| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,293,032 | IS1 (–) +8 bp | intergenic (‑110/‑488) | hns ← / → tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 44 (0.890) | 36/284 | 0.4 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 1293039 | 0 (0.000) | intergenic (‑117/‑488) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase | |||||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 0 (0.000) | 55 (1.110) | 43/284 | 0.1 | 100% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTG > NC_000913/1292891‑1293174 | cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagagacagaagccactggagcacctcaaaaacacaatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt < 1:257030‑M1/2‑1 (MQ=255)cgcggatggccggcggtgctttcgccgttacgcaccactgttgcagtagctgaacaggagggacggctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt > 2:730591‑M1/142‑143 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtg < 2:19036‑M1/3‑1 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGTTAATAATAGAGCTTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt < 1:419001/143‑1 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt < 1:908169/143‑1 (MQ=255) gttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgt < 1:544161/143‑1 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgcc > 1:37386/1‑143 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgcagttacgcacctccccgtcagtagctgcacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgcc > 2:456394‑M1/137‑143 (MQ=255) tgcAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgtcg < 2:868545/141‑1 (MQ=255) ttatatatttaactgctTCGTTCTTTTTAGCAATCTCTAACTTATATTGGGGGTGTTTGCTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTTCTATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGg > 2:33979‑M2/8‑142 (MQ=255) tCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGg < 2:490176‑M2/143‑2 (MQ=255) gagaggcggtggttttggcgaaacgcgccaccccgtcagtagcggaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 1:671380‑M1/135‑143 (MQ=255) cAGAATTTTAAGCGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGCGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgg < 2:46914‑M2/143‑3 (MQ=255) aGTATTTTAAGTGCTTTGCTCATTGTAGTATTCTCTAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggt > 1:74745‑M2/1‑140 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAGATTGTTCTTTATTTTGTGCAGggt < 1:486022‑M2/143‑4 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggt < 2:220859‑M2/143‑4 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggt < 1:150675‑M2/143‑4 (MQ=255) aTTTTATGTGCTTCACTCATTGTAGTAATCTCAAACTTTTATTGGGGTGGTTTATAAAGGTAATAATATAGAATTAAATTCAGTTGCGCATTAGCCAGAAATGAAAAGATTGCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccgggtaat < 2:153603/143‑7 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataaat < 1:566083‑M1/17‑1 (MQ=255) gcagtCCGTCGGTCTTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTATATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgact > 2:386713‑M2/3‑133 (MQ=255) gcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAatat < 1:884472‑M1/19‑1 (MQ=255) gctttcgccggcacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAatat > 1:161084‑M1/125‑143 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCAGCCAATAAATATCt < 1:139300‑M1/21‑1 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCGGggtgctgacgccaa < 1:20309‑M2/143‑15 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacacgaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:763284‑M1/121‑143 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAGTAAATGTCTTTTCatc < 1:263511‑M1/28‑2 (MQ=255) tGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGAGGTTGGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagt < 1:668995‑M2/143‑27 (MQ=255) ccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa < 1:544679‑M1/41‑1 (MQ=255) ccgtcagtagccgaacaggagggacagcttatagaaacagaagccattggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGaa > 2:233452‑M1/103‑143 (MQ=255) cagctgaacaggagggacagatgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc > 1:281524‑M1/96‑143 (MQ=255) ttATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata < 2:799234‑M2/143‑43 (MQ=255) tctgtggtGGTTTGTTGAGGTAATAATAGGGCATGAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGGCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc > 2:692462‑M2/3‑97 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtacgctggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATCAAATTACCCAGAACAGCCGCGgcatct < 2:868641‑M1/55‑3 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata < 2:297881‑M1/56‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaatcccctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg > 1:51472‑M1/87‑143 (MQ=255) ggtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:585787‑M2/1‑92 (MQ=255) ggtggtTTGTTAAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgat > 1:72587‑M2/1‑92 (MQ=255) ggtcagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagctggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATACAATTAACCAGAAACAACGCGGCATCTAGCCCTa < 2:500384‑M1/62‑1 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatcgtgttttatgttcagataatgcccgatgact < 2:663382‑M2/143‑56 (MQ=255) tttGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactt < 1:167270‑M2/143‑57 (MQ=255) agagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaagaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 1:501593‑M1/80‑143 (MQ=255) tgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg < 2:592869‑M2/143‑59 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATCTCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 2:122448‑M1/68‑1 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:480251‑M1/68‑1 (MQ=255) tgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 1:872587‑M2/1‑82 (MQ=255) aataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGTCTgttaattattccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc > 1:265831‑M2/1‑73 (MQ=255) ataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca > 1:175358‑M2/1‑72 (MQ=255) taGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac < 1:505313‑M2/143‑73 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaactcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgca > 1:610099‑M1/62‑143 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTAACACCGATGATTTCgcag < 2:429553‑M1/83‑1 (MQ=255) ctggagcacctcaaatacaccatcgtacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCTGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACg > 2:4091‑M1/57‑143 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGt > 1:658077‑M1/56‑143 (MQ=255) acgaacctcatatacaccatcatacactccatcagtaagtttgcagcaccaccTTTTGCCGCCAATAAATATCTTCTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATCTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGa > 1:265053‑M1/54‑143 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcaataagtaggcaacatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTGCATAAAATTAGCCAGAAACGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAgg < 2:886800‑M1/92‑1 (MQ=255) tCAGTGGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 1:598613‑M2/1‑58 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt < 1:99704‑M1/93‑1 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca > 2:18010‑M2/1‑54 (MQ=255) gtgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagcacgacagc < 1:680107‑M2/143‑92 (MQ=255) ggtcaatAGCCAGGCATGTAATGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc > 2:757046‑M2/4‑52 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATGTCGCAGCACGTGAGGTTAAAAc < 2:763701‑M1/99‑1 (MQ=255) gacgccatcgtacactaaatcagtaagttggcagcatgaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTc > 2:530998‑M1/42‑143 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTGGAGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTc > 1:19036‑M1/42‑143 (MQ=255) caccgtcatacgcgacatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCt > 2:328717‑M1/40‑143 (MQ=255) tAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactaaataaaagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgagtttgaaaacgacagcgacttc < 1:357650‑M2/143‑98 (MQ=255) catcatcccctcaatcagtacgttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAt > 2:817933‑M1/37‑143 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttgacagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTGCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCATATTTACACAGAGAATTTCACAGCACGTAGGGTTAAAAATTCATgac < 2:229764‑M1/107‑2 (MQ=255) atcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAtt > 1:857172‑M1/36‑143 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt < 1:497724‑M1/113‑1 (MQ=255) tcttaattcagtaagttggcagcatcaccTTGGGAGGCAAATAAATAGCTGTTCATAAAATTAGACAGAAAAGACGCGGTATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTc > 1:514249‑M1/30‑143 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTca < 1:629617‑M1/115‑1 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGAAGAAAAAAAACACCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCCACAGACAGCCCTATTTACACCGATAATTTCGCAGCACGTGACGTTAAAACTTCCTGATTCATGTca < 2:790544‑M1/115‑1 (MQ=255) taaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACAAAAATCCTGGCGCAGCACGTGCGTTTAAAACTTCCTGATTCATGTcaca < 1:413341‑M1/117‑1 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgcttttgagaacgaccgcgacttccgtcccagccat < 2:313567‑M2/143‑110 (MQ=255) tAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgactttgagcacgacagcgacttccgcccccgccgt < 2:497715‑M2/143‑110 (MQ=255) catcagtaagttggcagcatcaccTTGCGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTTGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAtt > 1:241642‑M1/25‑143 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTAAGGTTAAAACTTCCTGATTCAtgccacctt < 1:242881‑M1/119‑4 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGAAGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACatg < 1:124592‑M1/119‑2 (MQ=255) ggAATTCAACATTGTTCTTGATTTGGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcc > 1:524056‑M2/1‑31 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttgcgtcccagccgtgcca < 2:131484‑M2/143‑114 (MQ=255) aTTCACAATTGTGCTTTATTTTTTGTCGtgtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccagg > 2:251381‑M2/1‑28 (MQ=255) aTTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagcacaaacgattttgaggccgacagcgtcttccgtcccagccgtgccagg < 1:334385‑M2/143‑116 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcggtgccaggg < 2:215841‑M2/143‑117 (MQ=255) ttCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt > 1:350163‑M2/1‑27 (MQ=255) taagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAGTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgg > 1:3883‑M1/19‑143 (MQ=255) gacgtgggcggcatcgccGTGTGCGGCCGATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgg > 2:133774‑M1/19‑143 (MQ=255) aagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg > 2:52853‑M1/18‑143 (MQ=255) aagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggg > 1:446125‑M1/18‑143 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcagtcccagccgtgccaggtgct < 2:352690‑M2/143‑120 (MQ=255) aaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctg < 1:673962‑M2/143‑121 (MQ=255) tggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgaga < 1:268038‑M1/130‑1 (MQ=255) aTTGTTCTTTATTTTGTGTCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatggtcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcc > 1:48015‑M2/1‑21 (MQ=255) ttGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcct > 1:131888‑M2/1‑20 (MQ=255) ggcagcatcaccTTGAGCCGCCAATAAATATCGTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAt > 1:279131‑M1/13‑143 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGAtt < 1:727810‑M1/132‑1 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAAGATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTCTATGGGGAGAtt < 2:795114‑M1/132‑1 (MQ=255) ttCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcag > 2:668995‑M2/1‑17 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 1:907774‑M2/143‑130 (MQ=255) atcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGt < 1:256800‑M1/137‑1 (MQ=255) ttttGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcagg > 1:490176‑M2/1‑10 (MQ=255) ttGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtt > 1:138548‑M2/1‑8 (MQ=255) | ATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCTG > NC_000913/1292891‑1293174 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |