| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4094682 | NA (NA) | 18 (0.440) +TGTAGGCCGGATAAGGCACTTGT |
7/238 | 4.6 | NA | noncoding (367/402 nt) | REP299 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 9 REP sequences | REP299 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 9 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 4285324 = | NA (NA) | noncoding (23/77 nt) | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP320 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
TTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCC > NC_000913/4285184‑4285466 | ttctAGCGGCTGATGAGGAGTGCCATTCATCAGAGACACTCCGGAGGTAACGGAGGGATTGGTTTAATCCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgcc < 1:62095/143‑1 (MQ=255) ctATCCGCGGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTAcgccgc < 2:439468/143‑1 (MQ=255) tCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATc > 1:591275/1‑143 (MQ=255) cGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCg < 1:390382/143‑1 (MQ=255) cTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATGCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCTTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATGCGGCGTAAACGCCTTATCCGGc < 1:566633/143‑1 (MQ=255) agaGTGCTATGCATCACATAGTCTCCGGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTGATGGGAGA‑AGGGTAACGCTCTGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatcaat < 2:606515/141‑1 (MQ=37) aTAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTCGGCCGGTTAAGGCGTTTACGCCGCGTCCCGctatcatt > 1:343883/1‑141 (MQ=255) aTAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATTAGGCGTTTACGCCGCATCCGGcaatcaat > 1:300530/1‑143 (MQ=255) tAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGGAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTGAAGGGAGAGAGGTT‑ACTCTCGGGTATCCCTTGTCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATg < 1:762703/143‑1 (MQ=37) aGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTCAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGc < 1:506400/143‑1 (MQ=255) tGCCGTTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCt < 1:744692/143‑1 (MQ=255) ccATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCAGCTAGCGCTTGTTGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTGACGCCGCATCCGGCAATCACTGCCTGa > 2:882029/1‑143 (MQ=38) ccATTCATCACAGATCCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGa < 1:706080/143‑1 (MQ=255) acaGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGTCAATCAATGCCTGATGCGACGCt > 2:565196/1‑143 (MQ=255) caGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTg > 2:684111/1‑143 (MQ=255) atactcCAGAGGTAATGTAGGGATGGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTcg < 1:150239/140‑1 (MQ=255) tctcCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCCAGCAATGCCTGACGCGACGCTGTcgcg > 2:822013/1‑143 (MQ=255) ccAGAGGCACTGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTGACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCTTGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCt < 1:264699/143‑1 (MQ=38) agagGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCCGTCGCGTCTTa > 2:458220/1‑143 (MQ=255) agGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATc > 1:360586/1‑143 (MQ=255) tAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAgg < 1:303566/143‑1 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:279391/143‑1 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTa < 1:827210/143‑1 (MQ=255) gTAGGGATTGTTTTAACTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:462368/143‑1 (MQ=255) ttttgtttGTTTTAATTCCCGCTCCATGATGGGAGA‑AGGATAACGCGCGGGTAACCCTGGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTAc < 1:198065/137‑1 (MQ=25) gttGTTTTAGTTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAcc < 2:506718/142‑1 (MQ=255) aTTGTTTTGATTCCCGCGCGCTTAGGGGAGA‑TGGTGATCGCTCGGGTCACCCTTGCCGAATGTCTGCCGGCTAAGGTGTTTCGGCCGCATCTTGCAATCAATGCCTGATGCTACGTTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAcc < 2:300197/143‑1 (MQ=21) aTTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGCTAAGGGGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAcc < 2:789231/143‑1 (MQ=255) aTTCTCGTTCTCTTATGGTAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGAc < 1:810448/143‑1 (MQ=255) ttCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCAGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTCATCAGGACTACACACCGTTACCGACt > 2:257001/1‑143 (MQ=255) cGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGCTGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTCCAAACCGTTACCGACTCGCa > 2:209486/1‑143 (MQ=255) tCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGACTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGAGGCGACGCTGTCGCGTCTTCTCGGGCCCACACACCGTTACCGACGCGCATCg > 2:608016/1‑143 (MQ=25) ccTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCggg > 1:462248/1‑143 (MQ=255) ccTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCggg > 1:745564/1‑143 (MQ=255) ttATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCAAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCCACAAACCGCTACCGACTCGCATCGGGCa > 2:60973/1‑143 (MQ=255) tATGGGAGA‑AGATTAACGCTCGGGTAACCCTGGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCaa < 1:634642/143‑1 (MQ=255) ggggtga‑gggtgaCCGCTCGGGTAGCCCTTGCCGAATTTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAtt < 2:714475/142‑1 (MQ=25) ggAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTCACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGACCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgt < 2:278443/143‑1 (MQ=255) gaga‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCCTCCGTCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATtgtg < 1:565196/143‑1 (MQ=255) aga‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 1:795795/143‑1 (MQ=255) aga‑AGGGTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCTATTGTgg < 2:368199/143‑1 (MQ=255) aggaGGTGACCGCTCGGGTAACCCTCGCCGAACGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTgg < 2:127086/140‑1 (MQ=25) ggTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATACGGCGCTTACGCCGCGTCCGGCAATCAATGCCCGATATCACGCTGTAGAGGCGTGTCCAGCCTCCACACCGATACAGACGCGCAACGGGCAATAGTgggcac > 2:434993/1‑140 (MQ=255) tAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGa < 1:283255/143‑1 (MQ=255) cTCGCGTATCGCTTGCCGAGTGTACGCTGCTTAACGCGTTTGCTCCCCATCCGGCAATCCATGCCGGATGCGACTCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCTTCTCGCATCGGGCAATTGTTGGTTACGATGGCa < 2:471786/143‑1 (MQ=21) tAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGCTGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGa < 2:813847/143‑1 (MQ=255) tAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGa < 2:391934/143‑1 (MQ=255) accccTTGCCGAATCGAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGTCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGAt < 1:230603/141‑1 (MQ=255) aCCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACCCCCCACCCCGCAAACAATGCCTGATGCGACGCCGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGCCTCGCATCGGGCAAGCGGGGGCTACGATGGCATCGCCAtc > 2:63746/1‑142 (MQ=21) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCt < 1:834932/143‑1 (MQ=255) ttGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATAGGGCAATGGTGGGGTACGATGGCCTCGCGATAGCCt > 1:76418/1‑143 (MQ=255) gCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGc > 2:744083/1‑143 (MQ=255) ccGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATAGGGCAATTGTGGGTTACGATGGGATCGCGATAGCCTGCt > 1:436620/1‑143 (MQ=255) aaTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTtct < 2:697151/143‑1 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCa < 1:464786/143‑1 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTGCCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaa < 1:770806/143‑1 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATAGAATCGCGATAGCCTGCATCTCTTCAag > 1:27994/1‑143 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGGTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCaaac > 1:58083/1‑141 (MQ=255) cGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAagca > 1:300219/1‑143 (MQ=255) ggATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAagcag < 1:82774/143‑1 (MQ=255) gATCAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAagcagc < 1:501296/143‑1 (MQ=255) ggCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTtctc > 1:526067/1‑143 (MQ=255) gCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCACTGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCg < 1:581876/143‑1 (MQ=255) gTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCACGCATCTTCTCGAc > 1:447966/1‑143 (MQ=255) tACGCCGCAGCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTAc < 1:569917/143‑1 (MQ=255) cgccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACCAACCGTTACCGACTCGCCTCGGGCAATCGTGGGTTACGATGGCATCGCGAGAGCCTGCTTCTCTTCGAGCAGCTTCCCGAcggccg > 1:845629/1‑138 (MQ=25) gccgcATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAAATGCGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCCAGCAGCCTATCGACTACGcc > 2:74142/1‑143 (MQ=37) | TTCTATCCGCTGATAAATAGTGCCATTCATCACAGATTCTCCAGAGGTAATGTAGGGATTGTTTTAATTCCCGCTCCCTTATGGGAGA‑AGGTTAACGCTCGGGTAACCCTTGCCGAATGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATCAATGCCTGATGCGACGCTGTCGCGTCTTATCAGGCCTACAAACCGTTACCGACTCGCATCGGGCAATTGTGGGTTACGATGGCATCGCGATAGCCTGCTTCTCTTCAAGCAGCTTCTCGACTACGCC > NC_000913/4285184‑4285466 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |