| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 732888 = | 34 (0.710) | 4 (0.090) | 4/274 | 6.7 | 10.5% | coding (3306/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 734728 = | 35 (0.750) | pseudogene (596/1521 nt) | rhsO | pseudogene, Rhs family | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCTGTAC > NC_000913/732747‑733020 | aCTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTgg > 2:811350/1‑143 (MQ=32) tcaGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCCGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGATGCAGATGCTCGACAGGCTGCAAAGt > 1:245108/1‑143 (MQ=255) caGGGTTGAGCCCGGCGCCGGTGATCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTGCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTg < 2:569071/143‑1 (MQ=11) gggTGGAACCCGCCACCGGTGGGCGGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGaa < 2:654857/143‑1 (MQ=255) ggTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGCGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCCCGACAGGCTGGCAAGTGaac > 2:602775/1‑142 (MQ=255) ccGGTGAGCTGGCGAAAGCGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCgg < 2:401302/143‑1 (MQ=17) tgcgCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTGCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGgtga < 2:265406/140‑1 (MQ=17) cGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCAAAGACGGGGGCAGTGAGGTGTTCCCGCGGGTGCTGGGGCAGATGCTCGACCGGCGGGAGAGTGGAATCGTGGCTGACCGGGTGAGTAAGGaa > 1:338166/1‑143 (MQ=11) gAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACACTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACGGGGTGAGGGAGGaac > 2:294254/1‑142 (MQ=12) cgcAGTCTGGCGGAGTCCCTTCAGCAGGCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGTTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCgctggct < 2:525970/143‑1 (MQ=11) cTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGCGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATc > 1:147778/1‑143 (MQ=17) ccTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGa > 2:234251/1‑143 (MQ=32) ccTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGGGCGGCCTGa > 2:272720/1‑143 (MQ=17) cTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGCGGCAGTGGGGTGTCCCCGCCGGTGCTGGGGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGAc < 1:44520/143‑1 (MQ=255) ttCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGACATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACg < 1:504442/143‑1 (MQ=17) gcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAACGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCCCCGGCCGGCATCGCGCGGCCTGCCgggag > 2:45219/1‑140 (MQ=11) tCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGCGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGCGCGGCCTGCCGGTGGCGCa > 2:479384/1‑143 (MQ=255) gTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACGGGCAGGCAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGAGAGGAAGGCCGCCGCTGGCTGGCAGCGGGCGGCGTAACGGTGGCGCAGagg > 2:473270/1‑141 (MQ=11) gCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCGTGGCTGACCGGGTGGGTGAGGAAAGGCGCCGCTGGCTGGAATCGGGCGGCTTGCCGATGGCGCGGATGcca > 1:766592/1‑141 (MQ=11) gCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCaa > 1:542011/1‑143 (MQ=32) gAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGCGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAg > 2:709746/1‑143 (MQ=17) gAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCAGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATACTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAACGCCGCAGCTGGCTGGCATAGTGAGGCCGGACGGTGGCGCAGATGCaagg > 2:506884/1‑141 (MQ=11) tGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATgg > 2:212747/1‑143 (MQ=34) tgtgGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCgg < 1:107761/143‑1 (MQ=35) gtggtgTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAACGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCCGATGCCAAGCCAGATGGACCCGGt > 1:177576/1‑143 (MQ=255) tggtgTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCATGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGta < 1:382191/143‑1 (MQ=25) gggtgggcccGCCGGGGCGGGGGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGta < 2:413477/136‑1 (MQ=11) gtgtTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGtata > 1:475067/1‑143 (MQ=38) tgtTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGGATac > 1:273315/1‑143 (MQ=25) gccgGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCgg < 1:212747/143‑1 (MQ=39) ggTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGgcga > 2:591480/1‑142 (MQ=38) aGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCAc < 1:10462/143‑1 (MQ=40) aggCTCGACCGGCGGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCt < 1:811350/141‑1 (MQ=255) tCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAGAGCCAGATGGACACGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCAGTAc > 1:687589/1‑143 (MQ=255) ccgcccGGCGCGAAAGTCAACTCCTCGCCGACCGGGTGCGTGAAGAGGGCCGCCGCGGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCTGTAc < 1:368265/139‑1 (MQ=14) | ACTCATCAGGGTTGAAACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGTGAAATCCTGGCTGACCGGGTGAGTGAGGAAAGCCGCCGCTGGCTGGCATCGTGCGGCCTGACGGTGGCGCAGATGCAAAGCCAGATGGACCCGGTATACACGCCGGCGCGAAAAATTCACCTGTAC > NC_000913/732747‑733020 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |