| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2827789 = | 95 (1.010) | 4 (0.040) | 3/492 | NT | 4.1% | coding (53/780 nt) | srlD | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 2827868 = | 95 (1.040) | coding (132/780 nt) | srlD | sorbitol‑6‑phosphate dehydrogenase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
CGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGTATGGCGTACGGTTTTGGTGCTGACGCCACTAGCGAGCAAAGCGTTCTGGCGCTCTCTCGTGGGGTAGATGAAATCTTTGGTCGCGTGGATTTGCTGGTCTACAGCGCCGGAATAGCAAAAGCAGCCTTTATCAGCGACTTCCAGCTCGGCGATTTTGACCGTTCGCTACAGGTGAATCTGGTGGGTTATTTCCTGTGTGCGCGTGAATTTTCGCGTTTGATGATCCGCGACGGGATTCAGGGGCGCA > NC_000913/2827582‑2828142 | cGGAAGACAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTTGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCCCGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGCGCGACAAAGCCGTCACTGTGGCACAAGa > 2:640962/1‑289 (MQ=255) aCAACCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTaa > 2:800320/1‑289 (MQ=255) aaCCTTCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACg < 1:735400/289‑1 (MQ=255) tCGCGAACTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGaa < 1:879772/289‑1 (MQ=255) cgcgAACTGGGTCCTGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGTAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGTTCGGTTTTGAAGTTTGAAGCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAat < 2:403005/289‑1 (MQ=255) ccggggtactGTCACCCTGCCCTTCGAGGGTTTAAACGAAGCGGAAGTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAAGCTGTTAAGTAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGTCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATgg < 2:843822/279‑1 (MQ=255) aCTGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATgg < 2:76667/288‑1 (MQ=255) tGGGTCATGTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGa < 1:800320/289‑1 (MQ=255) tGGGTAATGTCACCCTGCGTTTCGATGGTTTAAACTAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGa < 2:161665/289‑1 (MQ=255) caggTCACCCTGCGCTTCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGt < 2:794926/285‑1 (MQ=255) 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tCGATGGTTTAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGTATGGCGTACGGTTTTgg < 1:709166/289‑1 (MQ=255) tttAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGTATGGCGTACGGTTTTGGTGCTGa < 2:743915/288‑1 (MQ=255) tAAACGAAGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATAAGGAGAAAGTATGGCGTACGGTTTTGGTGCCGACg > 1:822704/1‑288 (MQ=255) aGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATgg > 2:239729/1‑249 (MQ=255) aGCGGAATTTCCGGGCACTGTCCATGTGGCAGGCCCTGTCCCCGACGATATCGCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCACGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATgg < 1:239729/249‑1 (MQ=255) tgtCCGGGCACGGTCCATGTGGCGGGCCCTGTCCCAGACGTTATCCCGCCGGGATCGGTTTTGAAGTTTGAATCTGTTAAGGAGTAAAAAATGAATCAGGTTGCCGTTGTCATCGGTGGTGGGCAAACCTTAGGCGCGTTCCTGTGCCAGGGTCTGGCTGCCGAGGGGTATCGCGTCGCGGTTGTCGATATTCAGAGCGACAAAGCCGCAAATGTGGCACAAGAAATTAACGCCGAATATGGTGAAAGTATGGCGTACGGTTTTGGTGCTGACGCCACTAGCGGGCaaa < 2:369545/287‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |