| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,936,308 | C→T | V3I (GTA→ATA) | zwf ← | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,936,308 | 0 | C | T | 92.5% | 114.2 / NA | 41 | V3I (GTA→ATA) | zwf | glucose‑6‑phosphate 1‑dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/1); new base T (20/17); total (23/18) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGG > NC_000913/1936170‑1936443 | gtcccccGATAATCCGGGCGTCCCGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGcc < 1:901678/138‑1 (MQ=255) cGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCCGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAACGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCa < 1:486178/143‑1 (MQ=255) aTAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCCAAAATGCCCCGGTCACAGGCCTGGGCTGTTCGCGGTAGAGCCagggaatc > 2:431222/1‑136 (MQ=255) tAATCCGGGTGTCCGGGTTGACCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAACGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGCCACAGCCCTATTCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATtc < 2:888499/143‑1 (MQ=255) aTCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAGTTTACCCCGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGACCATGACCATGGCAGAGGCCTGGGCTTTTTGCGTTTCCGCCATGTCATtctc > 1:616579/1‑143 (MQ=255) gtgtCCGGGTGGACCTGACCCGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTCCGACGCGCAGGGTCTCCTTTCTCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAg < 1:446381/143‑1 (MQ=255) tCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAACATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGCCACCCCCATCTCGTGCTCCCTCAGtaa > 2:205431/1‑141 (MQ=255) tCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTta > 2:167642/1‑143 (MQ=255) cGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaac < 2:619668/143‑1 (MQ=255) cGGGCTGAGCTGACCGGCTTTTGCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTtaac < 2:614527/143‑1 (MQ=255) gggTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTTCGTtagct > 1:795808/1‑143 (MQ=255) cGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTGTCGCCATGGCATTCTGCTTGAGTTAACTAGCCCGGGACTTa > 1:475481/1‑143 (MQ=255) cTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGCCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGc < 1:567970/143‑1 (MQ=255) tttttCCAGTGGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGcc < 2:285827/143‑1 (MQ=255) ttttCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCa < 1:996194/143‑1 (MQ=255) tCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGCACTTAAGCCAggg > 1:412459/1‑143 (MQ=255) gTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGGTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGtata > 2:819737/1‑143 (MQ=255) gAAGGCAGCAATGTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGCTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAAtttt < 1:243112/143‑1 (MQ=255) aaGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTc < 1:167642/143‑1 (MQ=255) gcagcaATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCGGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTa > 1:235606/1‑143 (MQ=255) gcagcaATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGTTATACTTGTAATTTTCTTa > 1:90707/1‑143 (MQ=255) gcagcaATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTCTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTa > 1:653395/1‑143 (MQ=255) aTTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAACTGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTACGCCCGGGTATCCTTGTAATTTTCTTACGGTGc > 2:556431/1‑143 (MQ=255) cgacgCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGt > 1:125939/1‑143 (MQ=255) gtcttcTTTCGCGCCGAAAACGACCAGGTCACAGGCCGGGGCTGCCTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTAc < 1:85073/138‑1 (MQ=255) cGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGCACTACTATTACGa > 2:775/1‑143 (MQ=255) cTTTCGCGCCGAAAATGACGAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACCTATTTTACGGGCt > 2:201692/1‑143 (MQ=255) cgcgCCGAAAATGACCACGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCg < 2:243779/143‑1 (MQ=255) cgcCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGaa > 1:677898/1‑143 (MQ=255) cgcCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGaa > 2:911926/1‑143 (MQ=255) cGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAAc > 1:896618/1‑143 (MQ=255) gAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACt < 1:447645/143‑1 (MQ=255) ggTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAACACTGTAACCGCTTa > 2:330716/1‑143 (MQ=255) tgacaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCTCCATGTCATTCTCCTTCTGTTTACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATc < 2:875306/141‑1 (MQ=255) tCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATc > 2:243710/1‑143 (MQ=255) acaGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTCTACGAGCTTGCGAAAACTCTAAACGCTTATCCa > 2:145022/1‑143 (MQ=255) caGGCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTCATCCAc < 1:638644/143‑1 (MQ=255) ggCCTGGGCTGTTTGCGTTATCGCCATGTCATGCTCCTTAAGTTAACTAGCCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTCTTACGAGCTTTCGAAAACTGTAAACGCTTATCCAccc < 2:993412/143‑1 (MQ=255) gtgtGCGTTACCGCCAGGTCATCCGCCATAAGAGAACTAACCCGGTCCTTAAGCCAGGGTATACGTGCAATTTTCTCACGGTCCACCGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTAc < 1:307472/140‑1 (MQ=255) tGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAGACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGTGATTACggg > 1:175893/1‑143 (MQ=255) tGCGTTATCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACggg > 1:175941/1‑143 (MQ=255) | CTACGCCGATAATCCGGGTGTCCGGGTTGAGCTGACCGGCTTTTTCCAGTTGATACAGGGAAGGCAGCAATTTACGACGCGCAAGGTCGCCTTTCGCGCCGAAAATGACCAGGTCACAGGCCTGGGCTGTTTGCGTTACCGCCATGTCATTCTCCTTAAGTTAACTAACCCGGTACTTAAGCCAGGGTATACTTGTAATTTTCTTACGGTGCACTGTACTGCTTTTACGAGCTTGCGAAAACTGTAAACGCTTATCCACCCGTGCGATTACGGG > NC_000913/1936170‑1936443 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |