| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,536,312 | Δ1 bp :: IS186 (+) +6 bp :: Δ1 bp | coding (479‑484/510 nt) | crr → | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2514274 = | NA (NA) | 63 (1.010) | 55/278 | 0.1 | 100% | noncoding (2/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 2536317 | 0 (0.000) | coding (484/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2515616 | NA (NA) | 65 (1.030) | 51/280 | 0.2 | 100% | noncoding (1344/1345 nt) | IS186 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 2536312 = | 0 (0.000) | coding (479/510 nt) | crr | glucose‑specific enzyme IIA component of PTS | |||||
GAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTC > NC_000913/2515477‑2515757 | ggtcTTACATGTGCCCATTCGTGGGCCAGTCTCCCTGACCGTCTACAAAACGCAATCGAAGAACGCGAGGCATCGCTCTAACCAGGCACCGAGGCGTCGCATGCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATa < 2:31288/140‑1 (MQ=11)gcgCTTACAGGTGGCCTTGCGTGGCACAGTCTCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATa < 2:181362/141‑1 (MQ=255) aGCGTACAGGTGGGCATCCGTGGGACAGTAGCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATaa < 1:621559/143‑1 (MQ=9) gTGGGAGATTATCCCTGACAGCGTACAAAACGCAATTGAATAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc < 2:707963/143‑1 (MQ=255) gTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGc < 1:722812/143‑1 (MQ=255) gggACAGTATCCCTGACAGCCTAGAAGGCGCGATTGAAGCACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCATCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTGAGTTAGCGCTTATGTGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCt < 2:139778/143‑1 (MQ=14) gACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGCTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTGTTTTTACGCCTGt > 2:263545/1‑143 (MQ=255) cacacTATCCCTGACAGCCTACAAACCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTACGCCTGtt < 1:1013858/142‑1 (MQ=255) aGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTaa < 2:383471/143‑1 (MQ=255) aGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTaa > 2:383797/1‑143 (MQ=255) tATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCGAATTCACCGGTTTTTTTCCGCCTGGTGATc > 2:679063/1‑143 (MQ=14) ccggACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCt < 2:590925/140‑1 (MQ=255) cTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTGTTACGCCTGTTAATCAGCTa > 1:383627/1‑143 (MQ=255) gACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTCTTTTACCCCTGTTAATCAGCTAAt > 2:239392/1‑143 (MQ=255) gACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCGTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTCACGCCTGTTAATCAGCTAAt < 1:218388/143‑1 (MQ=255) ctcgtcaCAAAACGCTCTTGAAGAACGCGTGTCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTTAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg < 2:389506/137‑1 (MQ=18) aGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTCCGCCTGTTAATCAGCTAATGGc > 1:487579/1‑143 (MQ=255) ccTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCATCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg > 1:1099208/1‑143 (MQ=255) cTACAAAACGCAATTGAATAACGCGAGCCATCATATCATTGAGTTACCGATGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc < 2:505581/143‑1 (MQ=18) cTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTGTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGc > 1:1146417/1‑143 (MQ=255) agagagcGCAGTTGGAGGACGTGATGCGTCGTCGGAACGAGGCAGCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCGTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTGTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg < 2:181588/137‑1 (MQ=18) aCAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg > 1:514925/1‑143 (MQ=255) agcGCAATGGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCTGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa < 2:569884/141‑1 (MQ=255) aaCGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTACTTGCTGCGGGCGa > 2:1135689/1‑143 (MQ=255) cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTCAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTCTTTTTACGCCTGCGCATCAGCTAATACCTGCTGGCGAcc > 2:661648/1‑143 (MQ=17) aTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCCTACTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTGTTTTACGCCTGTTAATCAGCTCATGGCTGCGTGCGACCaagc > 1:486974/1‑141 (MQ=18) aTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATc > 1:675029/1‑143 (MQ=255) aTTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATc > 1:987940/1‑143 (MQ=255) aaCGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAcc < 1:1117258/143‑1 (MQ=255) ctcgAGGCATCGTCTTAACGTGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTGATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCt < 2:278484/141‑1 (MQ=255) cgcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCGCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCt > 1:697886/1‑143 (MQ=255) gcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCtt > 1:413419/1‑143 (MQ=255) gcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCtt > 1:1021879/1‑143 (MQ=255) gcgAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCACTTATGGGATAATTCCCCGGTTCTTTTACGCCTGTTAATCAGCTACTGGCGGCGGGCGACCAATCAATAACCCtt > 2:606756/1‑143 (MQ=21) aGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAATTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTACTCAGCTCATGGCTGCGGGCGCCCAGTCACATACCCTTGCa > 2:570881/1‑143 (MQ=21) cATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGat > 1:815184/1‑143 (MQ=255) tCGTCTTAATGAGGTACCGACGCGTCGCATTCTTCACATGGTTCGAACCTTAATTTTTCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTCAATCCTCTTAATCAGCTAATCGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTTCAGatat < 2:996993/143‑1 (MQ=255) cggcgtAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATACCTCCCCGGGTTTTTTACGTCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGTCCAAGCAAATACCCTTGCAGATAtt < 1:107170/138‑1 (MQ=21) cGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTACTGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACACTTGCAGatata > 2:677945/1‑142 (MQ=255) tCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCGGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGc > 2:196367/1‑143 (MQ=255) aaCGAGGCCCCGAGTCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCATCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCAccc < 2:914640/143‑1 (MQ=255) cgcggCACCGTGGCGGCGCATTCTTGAGATGGTTCAACCCTTGAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGGTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCg < 2:1014771/140‑1 (MQ=255) gAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAAACCTTAAGTTAGAGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAACTACCCTTGCAGATATTGCCCCCCgc > 1:319094/1‑142 (MQ=255) aCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATCCCCTTCCAGATATTGCCCCCCGAGCTTa > 2:46717/1‑143 (MQ=255) cGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCTGCCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg < 2:193066/143‑1 (MQ=255) cGAGGCGGCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGGGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATg < 1:1065002/143‑1 (MQ=255) gCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCCCCCCGAACTCATGCact > 2:154148/1‑141 (MQ=255) cgccGCATTCTTCCAATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTCATGGGATCATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTCTTGAGCCGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCATGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATa < 2:347070/140‑1 (MQ=37) tCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAgc < 1:196367/143‑1 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGcc < 2:413419/143‑1 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGcc > 1:694314/1‑143 (MQ=255) cATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGcc < 2:1021879/143‑1 (MQ=255) ttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctg > 1:1128375/1‑143 (MQ=255) ttcAGATGGCTCAACCCTTGAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctg < 2:631867/143‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGGTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCACTCAAATACCCTTGCCGATATTGCACCCCGCGCTTATGCAATAGCGCctggtgc > 2:135722/1‑143 (MQ=39) aGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCctgctgctg > 1:435063/1‑143 (MQ=255) aTGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGtt < 2:147348/143‑1 (MQ=255) ggTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATAACCTTGTAGATATTGCACCCCGCGCTTATGCAATAGCGCCtgttgctgttgc > 2:115414/1‑143 (MQ=255) ttCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGCTAATTCCCCGGTTTTTTTCCGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCACTAGCGCCTGCTGCTGTTGCGt > 1:57918/1‑143 (MQ=255) cAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGtct < 1:678367/143‑1 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCAGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATAAAATACCCTTGCAGATCTTGGACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCGGCTGCTGTTGGGtctc > 1:244517/1‑143 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGTTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCg < 1:424072/143‑1 (MQ=255) ccTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGAc > 1:57385/1‑143 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCACTCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCGCGAGCTTATGCAATTGCGCCTGCTGCTGTTGTGtctggcca > 2:1061476/1‑138 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAACTAATGGCTGCGCGCGACCACTCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGGCTCGACa > 1:660561/1‑143 (MQ=255) aaGTAAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAAc < 1:862573/143‑1 (MQ=255) ttAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTcc > 2:117685/1‑143 (MQ=255) aGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGCTATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCcgc < 1:1027808/143‑1 (MQ=255) cgcTTATGGGATACTTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGAGATTGCACCCCGTGCTTAAGCAATATCTCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGa < 1:790581/143‑1 (MQ=255) ggggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAAGCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCacac < 2:343784/142‑1 (MQ=255) gggATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACt < 2:675029/143‑1 (MQ=255) ggATATTTCACCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTc < 1:710782/143‑1 (MQ=255) | GAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTC > NC_000913/2515477‑2515757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |