| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1962621 | 22 (0.440) | 23 (0.470) | 16/284 | 2.7 | 51.1% | coding (352/393 nt) | flhE | proton seal during flagellar secretion |
| ? | NC_000913 | 2101749 = | NA (NA) | noncoding (1195/1195 nt) | IS5 | repeat region | |||||
TTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACC > NC_000913/1962480‑1962760 | tcgtttctttgctggtatgggggctcttactgctgacttcactgtcggcgaaggtaagttgacgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGc > 1:453414‑M1/139‑143 (MQ=255) gttgCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTg < 1:360224/143‑1 (MQ=255) acctttctggtctgacggcgcttactgctgcattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTgg > 1:286195‑M1/134‑143 (MQ=255) cAAGCTCTTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGATCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAAt < 1:313914/143‑1 (MQ=255) aaGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATTATTCAGAATCGCTTCATTACGTTGTCCCTTTACGGGTGGAAtt > 2:54234/1‑143 (MQ=255) aTTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAATTCATAATCATACCCGTGACCGCGTTATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCg < 2:641381/143‑1 (MQ=255) tctgacggcgcgtactgccgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctgtggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGc > 2:837341‑M1/124‑143 (MQ=255) cTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcgg < 1:255356‑M1/143‑20 (MQ=255) cTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcgg < 1:90356‑M1/143‑20 (MQ=255) tGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggg > 1:458849‑M1/1‑123 (MQ=255) taaataaTTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGc < 1:422140/143‑1 (MQ=255) cttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgattactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatcgcagatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTg > 1:88904‑M1/114‑143 (MQ=255) tGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTGTCTTTAGCGCTGGAATTGACCGCCCGCCGCCTGGCCCt > 1:245004/1‑143 (MQ=255) gCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACtt > 1:499571/1‑143 (MQ=255) caacaaGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcg < 1:709597‑M1/143‑34 (MQ=255) tgaattcactgtcgccgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTcc > 1:8194‑M1/106‑143 (MQ=255) aacaaGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCATGGCACTTcc > 2:533910/1‑143 (MQ=255) gaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTccc > 2:115392‑M1/105‑143 (MQ=255) aTCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaactcttctcggcgtgctct > 1:723848‑M1/1‑101 (MQ=255) tgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAAt < 1:302563‑M1/47‑1 (MQ=255) gAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCATGGCACTTCCCAGATAAATCg > 1:518060/1‑143 (MQ=255) gcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCaa < 2:891594‑M1/52‑1 (MQ=255) tttttCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTGTGGggagggtgcgaataagcggggaaattcttgtcggctgactcagtcatttc > 1:176058‑M1/1‑93 (MQ=255) gaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgctctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGACAAATCGCAACg < 2:653303‑M1/54‑1 (MQ=255) ttCACGGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatt < 1:340985‑M1/143‑54 (MQ=255) ggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGtt > 1:468893‑M1/87‑143 (MQ=255) tccctgcGTTATTGAACGTACTCGCGAGCGCCGAATTTTTTGGTCCTTCAGCGATGATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcattt < 2:768876‑M1/140‑55 (MQ=255) aCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataatcggggaaattcttctcggctgactccgtcatttcatttct > 2:426720‑M1/1‑87 (MQ=255) aCTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttct > 1:692063‑M1/1‑87 (MQ=255) aCTGAGTTATCAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTGGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCGTTAGCGGTGGAAGTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTctg < 1:866862/143‑1 (MQ=255) ttgatgactcatgatgacccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcacggccttgttcgccccttccTTAGCGGTGGAATTCACCGCCCACCGCCCGGCCCTCCCCAGATACATCGCAACCGctctgccc < 2:86492‑M1/63‑3 (MQ=255) ttattaAACATCCTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTAAGAGCTATCCCACAACCACTTCATTACGTTTTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCg < 1:859058/143‑1 (MQ=255) ttattaAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCg < 1:563243/143‑1 (MQ=255) ttattaAACACACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCg < 1:509024/143‑1 (MQ=255) tgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGc > 1:127899‑M1/77‑143 (MQ=255) tgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGc > 1:344689‑M1/77‑143 (MQ=255) tattaAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGc < 1:720449/143‑1 (MQ=255) ttaAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACCATCACTTCATTACGTTGTACCTATAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGCTAAATCGCACCGGTTCTGCTGCCGCta > 2:492597/1‑143 (MQ=255) ttaAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCCACGGTTCTGCTGCCCCta > 1:736764/1‑143 (MQ=255) aaaCATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCAGCtatg > 1:308793/1‑142 (MQ=255) catgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATAc > 1:262469‑M1/72‑143 (MQ=255) aaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGaaaa > 1:602655‑M1/65‑143 (MQ=255) accctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAg > 1:891594‑M1/64‑143 (MQ=255) gcgAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTCTAGcgtaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttgt > 2:438839‑M1/1‑66 (MQ=255) gcgAGCGCGTAATTTTTTTGTCATTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcattgcttaatgtttgagctgattgttt > 2:331890‑M1/1‑66 (MQ=255) tgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCa > 1:339397‑M1/60‑143 (MQ=255) aaTTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACggtggt > 1:554007/1‑143 (MQ=255) aTTTTTTTGTCCTTCAGCGATAGTTCACTATCACTTCTTTACGTTGTACCTTTAGtgaaggtgcgaatatgcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaat < 2:305273‑M1/143‑89 (MQ=255) tttGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgatttttctccgcgtaattgcatt > 2:515148‑M1/1‑50 (MQ=255) tttGTCCTTCAGCGATAATGCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgcctt < 1:522395‑M1/143‑94 (MQ=255) aaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAGACGCCCACCAATTGGGGGCCGCCACACAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCct < 1:420138‑M1/105‑1 (MQ=255) cGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCACCGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGACAACGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTaa > 1:307739/1‑143 (MQ=255) cGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCGATACCGGAAAAGGCCACGGTGGGTCCGCTCCGCCCccctta > 1:115943/1‑141 (MQ=255) gatctcatatcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTCAtt < 2:504004‑M1/111‑1 (MQ=255) ctcatatcagggacctgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTCTACCGCAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGa > 1:172836‑M1/30‑143 (MQ=255) tcagggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAAc < 1:550648‑M1/120‑1 (MQ=255) cACTTCATTACGTTGTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttctt < 1:470399‑M1/143‑120 (MQ=255) ggacttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCCCTTCCCAGATACATCGCAACGGTTCTGCTGCCCCTATACCGGCACCGGCCTCGGTCGCTCCGCTCTGCCCCTCTCATTCGGCCCACcgagc < 1:87589‑M1/124‑2 (MQ=255) aCTTCAAGAGGTTGTACCTTTGGggaaggtgcgaataagcgtggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttc < 2:723848‑M1/143‑121 (MQ=255) cttgttcgcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAACGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCGCCTCTAATTCGACCCAACGAGATTg < 1:449769‑M1/127‑1 (MQ=255) gttcgcaccttccCTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCCGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTTCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGa > 1:255568‑M1/14‑143 (MQ=255) cGTTGTTCCTTGAGggacggtgcgaataagcggggaaatttttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaa < 2:900416‑M1/143‑130 (MQ=255) gcaccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAacac > 1:619359‑M1/10‑143 (MQ=255) actctccttAGCGGTTGAAGTAACCGCCCCCCGCCTGGCACTCCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCCGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTGCCGCTCTGCCTCTCTAATTCGATACAACGAGATTGCGAACACaa < 2:253908/136‑1 (MQ=255) gTACCTTTAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcg < 2:692063‑M1/143‑134 (MQ=255) ccttccTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAg > 1:840017‑M1/7‑143 (MQ=255) cctgccTTAGCTGTGGAATTAACCGCCCACTGCCTGGTACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGTAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAg > 2:844002‑M1/7‑143 (MQ=255) tttAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc < 1:480591‑M1/143‑139 (MQ=255) tttAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc < 1:421628‑M1/143‑139 (MQ=255) tttAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcggctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctacttagaccgcttcttcgccatttaaggcgttatc > 2:279306‑M1/1‑5 (MQ=255) tttAGggaaggtgcgaataagcggggaaattcttctcagctgactcagtcatttcatttcttcatgtttgagccgattttttctcccgtaaatgccttgaatcagcctatttagaccgtttcttcgccatttaaggcgttatc < 1:75603‑M1/143‑139 (MQ=255) ttAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAAcc < 2:302563/143‑1 (MQ=255) | TTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACC > NC_000913/1962480‑1962760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |