New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 4075865 | 226 (1.160) | 4 (0.020) | 3/472 | NT | 1.6% | coding (314/600 nt) | yihX | alpha‑D‑glucose‑1‑phosphate phosphatase, anomer‑specific |
? | NC_000913 | = 4076763 | 273 (1.420) | coding (619/873 nt) | yihY | BrkB family putative transporter, inner membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
CGTTATTGTTGATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAGCTCATTTATGGTGTGCTGGCGGTGATCCCCATTCTCTTTGTTTGGGTCTACTGGACATGGTGTATCGTCTTGCTTGGCGCGGAAATTACTGTCACTCTCGGGGAATACCGCAAACTAAAACAAGCAGCTGAACAAGAAGAAGACGACGAACCATGATTGCATTAATTCAACGCGTAACCCGT > NC_000913/4076482‑4077043 | ttgttgATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGATGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGAGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTGCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCACTTACCTAACcgc > 2:1619379/1‑282 (MQ=255) gATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTTCAGCATTGTTCATCCCATCCGCTTACCTAaccgccacgc < 1:974761‑M2/282‑11 (MQ=255) gATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACcgcg > 1:421147/1‑278 (MQ=255) gATGTACTCCATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGAAAACGTGCTGCGTTTTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCCCCTTCTTGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGATTCCTTAACcgcgacgc > 1:671654/1‑282 (MQ=255) ccATCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCg > 1:1888695/1‑282 (MQ=255) tCGATAGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTGTGGCGATCAGATCCTATTTGCTCTCACGGCACTGGGCGAGCGCTCCCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTCCTGGTTGCTTTACAGAATTTTTCTTAAGTCACGAGTACCTAACCGCTACGCGAtttcgggt > 1:1771682/1‑275 (MQ=255) aGCGCGTTGAATACCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGtt > 2:602079/1‑281 (MQ=255) cgcgTGAAATACCATCTGGCGAAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATTATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGt < 2:1954632/282‑1 (MQ=255) aCCATCTGGCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCTTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTTCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTc < 2:671654/282‑1 (MQ=255) ggCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCg > 2:1106349/1‑282 (MQ=255) ggCGCAGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCg > 2:1710792/1‑282 (MQ=255) aGTAAACGAGCGCGACCAAAAATTTCCTCGTTCGCGTGGTACTGGATGTTTTTAACGCGGGGGCCCCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGAGCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCTATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGTGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCa < 1:902650/282‑1 (MQ=255) cgcgACCAAAAATTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTTTCGGCGCGTTTGTCGCCGCCCCCCTGTTCCAAGCAGgaaagaacg > 1:562650/1‑280 (MQ=255) aaaaTTTACTCGTTCGCCGTTTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGTGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCACAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTGGTGTATCTCCTGCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTcgcg < 2:1228560/282‑1 (MQ=255) aaaTTTACTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTcgcg > 2:807082/1‑281 (MQ=255) aCTCGTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGTTTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGACGCAGGAACGACAGGTTTCGCGCttcaca > 1:1985725/1‑278 (MQ=255) gTTCGCCGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAg < 2:542498/251‑1 (MQ=255) cgggtAGTGGATGATTTTAACGCTGGGGGTGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCTAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGtt < 2:903991/279‑1 (MQ=255) cGTGTACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTTGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGtt < 1:602079/282‑1 (MQ=255) tgtACTGGATGATTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTcgcg > 2:155149/1‑263 (MQ=255) gatgatTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCATATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTcgcg < 1:31260/256‑1 (MQ=255) atgatTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCatat < 2:792804/282‑1 (MQ=255) 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atTTTAACGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAg < 1:1665120/282‑1 (MQ=255) atTTTAACGCTGGGGCCCGTGCGGGCGGGGGCCAGTCTGGCGATCATTTCCTATTTGCCCTCCCTGCCCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAg < 1:1520456/282‑1 (MQ=255) aCGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAaccaccacgcgatgcccctgctcacgcagtttatgcatgatggcgatcacttccgggcgcagc > 2:954536‑M2/1‑178 (MQ=255) aCGCTGGGGCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAaccaccacgcgatgcccctgctcacgcagtttatgcatgatggcgatcacttccgggcgcagc < 1:954536‑M2/241‑64 (MQ=255) ggggCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAGCTCCTTTATgg > 2:1670090/1‑282 (MQ=255) gggCCGCTGCTGGCAGGGGCCAGTCTGGCGATCAGTTCCTATTTGCTCTCCCTGCGCTGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTcg < 1:385737/238‑1 (MQ=255) 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tATTTGCTCTCCCTGCGCGGGGCGAGCGATCTCAATACTGTCATCGACAACGTGCTGCGTATTTTTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTGTTCCTACCATCCGCGTACCTAACCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAGCTCATTTATGGTGTGCGGGCGGTGATCCCCATTCTCTTTGTTTGGGTCTAc < 2:1398711/282‑1 (MQ=255) tcatcccggggctgcggcgtcgaTCCCAATCCTGTCATCGACAACGTGCTGCGTGTTTGTCCGTTGCTGTTGTCGTGGATCTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCATTTTTCCTGCCATCCGCTTACCTATCCGCGACGCGATTGTCGGCGCGTTTGTCGCCGCACTCCTGTTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCTTGTTCCCGTCATATCAGCTCATTTATGGTGTGCTGGCGGTGATCCCCATTCTCTTTGTTTGGGTCTACTGGACa < 1:200751/262‑1 (MQ=255) ggctcagtgcgtggggcgggcGATCTCACTACTGTCATGGACAACTGGCGGCGTAGTGTTCCGTTGCTGTGGTCGTGGAACTCCTTCTGGTTGCTGTACAGCTTTGTATCAACCAGCCGCGTGCCTAACCGCGACGGTATTGTCGGCGCGTTTTTCGCCGCACTCCTGGTCGAAGCAGGAAAGAAAGGTTTCGCGCTTTATATCACCATGTTCCCGTCATATCAGCTCATTTATGGTGTGCTGGCGGTGATCCCCATTCTCTTTGTTTGGGTCTACTGGACa < 1:689192/269‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |