| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 2,375,828 | IS186 (+) +4 bp | coding (132‑135/963 nt) | menC ← | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2375828 = | 0 (0.000) | 58 (1.250) | 46/274 | 0.1 | 100% | coding (135/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| ? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 2375831 | 0 (0.000) | 46 (0.990) | 40/274 | 0.2 | 100% | coding (132/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
| ? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
AAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCC > NC_000913/2514131‑2514414 | aaaGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:603353/143‑1 (MQ=255) gCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTGTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCATTCGCTGCACTGTTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCa < 1:182912/143‑1 (MQ=255) cTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATa > 1:836691/1‑143 (MQ=255) atgaaGGGCAAGGTAACGTGGGTTCTCGCTGCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAgcg < 2:302933/143‑1 (MQ=255) aaGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCT‑CCGTGTGTGAGTGAGATGTCAGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCCTACATAAAAAAGCCGGGGATAATCCCCATAAGAGCTa > 2:612891/1‑143 (MQ=255) agagCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTaa < 1:558184/143‑1 (MQ=255) cAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAGGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCCATCGCAGCACTGGTGGTGAAACACCAGACATAAAAAAGCCGGGGATCATTCCCATAAGCGCGGACTTa > 1:161407/1‑143 (MQ=255) aaGGTAGCGTGGTTTCTGGCTTTGGTCTGAGGCTGGTTTGCGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTTAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 2:206199/143‑1 (MQ=255) aaGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:788067/143‑1 (MQ=255) aaGGTAACGTGGTTGCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTGACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTaa < 1:492589/143‑1 (MQ=255) aGGTAACGGGGTTTCGCGCTTCGGTCTGAAGCTGGGTTACGGAGCTGCCCTG‑GTGAGTGAGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCGGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAg < 1:106128/143‑1 (MQ=255) cggggTTTCTCGCTTCGTTCTTAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCAGTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTtgt < 1:801019/140‑1 (MQ=255) tGGTTTCTGGCTTCGGTCTGAAGACGGTTTGCGGCTCTACCCTG‑GTGCGTGTGCCGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTgg < 2:328628/143‑1 (MQ=255) tGGTTTCTCGCCTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTgg < 1:224162/143‑1 (MQ=255) tttCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTCAGGGGTGTGGTAt > 1:839559/1‑143 (MQ=255) ctcGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCCATCGCAGCACTCGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTCAGGGTTGTGGTAGTAc > 1:144200/1‑143 (MQ=255) gAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCCGCACTGGTGCTGGAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAAAGTAAGGGTTGTGGTGTTCCGCCTGATATgcgt > 2:823779/1‑140 (MQ=255) cTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAAc > 1:578061/1‑143 (MQ=255) tACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCg > 2:236699/1‑143 (MQ=255) ctACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCGATAAGCGCTACCTTAAGGGTTGGGGTATTACACATGATATGATTTAACGTGCCGATGAAtc > 2:161728/1‑142 (MQ=37) aCCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAACGCCGGGTATAATTCTCATAAGCTCTAACGTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTAc < 1:631801/143‑1 (MQ=37) gAGTGTGGTGGCTGCGGCAAGAGCGGCACGGGGGCTGTAAGACCATACATAAAGAAGCCGGGGATAATTCGCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGa < 2:126411/143‑1 (MQ=18) gtgtGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATa > 2:773041/1‑143 (MQ=255) tgtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGGTATGATTTAACGTGCCGGTGAATTACTGTCACGATaa > 2:59659/1‑143 (MQ=255) gtgCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAAc < 1:68018/143‑1 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTGAAGATGACgg‑‑gc > 2:285/1‑142 (MQ=255) tGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCCCGATAACTG‑‑Gt > 1:811379/1‑143 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTACGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCa > 1:661490/1‑143 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAACAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCa < 1:77807/143‑1 (MQ=255) tCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCa < 1:675561/143‑1 (MQ=255) gCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTTGCGATGAATTACTATCACGATAAATG‑‑CTCAGcg > 2:811850/1‑142 (MQ=21) ccaTCGCAGCACTGGTGCTGTCAGACTATGCAGAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGTGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTc < 2:176914/141‑1 (MQ=18) aTCGCTGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTg > 2:716236/1‑143 (MQ=255) tCGCACAACTGGTGGTGCAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGGCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTgg < 1:367879/143‑1 (MQ=17) ccGCATCACTGGTGCTGTAAGAACATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTTGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTgg < 2:432957/142‑1 (MQ=255) ccGCAGCACCGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTgg < 1:479188/142‑1 (MQ=255) gcagcaCTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTATGGcc > 2:67626/1‑143 (MQ=255) agcaCTGGTGGTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCa < 1:760980/143‑1 (MQ=255) caCTGGTGCTGGAAGACCATACATAATAGAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCata < 2:296168/143‑1 (MQ=255) tgttGCTGTCAGACCATACATAAAAACGCCGGGGATCATTCCCTTAAGCGTTAACTTAATGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTg < 2:760198/140‑1 (MQ=14) tGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATCCTGGACCgtagta > 2:294369/1‑140 (MQ=255) gcgCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGt < 2:145085/141‑1 (MQ=255) gTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCTGTATTGGt > 1:3282/1‑143 (MQ=255) gTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATGACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAAGTCTGGCCCATATTGGGaaagc > 2:347617/1‑140 (MQ=255) tAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGccc > 1:105249/1‑143 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaa < 1:236699/143‑1 (MQ=255) gACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTGAAGGGATGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑ATCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGACCgaa > 2:329713/1‑143 (MQ=255) aCCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCgaag > 1:140307/1‑143 (MQ=255) ccataAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTg < 2:594426/142‑1 (MQ=255) ataAAAAAGCCGGGGACAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGa < 1:268879/143‑1 (MQ=255) aaaaaaGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATa > 1:553106/1‑143 (MQ=255) aGCCGAGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATACGATTTAACGTGGCGATGAATTACTCTAACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCg < 1:363279/143‑1 (MQ=255) gCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCgg < 1:600491/143‑1 (MQ=35) cGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGACCGAAGAACTGGCTACTTCgtcg > 1:71532/1‑140 (MQ=255) ggggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCAGACGGACTGGATAGTGCGGCAc > 2:201029/1‑143 (MQ=11) agggATAAATCCGATAAGGGCTAACATAAGGGTGGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCAc < 1:665585/142‑1 (MQ=11) ggATAATTCCCATACGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTACTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGt < 1:285/143‑1 (MQ=21) ggATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGt < 1:773041/143‑1 (MQ=34) ttCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGcc > 2:581821/1‑143 (MQ=11) ttCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGcc > 1:741218/1‑143 (MQ=11) ttCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTATCGATAACTGCCATCAGCATTGC‑‑GCCCCCATTTGTAAGCCCGCCGACCTGGATCCTTCCGCACGTAACGcc > 2:611834/1‑143 (MQ=2) | AAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTG‑GTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTG‑‑GTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCC > NC_000913/2514131‑2514414 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |