| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 3,815,859 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815859 | 3815940 | 82 | 83 [0] | [0] 82 | [rph]–[rph] | [rph],[rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3815858 | 0 (0.000) | 76 (1.240) | 63/262 | 0.0 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815941 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective);enzyme; Degradation of RNA; RNase PH | |||||
AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815801‑3816082 | ccctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGt < 2:538022‑M2/3‑1 (MQ=255) cctgcttgctcagcgcaaattcaataaaccggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTc < 1:333388‑M2/4‑1 (MQ=255) ttgctaatctcaaattcaatacactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTg < 2:255240‑M2/9‑1 (MQ=255) tgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGc < 1:485668‑M2/10‑1 (MQ=255) gctaagcgcaaattcgataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacacacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa < 1:785296‑M2/11‑1 (MQ=255) gcgaagcgcaaattcaataaactggagctgatatggtttcatgccctcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa < 1:790198‑M2/11‑1 (MQ=255) ctaggcgcaaattcaataaactggcgctgagatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCAc < 2:448061‑M2/12‑1 (MQ=255) taagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACt > 2:468249‑M2/131‑143 (MQ=255) gcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcataagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTCGACTtcg > 1:1186719‑M2/128‑142 (MQ=255) gcgcaaagtcaaaaaactggcgctgatatggtgtcatgccttcgctactcatcctacttgtctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCa < 2:51402‑M2/16‑1 (MQ=255) cgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTGCCCTGCACTTcac > 1:822832‑M2/127‑142 (MQ=255) gcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat > 2:624587‑M2/126‑143 (MQ=255) gcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaagacgactcatcagtcgcattaaaaatcagtttgccggcgccgccttctgcCGTGCCCTGCACTtcact > 1:833942‑M2/126‑141 (MQ=255) attcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatgatg > 1:208197‑M2/122‑143 (MQ=255) ttcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgc < 1:419870‑M2/23‑1 (MQ=255) aataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGcc > 1:418284‑M2/118‑143 (MQ=255) aataaactggcgctcatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGcc < 1:345943‑M2/26‑1 (MQ=255) agaaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacacatataaggtgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGccc < 2:1028902‑M2/27‑1 (MQ=255) taaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaacaaggcgactcatcagtcgccttaaacatcagtttgccagcgccgccttccgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCg > 2:779969‑M2/116‑143 (MQ=255) ctggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCtt > 1:949653‑M2/112‑143 (MQ=255) ctggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCtt < 2:29268‑M2/32‑1 (MQ=255) ggcgctgatacggtctcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 1:212361‑M2/34‑1 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtc < 2:604458‑M2/37‑1 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGCCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGGCTCCCGtc > 2:1130721‑M2/107‑143 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcgcgccgcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtc < 2:32999‑M2/37‑1 (MQ=255) atatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcatca > 1:30795‑M2/103‑143 (MQ=255) tatggtttcatgccttcgctcctcatcttactgttctacagacaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATCCGCCCGTCTTCGGTCAGCACt > 2:623727‑M2/101‑143 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTc > 1:1057626‑M2/95‑143 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTc < 1:1104432‑M2/49‑1 (MQ=255) tcatgccttcgctcctcatcttacttgtctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTc < 1:1104862‑M2/49‑1 (MQ=255) atgccttcgcccctcatcttacttttctacagccaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCAt < 2:1117070‑M2/51‑1 (MQ=255) gccttcgctcctcctcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGt < 2:1168515‑M2/53‑1 (MQ=255) gccttccctcctcatcttacttttctacggacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtgtgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGt < 1:205877‑M2/53‑1 (MQ=255) cttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCg < 1:447906‑M2/55‑1 (MQ=255) ctcctcatcttacttttctacagacaaaaagaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCCCTGATGCGCCCGTCGTCCGCCACTACTCAGTGCCTGCCGGtctc > 1:1141660‑M2/84‑143 (MQ=255) ctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCTTGTCGGtctc > 1:282984‑M2/84‑143 (MQ=255) ctcatcttgcttttctacatacaaaactaaggcgactcctcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTCCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGc < 2:629491‑M2/63‑1 (MQ=255) cccatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcaccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGc < 1:624587‑M2/63‑1 (MQ=255) cttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTTCGGCag > 1:533385‑M2/76‑143 (MQ=255) cttactctgcaacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCag < 1:305157‑M2/68‑1 (MQ=255) ttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCaga < 1:1025657‑M2/69‑1 (MQ=255) acttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTACATGGCGGTCTCTGCGGCAGAGt > 2:770538‑M2/73‑143 (MQ=255) ttacaccagccacaaaaaaagcgcctcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCtt < 1:73545‑M2/74‑1 (MQ=255) tgtctacagacaaaaaaaaggcgactcagcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCtt < 1:738196‑M2/74‑1 (MQ=255) ctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCaa < 2:615013‑M2/77‑1 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAAc > 1:848214‑M2/66‑143 (MQ=255) tacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAAc > 1:544940‑M2/66‑143 (MQ=255) acagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccataaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCGTCGGGCATCACTACGTTCAGGTCGGTCTCTGCGGCAGAGGCTTCGACg > 1:21713‑M2/65‑143 (MQ=255) agacaaaaaaaaggcgactcatcattggctctaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGGCATCACTACGCGCATGTCGGTCTCTGCGGCAGCGCCTCCAacgca > 2:1038878‑M2/63‑141 (MQ=255) 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tcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGc < 1:468249‑M2/99‑1 (MQ=255) atcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCCGAGTCTTCTTCGCAGTCCAGTTCGCAAACagcat > 1:230781‑M2/43‑141 (MQ=255) gtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTGCATGTCGGTCTCTGCGCCAGAGTCTCCACCGTATTCCAGATCGCACACCGCCTCGcc > 2:314170‑M2/39‑143 (MQ=255) cccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGtt < 2:858744‑M2/108‑1 (MQ=255) ccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCCCTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCTCCGTCTTCCAGCTCGCACAGCGCGTCGCcgtaa > 1:73280‑M2/35‑141 (MQ=255) 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tttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATAGGAAACCGCCTCGCCGTTCACCAttccgcccg > 2:348299‑M2/22‑139 (MQ=255) cgcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCTCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTCCCCAATTCCGCCAGAAACTg > 1:814721‑M2/16‑143 (MQ=255) gccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTa < 2:1057626‑M2/134‑1 (MQ=255) ccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCAGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAACCCGCTTCGCCGTCCACAATTCCGACAGAACCCGCGGCCAc > 1:1012065‑M2/9‑143 (MQ=255) ctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATc > 1:765680‑M2/5‑143 (MQ=255) ctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGACGAGCCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGACGTTCACAATTCCGCCAGAAACTGCAGCTACCATc > 2:1032649‑M2/5‑143 (MQ=255) cCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTTCGGCAGAGTCTTCAACGAAAAAAAAATCACAAACCGCATCACCGTTCACAATTCCGACAGAAACTACGGCTACCATCCCt > 1:25135‑M2/2‑143 (MQ=255) cCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTCCACCATTCCGACAGAAACACcggccacccaccgc > 2:740512‑M2/2‑137 (MQ=255) | AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACGTTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCT > NC_000913/3815801‑3816082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |