| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3176791 = | 82 (1.340) | 4 (0.070) | 4/270 | 8.4 | 4.9% | coding (43/828 nt) | cpdA | 3',5' cAMP phosphodiesterase |
| ? | NC_000913 | 3176812 = | 78 (1.340) | coding (22/828 nt) | cpdA | 3',5' cAMP phosphodiesterase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GTGCTGGTGTGGCCGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGC > NC_000913/3176672‑3176954 | gggCTGGTGTGGGTGATTCGCCGCCAGCACCGCGTTGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGaa < 2:1089501/141‑1 (MQ=255)gTGCTGGTGTCGCCGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTACCTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACATGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGaa < 1:333659/143‑1 (MQ=255) ggTGTGGCCGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGtt < 1:702149/143‑1 (MQ=255) tgGCCGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACa > 1:407323/1‑143 (MQ=255) tgGCCGAATCACCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTATAAAATCCTGAATCTGCCCTCACCAGCCAGAGGAAGAGTTAACa > 1:426724/1‑143 (MQ=255) ccGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGAGTCGGTAATTTGTAAAATCATGACTCTGGTCTCACCAGCCAGAGGAAGGATTaaacgga > 2:525134/1‑138 (MQ=255) gagtCGCGTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCGAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTT‑ATGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCttt < 2:494392/140‑1 (MQ=255) ccTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCaaa > 1:243962/1‑143 (MQ=255) ccTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTCTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCaaa < 1:641759/143‑1 (MQ=255) tCCAGCACGGCCCGGTAACTCTCCCAGTTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATg < 2:892220/143‑1 (MQ=255) tCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCACATg > 1:437087/1‑143 (MQ=255) tCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCACAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATg > 2:244851/1‑143 (MQ=255) tCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAACTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAAGAAGGGATAACCGGCCTTCCAAATg > 2:984606/1‑143 (MQ=255) ccAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTCTGCACACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAGGGGTTTACATGCTTTCCAAATgg > 2:719638/1‑143 (MQ=255) catcACCGCCTGGTAACTCGCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAAACCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGgt < 1:982566/140‑1 (MQ=255) cAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAACATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGCAGGGTTCACAGGCCTTCCCAATGgt > 1:184258/1‑143 (MQ=255) cAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGCGTCGGTAATTTGTCAAATCCTGCCTCAGGCCACACCAGCCGGAGGCAGGGTTAACAGGCTTTCCAACTGgt > 2:961090/1‑143 (MQ=255) gCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCGTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGACTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACACGCTCTCCAAGTGctgt > 2:320630/1‑143 (MQ=255) cGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCtt > 1:1104001/1‑143 (MQ=255) cTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGGCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCCAATGGTGTCCTTTgg > 1:547904/1‑143 (MQ=255) cTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGAGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAgg > 1:773467/1‑143 (MQ=255) tGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGATTCGAGCATTTGTGCAAACAGGTGTGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACGAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAggg > 1:305866/1‑142 (MQ=255) ggTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAACTGGTGTCCTTAGGtt > 2:249345/1‑143 (MQ=255) ctctCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCCTTCCAAATCGTGTCCTTAGGTTTCacg > 1:151120/1‑143 (MQ=255) tctcCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCacga > 1:709320/1‑143 (MQ=255) tctcCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCacga > 1:797850/1‑143 (MQ=255) tctcCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCGTTCCAAATGGTGTCCTACGGTTTCacga > 2:187298/1‑143 (MQ=255) tcCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCacgacg > 1:786547/1‑143 (MQ=255) cccAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGc < 1:518693/143‑1 (MQ=255) aGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCGGACTCTGGCCCCCCCCGCCAGAGGCAGGGTTCACAGGCGTTCCAAATGATGACCTACGGATTAACAACGcaac > 1:731437/1‑140 (MQ=255) tttACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAAc < 2:516976/143‑1 (MQ=255) tACCCCTAGCTGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCg < 2:800194/143‑1 (MQ=255) tACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCg < 2:243962/143‑1 (MQ=255) ccccTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAACGGTTAACAGCCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGCCGCTCATACACCgca > 1:578347/1‑141 (MQ=255) cccTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTGTGGCCTCTCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACCGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGTATTCACGACGCTAATAAAAAGGaa > 1:156748/1‑143 (MQ=255) cccTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCggca > 2:759816/1‑141 (MQ=255) cccTAACAGGGCTTCGTGCTGGTGTGCAAACAGGTGAGAGTCGGTGATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTAAGGTTTGACGACGCGAAGAAACCGGaa > 2:613735/1‑143 (MQ=255) ttAACAGGGCTTCGTGCTGGTGTGCAAACAGGGGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATc < 1:830770/142‑1 (MQ=255) gaaCAGGGCTTCGGTCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCg < 2:943779/142‑1 (MQ=255) aGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGACTCACCAACCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTGAACGACGCTTATAAACGGGGATTGACAt > 2:830226/1‑143 (MQ=255) ggCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTGATGTGTAAAATCCTGTCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCg < 2:1100263/143‑1 (MQ=255) cTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTCAAATCCTGCCTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGACGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGTTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAGTAGCCAgcgcc > 1:489121/1‑142 (MQ=255) ttCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTc < 2:709320/143‑1 (MQ=255) tCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTGAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTcc > 2:271189/1‑143 (MQ=255) tGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCAtg > 1:564999/1‑143 (MQ=255) ttttGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGc > 2:524714/1‑143 (MQ=255) tgttGGGCAAGGAGGTGCGGGTAGGGAAGTTGGAACATCCTGAGGCTGGCCTCAGCGGCCAGGGGAAGGGCGAACAGGCGGTCCACGTGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGc < 2:73134/141‑1 (MQ=255) gtgtaggCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGc < 1:981485/137‑1 (MQ=255) ttgacaaCAGGTGAGTGTCGGTAAGTTGTACACGCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTCTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTaaa < 2:530645/138‑1 (MQ=255) tgCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGCAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAAc > 2:574823/1‑143 (MQ=255) tgCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTTCTAAAc > 1:403876/1‑143 (MQ=255) gCAAAGAGGTGAGTGTCGGTAGTTTGTAAGAGCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACa < 2:1106039/143‑1 (MQ=255) aaaCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACGGGGAGCGCCATGGCTCCATGTGCTAAACAGt > 1:861697/1‑143 (MQ=255) aaCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTa > 2:825145/1‑143 (MQ=255) aaCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTa > 1:516139/1‑143 (MQ=255) aCAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTAt > 1:286199/1‑143 (MQ=255) tGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACTAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATTGCCATCGCTCGATGTGCTAAATAGTATCGCaa > 1:971797/1‑143 (MQ=255) taGTGTCGGTAATTTGTAAAAGCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc < 1:729978/142‑1 (MQ=255) gcgtgtCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTGTGGCCTAACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc < 2:426724/141‑1 (MQ=255) gAGTGTCGGTAATTTGGAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAAc < 2:657923/143‑1 (MQ=255) ggcGGTAATCGGCAAAATCCCGACTCTGGCCTCACCAGCCAGGGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGt < 1:490152/141‑1 (MQ=255) tCGGTAAGTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTc < 2:1095477/143‑1 (MQ=255) aaTTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCACGTGCTACACCGTATCGCAACCAGTACGATa > 1:337848/1‑143 (MQ=255) tttGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAACCGGAGGCTCAACCAGCCCGccaca > 2:1019498/1‑139 (MQ=255) ttGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTCGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTCAACAGTATCGCCACCAGTCCGCTaaaa > 1:1040048/1‑143 (MQ=255) ttGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaa > 1:235641/1‑143 (MQ=255) tGTAAAACCCTGACTCTGGCCTCACAAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTaaaaa < 1:1049127/143‑1 (MQ=255) tAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGCGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACt > 1:48227/1‑143 (MQ=255) aaaTCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAGCAGGATTTCCCAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCAACCTGTGATAAAAAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGa < 2:188237/143‑1 (MQ=255) cTGACTCTGTGCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTACATGTGATTCACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAAt < 2:392290/143‑1 (MQ=255) cTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAAt < 2:797850/143‑1 (MQ=255) tGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGGCCGCTAACAACTGATTAAtt > 1:63753/1‑143 (MQ=255) ctGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATg > 1:229026/1‑143 (MQ=255) tGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAACCAGTATCGCAACCAGTCTGCTAAAAAATGATTAATTTAATGc > 1:638406/1‑143 (MQ=255) tCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGACTAATTTGATGCTCTtc > 2:693533/1‑143 (MQ=255) aCCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTtcgt > 1:277209/1‑143 (MQ=255) ccagccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTtcgtc < 2:403876/143‑1 (MQ=255) cagccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTACACAGTATCGCAACCCGTCCGCTAGTACCTGATTAAATAGATGATTTtcgacg > 1:709444/1‑143 (MQ=255) gccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACCGTATCGCAACCAGTCAGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCGTTTCGGcgcg > 1:723630/1‑143 (MQ=255) ccagAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCACATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGt < 2:407323/143‑1 (MQ=255) gAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGAATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGc > 1:531602/1‑143 (MQ=255) | GTGCTGGTGTGGCCGAATCGCCTCCAGCACCGCCTGGTAACTCTCCCAGGTGTTTACCCCTAACAGGGCTTCGTGCTTTTGTGCAAACAGGTGAGTGTCGGTAATTTGTAAAATCCTGACTCTGGCCTCACCAGCCAGAGGAAGGGTTAACAGGCTTTCCAAATGGTGTCCTTAGGTTTCACGACGCTAATAAACCGGAATCGCCATCGCTCCATGTGCTAAACAGTATCGCAACCAGTCCGCTAAAAACTGATTAATTTGATGCTTTTCGTCGCGTTGATGC > NC_000913/3176672‑3176954 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |