| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2240541 | 149 (0.950) | 3 (0.020) | 3/426 | NT | 2.0% | intergenic (‑193/+87) | mglB/galS | methyl‑galactoside transporter subunit/galactose‑ and fucose‑inducible galactose regulon transcriptional isorepressor; mgl operon transcriptional repressor; autorepressor |
| ? | NC_000913 | = 2240546 | 147 (0.950) | intergenic (‑198/+82) | mglB/galS | methyl‑galactoside transporter subunit/galactose‑ and fucose‑inducible galactose regulon transcriptional isorepressor; mgl operon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCATAGCTATCACATTGTTAAGATACTGTGAAATCACTCACAGATTGAAAGCGGTTACATCGCCTGATTTGTTGAGTTAGTGATCGCCGCCGCATTCTGGCGTGTTGCGACAGAATGGCGACGCACTAACGTCGGCATAAAACAGTGGCTGGCACGAGGATCAATATTGCCTGCTGCCCCCTGCAAGGCCAGTTCGGTGGCTAATTTC > NC_000913/2240309‑2240781 | tGGCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACAt < 2:221477/238‑1 (MQ=255) gCCATCACAGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACg > 2:657642/1‑239 (MQ=255) cacaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTACGGTTTTTCTTATGAAGGGTAGTGCCTGAGATAACTGCTCGGCGGGGCAGGAGAGCTAAGGGAGTGTTTCTCAGCGCCGGAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACTCTCCCGAAAACGGCTTTAATTTGTTTTATGTCGCTGTTACCTCGGCAAAACGGAGTGCTCACTGTTGCATTCggggt > 2:1466341/1‑236 (MQ=255) acaGCAGTTAGGGTTAGCACCTGATTATTCATGGTATCTTCTGTTTTTCTTATGCACGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCTTCGGGTCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTTACGTTTTAAATATCGTTCTTTCATGCACGGTAACGCTCCAGAAATCGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTCCCTCGGGAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 2:636389/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 1:236302/239‑1 (MQ=255) acaGCAGACAGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTAc < 1:1731961/239‑1 (MQ=255) aGGGTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaaa > 1:383118/1‑239 (MQ=255) gTTAACTCCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaaaa < 2:1043889/237‑1 (MQ=255) gTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTaaaa < 2:306270/237‑1 (MQ=255) gTTAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACg > 2:451129/1‑239 (MQ=255) tAACACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACgg < 2:1575852/238‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 2:1032521/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 1:493901/239‑1 (MQ=255) aaCACCTTCTTATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTg < 2:1536701/239‑1 (MQ=255) cttcttATTCAGGGTATCTCCTGTTTTTATTATGCAGGGTAGTGTTTGAGATGAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGATCTCTTTCTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAACTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTGCAACGTTAAATCGGTGCAATc < 2:546214/239‑1 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACaa < 1:896141/220‑1 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACaa > 2:896141/1‑220 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCa > 2:351461/1‑239 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTACATACGGGTTACAACGTTAAAACGGTGCAATCa > 1:651353/1‑239 (MQ=255) ttcttATTCATGGTATCTCCGGTTTTTCTTATGCAGGGTAGTGCTTGAGATAAATGCTCGGCGGGGCAGTAGAGTTAATGAAGTGTTACTGAACGCCGAAGCTCACTTTTTAAAATTCGTTCTTCCATGCCCGGTAACGCTCCAGAAAACGGCTTTAATTGTTGTTATGACGCTGTTACCTCGGCAAAAGTGATTATTCACTGTTAAATACGGGTTACCACGTTAAAACGGTGCAAt > 2:1697389/1‑237 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |