Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,206,506 | C→A | 15.2% | T15K (ACA→AAA) | ttdA → | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,206,506 | 0 | C | A | 15.2% | 261.4 / 8.7 | 128 | T15K (ACA→AAA) | ttdA | L‑tartrate dehydratase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/67); new base A (10/11); total (48/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
GCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206269‑3206742 | gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCACACAAAAA‑AAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGATGTGGGAAAGT‑AAAAAAC‑AAC‑A‑GGAAGT‑GAATAAGTTGAC‑a > 2:1314934/1‑239 (MQ=255) gCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑a < 1:230324/239‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑Aga‑ga < 1:319244/238‑1 (MQ=255) tgtgATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGGTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GAt < 1:554090/239‑1 (MQ=255) gATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTg < 2:868002/238‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCg < 2:443225/239‑1 (MQ=255) tAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATGCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTc < 1:717129/238‑1 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTAGACAAATA‑CAAAAAAT‑GGAGTTGTCCTTGTGAGCGGAAGT‑AAAAAAA‑AAA‑A‑AGCAAC‑GAAAAAGATTAA‑AGA‑GATTGTGGcgca > 2:76146/1‑236 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAACAAATA‑CAAAAAAC‑GTGGGTGTCCTGGTGAGCGAAAGA‑AAAAAAA‑AAC‑A‑CACAGA‑GAAAAAAATGAC‑AGA‑GATTGTGTC‑Taa > 2:41850/1‑239 (MQ=255) cgcAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAACAAAAA‑AAAAAAAT‑TGAGTTTTCCTGGTGTGTGGAAGT‑AAAAAAC‑AAC‑ACGGCA‑T‑GGATAAAGTGAC‑AGA‑GAATGTCGC‑Taa > 1:716197/1‑239 (MQ=255) tgtATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAGAAAAAAATAAAAAATT‑GGGGTTG‑CATGATTAGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAA‑A‑GGAAGT‑GAATAAGATTAA‑AGA‑AATTGTCGC‑TAACtttt > 1:345641/1‑238 (MQ=255) ttCGCAAAACATTGCAATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACAAACTGTTAATTACATATTCCGGGGGGAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑CAAAACCG‑GGAGTTGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑G‑GGAAGT‑GAATAAGTGGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGcc < 1:1034508/239‑1 (MQ=255) tCGAAAAACATTGCCTTTCCCTGCTCTGGCCCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTAATTCACAAACTGTTAATTACATATTCACGGTGAAAAAAAATAAAAAACCAAATTTTTGGTGGTAGTTTGGGGCGGTG‑AATTTTTCAAGAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCa < 2:159431/239‑1 (MQ=255) aaaaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATA‑AAAAAAAT‑GGAGTTGCCATGATTAGCGGAAGT‑AAAAAAA‑AAC‑A‑AGAAGA‑GAATAATCTGAC‑AGA‑GGATGTCGC‑GACAATTACCGCCATTAt > 1:673571/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTACACAAATA‑AAAAAAAT‑GGGGATTTCCTGATGAGAGAAAGT‑AATAAAC‑AAA‑A‑AGCAAG‑GAAAAAATTGAC‑AGA‑GAGTTTTCC‑TAACTTTTCCGCACTGAttt > 1:1369101/1‑239 (MQ=255) aaCATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGGAAAATA‑TAAAAAAA‑GGAGGTGCCCTGTTGTGGGGAAGG‑AATAAAC‑AAA‑A‑GGAAAA‑GGAAAAAGTGAC‑AGG‑GATTGTCGC‑TAAATTTACCCCCCTAAttt > 1:113305/1‑239 (MQ=255) cATTCCCTGCTCTGGCGAAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTGGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑AAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:817567/239‑1 (MQ=255) cccTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCTGACACAAA‑CAAAAAAA‑TGAGGTGGCATGATGAGGGGAAGA‑AAAAAAC‑AAA‑A‑AGCAGT‑GGAAAAGTTGAA‑CAA‑GGATGTTGG‑CAACTTTACCGCCCCGATTTCTTCCCCaaaa > 2:1211880/1‑236 (MQ=255) ctctGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAA‑CAAAAACA‑GGAGTTGTCACGGTGGGCGAAAGT‑AAAAAGC‑AAC‑A‑CGCAGG‑GAAAAAATTGTC‑AGA‑AAATGTCGC‑TAACTTTACCACCCCGATTTCTACCCGACA‑GCCtgat > 2:487715/1‑239 (MQ=255) gcgcAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCTAACAAAAA‑AAAAAAAT‑GGGGTTGGCATGATGAGGGGAAAT‑AAAAAAA‑AACAA‑GACAG‑‑GAATAAGTTGACAAGA‑GATTGTGGT‑GAACTTTCCGCCCAGAATTTTTACCGCAAT‑GCGTG‑TGACgg > 2:638215/1‑238 (MQ=255) cgaaaTATTAATTTTTATTTTCGGGTTAATTAAGAAACTTTTAATTACATTTTCACGGTGGAAAAAAATATAAAACCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAAAA‑AAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACgt < 2:1369101/235‑1 (MQ=255) gaaaTATTATTTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACgtg < 2:261785/236‑1 (MQ=255) atatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AATTTTTTTCAACAAAAA‑AAAAAAAT‑TGAGTTGTCATTATTAGCGGAAGT‑AATAAACAAAC‑A‑GAAAGT‑GAAAAATTAGAA‑AGA‑‑AGTGTCGG‑CAAATTTACCCGCCTGATTTATAACCGGAA‑GCCCGGTGAccttgttg > 2:782590/1‑232 (MQ=255) tatTCATTCTTTTTTTCGCGTTGATTCACTAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGTTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACG‑GGAGTTGCAATGATGAGGAAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGa < 1:28355/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCAGACAAAAA‑AAAAAAAT‑GGAGTTGTCATGATGAGGGGAAAT‑AAAAAAC‑AAA‑A‑AGGAGG‑GAAAAAGATGAC‑CGA‑GAATGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGAATTTTACCCCTAT‑GCCTGAGGACGGGGTGGa > 2:372883/1‑239 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACgtg < 1:1346673/234‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGAG‑AAATTTTTCACAAAAATA‑AAAAAAAT‑GGGGTTGTCATAGTGGGCGTGAGT‑AAAAAGA‑AAA‑A‑AGAAAA‑GAATAAAATTTC‑AGA‑GATATTTGC‑TAAAATTATCCCCCTGCATTTTACCCCAAT‑GTCtgatgagaggtggga > 1:739830/1‑230 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AAAAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGa < 1:977525/239‑1 (MQ=255) tatTCATTCTTATTTACGCGTTGATTCACGACCTGTTAATTACATAGTCACGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAACA‑CAAAAATT‑GGAGTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AATAACC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCCA‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGa < 1:777044/239‑1 (MQ=255) ttcattcTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTTCGACAAAAA‑CAAAAACA‑AGAGTTGCCATGATGAGGGGAAGA‑AAAAAAC‑AAA‑A‑GGAAGA‑GAAAAAGATGAA‑AGA‑GAATGTCGC‑TAACATTTCCGCCATAATTTTTACACGCAT‑GTCGCATGAGGTGGTGGGTa > 2:28355/1‑239 (MQ=255) tATTTTCGGTTTGTTTCACGAAAGGTAAATTACATATTCAGGGTGTAAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGGAGTTTGTGGGGGTA‑AATTTTCCCAGACAAATA‑AAAAAACG‑GGAGTTGCCAAGATGAGC‑AAAGTAAAAAAGC‑AAA‑A‑GGCGGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 2:303189/239‑1 (MQ=255) tATTTTCGCTTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGACAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1211880/239‑1 (MQ=255) tATTTGCGGGTTAATTCACGAACTTTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACTTTTTTAGTGGTAGTTGGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAAAA‑CAAAAACG‑GGATTTGCCATGAGGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:782590/239‑1 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAAAA‑CAAAAAAT‑GGAGGTGTCATGATGAGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAC‑A‑AACAGA‑GAATAAATTGAC‑AGA‑GATTGTCGCGTAAATTT‑CCCCCCTGATTTTTACCCCAAA‑AGCTGATGACGTTGTGGGGAAAATAAAACa > 2:731558/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAAAAAAAAA‑AAAAAAAT‑AGAGTTTGCATTATGAGGGAAAGG‑AAAAAAA‑AAA‑A‑GGGAGA‑GGAAAAATTGAA‑AAA‑AAGTGTTAG‑TAACATTACCGCCCATATTTTTACCCGGAA‑GGCTGATGTGGGGGGGGGTGAAATAAAACa > 2:975011/1‑239 (MQ=255) ttttCGCGTTGATTCACGAAATGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGAGGTG‑AAATTTTTCATACAAATA‑AAAAAAAT‑CAAGGTGTCATGATAAGAGGAAAA‑AATAAGC‑AAA‑A‑GGAAGG‑GAAAAAGATGAC‑CGA‑GATTGTCGC‑TAACTTCAACGGCATGATTTCTACCCCAAA‑GACTGAAGACGCGGGGGGTAAAcacaaaaa > 1:114003/1‑232 (MQ=255) tttCGCATGAATTAACGAATTTTAAATTAATTATAAAAGTTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTTAGTGGTATTTTGTGGAGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTCGCAATGATGAGTGAATGT‑AATAAGC‑ACC‑G‑GGAAGT‑GATTAATTTGAC‑AGA‑GTTTGGCCT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAg < 1:551818/239‑1 (MQ=255) gaatccgcGAATTTTTAATTAGATAGTGCCGGTGAAAAAAAATAAAAAACCACTGTTGTAGTGGTGGTTTGGGGCGGGG‑AATTTTGCCAAACAAATA‑AAAAAACG‑GGTGTTGCTATGACGAGCAAAATT‑AAAAAAA‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTAGAC‑AAA‑GATTGTCGT‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTAGATAAACTAAAACAGCTAAAgg < 2:1112907/231‑1 (MQ=255) tGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGGG‑AAATTTTTCAGACAAATA‑AAAAAAAT‑GGAGTTGGCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAAC‑AAC‑A‑AGCAGG‑GAATAAATTGAC‑AGA‑AATTTTCGC‑TAACTTTAACGCCCTGATTTCTACCCCAAT‑GCCTGGTGACGTGGGGGGTAAACTAAAACAACTAAAGGGTG‑CCGAAAcgtc > 1:812328/1‑239 (MQ=255) ttaattaaATATTCACGGTGGAAAAAAATAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTaaaa < 1:1335734/214‑1 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATA‑CAAAAAAT‑GGAGTTTTCATGATGAGCGAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑A‑CGCAGG‑GAATAAATTGAC‑ACA‑GATTGTCGC‑CAACTTTACCGCCCTGATTTCTACCCCCAT‑GCCCGATGACGTGGTGGGGAAAACACAAAAGCTAAAGGGTA‑CCGgaaagcgg > 2:599508/1‑233 (MQ=255) ttAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCC‑AATTTTTTTAGAAAAAAG‑CAAAAAATCTGGTTTGGCAAG‑TGGATGTAAGG‑GAAAAAC‑AAG‑A‑GGCCGT‑GTATAAGTTATA‑AGT‑AATTGTCGG‑AAAGTTTTACACCATGATTTCTCCGCCCAA‑GCCTCATGACGTGGTGGTTAAACTAAAAAAACCAAACGATgggcaaacgccg > 2:1244826/1‑227 (MQ=255) aaTTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑GATTTTTTCTAACAAATA‑CAAAAAAT‑TGAGTTGCCATGATGAGGGAAAGA‑AATAAGA‑AAA‑A‑AGGAAT‑GAATAAAATTAA‑AGA‑GATTGGCGC‑CAACCTTACAGCCATGATTTTTACCCGAAT‑GCCTGATTACGGGGTGGGAAAACTAAAAAAACTAAAGGATG‑CCGaaaaactgtcg > 1:904245/1‑231 (MQ=255) aaTTAAATATACACGGTGGCAAAAAAAATAAACCCACATTTTTAGTGGTATTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGtcgtcg < 1:484347/239‑1 (MQ=255) tacaattacACGGGGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAG‑TTGGGGGGGTGAAATTTTTCCAGAAAAAAA‑CAAAAACG‑GGGGTGGCTTGGATGAGCGAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑G‑GGAAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GATGGTCGA‑TAATTTACCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATg < 2:592744/231‑1 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCATACAAAAA‑CAAAAAAA‑TGAGTTGCCATGGTGAGCGAAAAG‑AATAAAC‑AAC‑A‑AGAAGT‑GAAAAAATTGAA‑AGA‑GATTGTTGC‑TAAATTTACCGCCCTGATTTCTACCCGAAA‑TCCTGATGAAGTGGGGGATCAAAATAAACAGCTAAAGGAGT‑CCCAAAAATTGTCGGTgggg > 1:1352722/1‑239 (MQ=255) atatTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGACAAATA‑CAAAAACT‑TGAGGTGGCCTTATGGGCGGAAGA‑AATAAAC‑AAA‑A‑AGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TTACTTTACCGCCCTGATTTTTTCCCCGAT‑GCCTTATGACGTGGGGGGTAAAATAAAACAACTAAAGGAAGCCCGAAAC‑TCGTTGGTgggg > 1:358918/1‑239 (MQ=255) tatTCACGGTGGAAAAAAATAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTA‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGAAGT‑GAATAAGTGGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:1241603/239‑1 (MQ=255) tatTCACGGGGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:41850/239‑1 (MQ=255) tatTCACCGTGGAAAAAAATAGAAAACCAAATTTTAAGGGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGGTGCCATAAGGGGCAAAATT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTGGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑AAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 1:1084316/239‑1 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCCGACAAAAA‑CAAAAACA‑GGGGTTTCCATTGTGAGGGGAAGT‑AATAAAC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAAAAAATTGAC‑AAA‑GAATGTCGC‑TAACTTTACCCCCCTGATTTTTACCCCAAT‑TCCTGATTGAGGGGTGGGTAAACTAAAAAAACTCAAAGATT‑GCGAAACGTCCGCGATggggga > 1:1241603/1‑237 (MQ=255) atTCACGGTGGCAAAAAAAATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAAAA‑CAAAAACT‑GGATTGGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGaa < 1:294935/239‑1 (MQ=255) ttgaCGGTGGAAAAAAAAAAAAACCCAAATTATTATTGGTGATTGGTGGCGGAT‑AATTTTTCAAAACAAAAA‑AAAAAACT‑GGAGTGCCGATGATGAAAGAAATT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑TAATAAGTTGAC‑GGA‑GCTTGTCGA‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGa < 2:686643/234‑1 (MQ=255) aCGGTGGAAAAAAATATAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGGGGTG‑AATTTTTCAAGAAAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 2:812328/239‑1 (MQ=255) aCGGTGACAAAAAAGATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTACAAGAAAAAGA‑GAAAAACT‑GGGGGTGCTATGAGGGGGTAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGAAGG‑GAAAAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTCCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAAtt < 1:1244826/239‑1 (MQ=255) ggTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGCG‑AATTTTTCCAAAAAAAAA‑AAAAAAAA‑TGGGGTGTCATTATGAGCGGAAAG‑AAAAAAA‑AAA‑A‑AACAAT‑GAAAAAATTGAC‑AGA‑GAATGTCGC‑TCACATTTTCACCCTAATTTCTACCCCAAA‑GCCCGATGAGCGGGGGGTTAAAATCAAAAAAATAAACGATG‑CCGAAACGTCGCCGATGGGGAAAAatat > 2:1182401/1‑239 (MQ=255) ttGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTAAGTGGTATTTTTGGGCGGTG‑AATTTTACCAGACAAAAA‑CAAAAACT‑GGGGTTTCGTTGAGGAGCAAAAGT‑AATAACC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GTTGGTGGC‑TAACTTTGCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:1128489/237‑1 (MQ=255) gTGGAAAAAAATAAAAACCCAAATTTTAAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGAAAAAAA‑CAAAAACG‑GGAGTGGCCATGATGAGCAAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGAATT‑AAATAAGTAGAC‑AGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTAt < 1:638215/238‑1 (MQ=255) tGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AAATTTTTCAGACAAAAA‑AAAAAAAA‑GGGGGTGCCATGGTGGGGGGAAGG‑AAAAAAA‑AAC‑A‑AGCAGG‑GAATAAGTTGTA‑AGA‑GAATTTTGC‑TAAATTTTACCCCATCATTTTTTCCCCAATAGCCTG‑TGATGGGGGGGGTAAAATAAAACAACCAAAAGATG‑GCGCAACAGCGTCGGTGGGGGAAAatatta > 2:1330359/1‑237 (MQ=255) aaaaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAAAAAAATA‑CAAAAACT‑GGATTGGCCATTATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATa < 1:372883/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGAAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:731558/239‑1 (MQ=255) aaTATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTCCCAAACAAATA‑AAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATGAGCGAAAGA‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:36974/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑ATTTTTCCCAGACAAAAA‑AAAAAACG‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCGGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GTTTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1352722/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAACCCAAATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGGGGTA‑AATTTTCCCAGACAAATA‑AAAAAACG‑GGAGTGGCAATGATGAGAGAAATT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 2:1291049/239‑1 (MQ=255) aaTAAAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGGGGCGGTA‑AATTTTCCCAGAAAAATA‑CAAAAACG‑GGAGTTGCCATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑G‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACg < 1:68787/239‑1 (MQ=255) tataAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑Aga‑ga < 1:1393126/121‑1 (MQ=255) acaTTTTTATTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑AAAAAACT‑GGAGTTGCAATGATGAGGGAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAGGTTAAG‑AGA‑GATTGTCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:1174881/239‑1 (MQ=255) aaaTTTTGAGTGGTAGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAATA‑AAAAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGacaa < 1:487715/237‑1 (MQ=255) caTTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTTCAGAAAAAAA‑CAAAAAAA‑GGAGGTGCCATGATGGGCGAAAGT‑AATAAAC‑AAC‑A‑GGCAGA‑GAAAAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTGGC‑Taa > 2:1393126/1‑121 (MQ=255) aattggtgGCGGTA‑AATTTTTCAGGCAAAACA‑AAAAAACT‑GGATTTCCCATGATGAGCCAAAGT‑AATAAGC‑ACC‑A‑GGCGGT‑GAATAAGTGGAC‑AGT‑GTTGCTCGC‑TATCTTTGCCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGTCGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:758974/234‑1 (MQ=255) aGTTTGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AAAAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:76146/239‑1 (MQ=255) gTTTGTGGGGGGA‑AATTTTTCCAGAAAAATA‑CAAAACCT‑GAAGTTGCCAGAATGGGCGAAAAT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGAAGT‑GAATAAGTGGAC‑AGG‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 1:1182401/238‑1 (MQ=255) gTTGGTGGCGGTA‑AATTTTTCAAGAAAAATA‑AAAAAACT‑GGAGTGGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAATC‑AAC‑A‑GGCGGT‑AAATAAGTTGAA‑AGA‑GTTTGTCGT‑TACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGa < 2:821929/238‑1 (MQ=255) tgtgGGGGTA‑AATTTTCCAAAAAAAATA‑AAAAAATG‑GGAGTTGCCATGAAGAGCGAAATA‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCGGT‑AAATAAGTTGAA‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGa < 2:1067518/239‑1 (MQ=255) tttCCAAACAAATA‑AAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGAGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGAAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:1379660/239‑1 (MQ=255) tttCCAAAAAAAAA‑AAAAAACT‑GGATGTGCAATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAATGTGAA‑AGA‑GATTGTCGC‑AAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:975011/239‑1 (MQ=255) ttacaaGAAAAAGA‑CAAAATCG‑GGAGTTGCCAGGATGAACGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAAAAAGTTGAC‑GGA‑GATTGTGGT‑TATCTTAACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTcctg < 1:297075/234‑1 (MQ=255) aaaaaaa‑caaaaacT‑GGAGTTGCCATGATGGGCGAAAGA‑AAAAAGC‑AAC‑G‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 1:38975/237‑1 (MQ=255) aaaaaTA‑CAAAAACT‑GACTTTCCCATGATGAGCGAAAGA‑AAAAAGC‑AAC‑A‑GG‑AGTGGAATAAGTT‑AC‑AGAGGATTTCCGC‑TATTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCa < 2:1131393/237‑1 (MQ=255) aaTA‑AAAAAAGT‑AGATTTGACATGAGGAGCAAAAGT‑AATAAGC‑AAA‑A‑GGCAAT‑AAATGAGGGGAC‑AGA‑GAGGGATTC‑TAACTGTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCAGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGAGGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCGGAATCGTCCTGCCTGTCAGGa < 2:689243/239‑1 (MQ=255) aaaaaaaCG‑GGAGTTGCCATGTGGAGAAAAAGT‑AATAAGA‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTGGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGacac < 2:716197/237‑1 (MQ=255) acactgggAGTTGCGATAATGACGAAAAGA‑AATAGTC‑ACC‑T‑GGAATT‑AAATAGGTGGAC‑AGA‑GTTTGTCGC‑TACTTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgg < 2:1096056/233‑1 (MQ=255) aaCT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAATTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCgggg < 1:567100/239‑1 (MQ=255) gAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACAGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCCGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATCCAACAAGCGATTGACCTGAATACTCCTGCCTGTCAGGACACCTGGGAGAta > 2:767572/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc < 1:752411/80‑1 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTc > 2:752411/1‑80 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:100135/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 1:1068313/1‑238 (MQ=255) gCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGAGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGt > 2:228097/1‑238 (MQ=255) ccATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCg > 1:108414/1‑225 (MQ=255) aaGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑AAATAAGTTGAC‑AGA‑GTTTGTCTC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGt < 2:36186/237‑1 (MQ=255) c‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTcc > 2:5762/1‑238 (MQ=255) c‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGAAGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGAAGGGGAAAATGATCTACCATACTATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCATCCTGCCTGACAGTACACCGCGGAGACTATGTTCTTCGTTAAAGTCGATTCCCACTTccc > 1:1386537/1‑239 (MQ=255) tAAGTGGAC‑AAA‑GTTTTCCGT‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCg < 1:1029312/239‑1 (MQ=255) aaaGTTGAA‑AAA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGAATTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCg < 1:599508/238‑1 (MQ=255) atgggAC‑AGA‑AGTTGTCCA‑TATCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAg < 2:903456/235‑1 (MQ=255) gAC‑AGA‑GATTGTCTC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc < 1:1019896/239‑1 (MQ=255) gAC‑AGA‑GATTGTCGT‑TATCTTTACCGGCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGc < 2:750589/239‑1 (MQ=255) gAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TACCTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa < 1:375757/43‑1 (MQ=255) gAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGa > 2:375757/1‑43 (MQ=255) | GCAGTTGTGATAAGCGCAGTGTATTTCGCAAAACATTGCCATTCCCTGCTCTGGCGCAATATTCATTCTTATTTTCGCGTTGATTCACGAACTGTTAATTACATATTCACGGTGGCAAAAAATATAAAACCACATTTTTAGTGGTAGTTTGTGGCGGTG‑AATTTTTCCAGACAAATA‑CAAAAACT‑GGAGTTGCCATGATGAGCGAAAGT‑AATAAGC‑AAC‑A‑GGCAGT‑GAATAAGTTGAC‑AGA‑GATTGTCGC‑TAACTTTACCGCCATGATTTCTACCCGAAT‑GCCTGATGACGTGGTGGATAAACTAAAACAGCTAAAGGATG‑CCGAAACGTCGTCGATGGGGAAAATTATCTACCATACGATGTTCGACAACATGCAAAAAGCGATTGACCTGAATCGTCCTGCCTGTCAGGACACCGGGGAGATTATGTTCTTCGTTAAAGTCGGTTCCCGCTTCCCACTGCTTGGCGAGCTGC > NC_000913/3206269‑3206742 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |