) gTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGTTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTTGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCg > 1:515914/1‑143 (MQ=255) gTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGACTCCg > 1:779236/1‑143 (MQ=255) tAATGAAGTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCtt < 1:368786/143‑1 (MQ=255) tCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTa < 2:71907/143‑1 (MQ=255) cGTAGCGCGGCACCTGCGACGCCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAg < 1:59526/143‑1 (MQ=255) cgcgGAACCGGCGACACCGCCGCACGGTTCACCATCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTTGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCTGCTTCGGTTTTAgtcgcg < 1:652525/143‑1 (MQ=255) tgccctcgCGACACCTCCGCACGGTTAACCTGCCCCACCCGTGAGAAAATCACCTCGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCTACGCTCCATATCTTGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAgtcgcggtc < 2:579217/136‑1 (MQ=255) catcgtgcacCGCCGCACGGTTGACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGt < 2:868680/136‑1 (MQ=255) cTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGGTCACGATTGTGACTCCGCTTAGGTTTTAGTCGCGGTCGCGtc > 2:586572/1‑143 (MQ=255) cacCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGCTTTAGTCGCGGGCGCGTcttcttg > 1:55287/1‑142 (MQ=255) acCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTCGTGCCGCTATCCATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGAGTTCACGCTTGTGCCTCCGCCTCGGTCTTCGTCGCGGTCGCGTCTCCtttt > 2:200829/1‑143 (MQ=255) ccgccgCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGGCGCGCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTCCGGTTTTAGTCTCGGTCTCCGCCTCttttt > 1:244989/1‑142 (MQ=255) cgccgcACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTgg > 1:594117/1‑143 (MQ=255) cgcACGGTTATGCAGCTCCTGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAc < 2:437789/143‑1 (MQ=255) cgcACGGTTAACCAGCGCCAGCCGGGAGAACGTCACCGGGGTGGGGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAc < 2:712835/143‑1 (MQ=255) taCGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCa < 2:165128/142‑1 (MQ=255) aCGGTTCACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGGGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAg < 2:692431/143‑1 (MQ=255) tAACCAGGTCCTGCGGGGAGAAAATCGCCTGGGTGGTGGTGGTGCAAATTTTTATTTCGGGGGTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGcatca < 1:465419/143‑1 (MQ=255) cAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATcgc > 1:347506/1‑143 (MQ=255) cAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTTAATAGCCGGCGCGTGTTCGCGCTTCTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCCGCCTCATcgccacgcc > 1:38778/1‑143 (MQ=255) cAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTCTTGGCACCAGCATCATcgccacgac > 1:420027/1‑141 (MQ=255) gCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCaa > 2:60335/1‑143 (MQ=255) agaAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCAGCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCg > 1:1004900/1‑143 (MQ=255) gttGGGTGGTGTTGGTGCCGTTATCGTTACCTACTCTCACTAGCTGCCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTAcgccgc < 2:389201/141‑1 (MQ=255) cTGGGTGGTGGTGGTGACGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGAGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCAACATCGCCACGCCCACACCCGTGACgcggcc > 2:374871/1‑143 (MQ=255) ggtggtggtggtGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGAt > 1:386079/1‑143 (MQ=255) gtggtggtggtgCCGATATCGATACCGCCGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATc < 2:90163/143‑1 (MQ=255) gtggtggtggtgCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCACCACGCCACTCGCCGTTACGCCGCCGCTc > 1:62660/1‑143 (MQ=255) | GCCCTGTTTATCGACAGGGGTAAAGAACACCGGACTTTGCCAGCTAATTTCGCGTTTAATGAATTCGTAGCGCGGCACCTGCGACACCGCCGCACGGTTAACCAGCTCCAGCCGGGAGAAAATCACCTGGGTGGTGGTGGTGCCGATATCGATACCGACGCTCAATAGCTGGCGAGTGTTCACGATTGTGCCTCCGCTTCGGTTTTAGTCGCGGTCGCGTCTTCTTTTGGCACCAGCATCATCGCCACGCCAATCGCCGTTACGCCGCCGATC > NC_000913/2566702‑2566974 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |