| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3382372 | 108 (1.020) | 4 (0.040) | 4/424 | NT | 3.6% | coding (173/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | NC_000913 | 3382376 = | 107 (1.030) | coding (177/1068 nt) | degS | serine endoprotease, periplasmic | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGACTCTCTAACCGATCTGGCGGTACTTAAAATTAATGCCACTGGCGGT > NC_000913/3382139‑3382610 | gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTa < 2:380122/239‑1 (MQ=255)gtgATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTGCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGTTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGttg < 2:154680/239‑2 (MQ=255) gATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAAc > 1:23953/1‑239 (MQ=255) ccGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCAGCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTa < 2:1042666/239‑1 (MQ=255) gTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGtt > 1:256241/1‑239 (MQ=255) ctgcCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCa > 1:636770/1‑237 (MQ=255) ctgcCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCa > 2:1060227/1‑237 (MQ=255) ctgcCGTTCCCTTGTTTAATGGCGCCTCCATCATGTTTGTGAGGCTCTTACGTCCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGTCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCaa < 2:182149/238‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTTAATGACTCCTCCATCGTGTTTGTGAAGCTCTTACGGTCCGTTGCGATTGGAGTAATTGTCGGGGCTAATCGTCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTGACCCGCTTTCCACTCCGCAGTTTGACAGTACCGAGGAAACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGACGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAActct < 2:64597/238‑1 (MQ=255) cGTTCCCTTTTTTAATGACGTCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGATCACCAActct < 1:319162/238‑1 (MQ=255) 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cgcaatttgacagtaccgatgagacgcctgccagctataatctggcggttcgccgcgccgcgccagcgggtTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCTTGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGa > 1:66770‑M2/72‑239 (MQ=255) cgatttgactgtaccgaaaggtcgcctgcctgctatagtcttgcgtatcgccgcgccgcgccagcggttTAACGTTTACAACCGGAGTTTGAACACCATCTCTCACAACCAGCTTGAGATTCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATTGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAg < 2:66770‑M2/170‑1 (MQ=255) aTTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAg < 1:265965/239‑1 (MQ=255) tACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGtt < 2:631282/152‑1 (MQ=255) tACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGtt > 1:631282/1‑152 (MQ=255) aCCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCtggt < 2:1165643/239‑1 (MQ=255) aCCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCtgg < 1:824477/238‑1 (MQ=255) ccGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCtggtg > 2:431524/1‑239 (MQ=255) 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1:1158943/238‑1 (MQ=255) aCGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTg > 1:637341/1‑238 (MQ=255) cgtcagacAGCTATTATCCGGCGGTTCGCCGCGGCGCGCCAGCGGTGGTTAACGGTTTCAACCGTGGGTTGAACACCAACTCACACCACCAGCCTGAGATCCGCAGCCTTGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGGGGTTATATCATCACCAATAAACACGGCATCAACGACGACGATCAGATCATCGTCGCCTTAAAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGa < 2:34123/231‑1 (MQ=255) cGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGa < 2:635829/238‑1 (MQ=255) cGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGa < 1:1081883/238‑1 (MQ=255) gCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCt > 1:1061391/1‑235 (MQ=255) gCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCt < 2:1061391/235‑1 (MQ=255) 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gtTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGACTCTCTAACCGATCTGGCGGTACTTAAAATTAATGCCACTGGCGGt > 2:423148‑M2/3‑237 (MQ=255) | GTGATGTCCGGTTAACTCGTGGTATGCTGCTGCCGTTCCCTTTTTTAATGACGCCTCCATCATGTTTGTGAAGCTCTTACGTTCCGTTGCGATTGGATTAATTGTCGGCGCTATTCTGCTGGTTGCCATGCCTTCGCTGCGCAGCCTTAACCCGCTTTCCACTCCGCAATTTGACAGTACCGATGAGACGCCTGCCAGCTATAATCTGGCGGTTCGCCGCGCCGCGCCAGCGGTGGTTAACGTTTACAACCGTGGTTTGAACACCAACTCTCACAACCAGCTTGAGATCCGCACCCTGGGATCCGGTGTAATCATGGATCAACGCGGTTATATCATCACCAATAAACACGTCATCAACGACGCCGATCAGATCATCGTCGCCTTACAGGATGGACGTGTATTTGAAGCATTGCTGGTGGGATCTGACTCTCTAACCGATCTGGCGGTACTTAAAATTAATGCCACTGGCGGT > NC_000913/3382139‑3382610 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |