| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 3992760 | 42 (0.770) | coding (1608/2547 nt) | cyaA | adenylate cyclase | |||||
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845389‑3845673 | taaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctg < 1:1064205‑M1/1‑1 (MQ=255)cATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAg > 1:523513/1‑143 (MQ=255) cacccggtggcgtgggcatgctttaacggcctgttgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGc > 2:361744‑M1/142‑143 (MQ=255) aaactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGc < 1:699584‑M1/2‑1 (MQ=255) aactggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtaaattaaaggtaacagcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccattgcccgctgcgcttacctGCa < 1:180904‑M1/3‑1 (MQ=255) cgtatTGCGGTGATCGGGCGGAGTGGCGAGGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCATGTGATTCAGGATGGCGGCGGCCTGTGTGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCAc < 1:944592/141‑1 (MQ=255) actggtggcgtgggcatggtgtaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaaggtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggagatggtcgccgacgtgtcgcaccatttcccgctgcgcttacctGCAc > 1:959436‑M1/140‑143 (MQ=255) ttgttGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCGGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCAcc < 1:83122/140‑1 (MQ=255) tggtggcgtgggcatggtttaacggcctgctgacctcgcgcacccgtttgtatattaaacgtaacggcattgtcgatttgcctaagttgcaggcgatggtcgccgacgtgtcgcaccctttccccctgcgcttccctGCGCCg < 2:662571‑M1/6‑1 (MQ=255) 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ttcccgctgcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAAGAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCGCGTGAATGCGGTCCGGTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTATCTTTCTCTGTCAGTGgtccgc < 1:75074‑M1/125‑3 (MQ=255) ccATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTTAATGCGGCCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATcccc > 1:10248/1‑143 (MQ=255) ggcgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaa > 1:669829‑M1/12‑143 (MQ=255) gggCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGACCCTTATTCGTATGGGGTTTCTTTCGCGGCCAGTGATCCCCCCGCTaca > 1:662913/1‑141 (MQ=255) cgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGCCGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTaaaa > 1:153181‑M1/10‑143 (MQ=255) cgcttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGGTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCGCCGCGCTaaaa < 1:960204‑M1/134‑1 (MQ=255) ttacctGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGCTGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTa < 1:1007817‑M1/137‑1 (MQ=255) ttcctGGACCGGCGCGGCGCAGTCGCTGGGGGCACACATTGACGCCTTGACAGCCGCCGCCCGTGGATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTaa > 2:180904‑M1/6‑143 (MQ=255) acgaGCCCCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAAc < 1:439113/141‑1 (MQ=255) ctGCACCGAAACGGCGCAGTCGCTGGCGGAAAAAATTGCCGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCa > 1:2383‑M1/3‑143 (MQ=255) GCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTAGTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGGTCGGCGCGCTAAAACTAACCagg < 1:225437‑M1/143‑2 (MQ=255) | CATAATATTGTGGTGATCGGTCGCAGTGCCGAAGAGATGGCGCTGGCGGTCAATCAGGTGATTCAGGATGGCGGCGGGCTGTGCGTGGTACGTAACGGCCAGGTACAAAGTCATCTGCCGTTACCCATTGCCGGGCTGATGAGCACCGACACGGCGCAGTCGCTGGCGGAACAAATTGACGCCTTGAAAGCCGCCGCCCGTGAATGCGGTCCGTTACCCGATGAGCCGTTTATTCAGATGGCGTTTCTTTCTCTGCCAGTGATCCCCGCGCTAAAACTAACCAGT > NC_000913/3845389‑3845673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |