| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1951305 = | 89 (0.600) | 3 (0.020) | 3/462 | NT | 3.0% | coding (474/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein |
| ? | NC_000913 | 1951547 = | 107 (0.750) | coding (153/819 nt) | yecE | UPF0759 family protein | |||||
AACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGCTAAAGTGTTGCCCGAAAATTGGTGGCAACATCCTGCTGCATTAGGTGCAACCGACAGCGATATCGAAATCATCAAACGTCAATGGGGTGCGT‑TTTACGGTACGGATCTGGAGTTGCAATTACGCCGCCGAGGTATCGATACAATAGTGTTATGTGGGATCTCGACCAATATCGGTGTTGAATCCACCGCCCGCAATGCCTGGGAACTTGGCTTTAATCTGGTGATTGCCGAAGACGCCTGTAGTGCCGCCAGCGCCGAGCAGCACAATAACAGTATCAACCATATCTACCCGCGCATCGCCCGTGTGCGTAGCGTGGAAGAGATCCTCAACGCGTTATGATTTACATCGGTCTACCGCAATGGTCGCATCCTAAATGGGTGCGGTTGGGGATCACCAGCCTTGAAGAGTATGCCCGCCACTTTAACTGCGTGGAGGGCAACACCACGCTTTACGCCCTGCCGAAACCCGAGGTTGTCCTGCGCTGGCGTGAGCAGACCACAGATGACTTCCGCTTCTGTT > NC_000913/1951031‑1951578 | cctcttctcctttggcgaaaaactgtggagggcggacttccacgccataattaaattcgccaggaagagaatcgagaaaatgccaaagcgcaggcagctcccgtgggccgaatgtggcaggcagttgcagccagtattgcccaatgcgcggagccaacggtgacatgcgggtcaaaaattcagtcactaaatcatcgcaatgccgtaatgctgcctgatgcgaaatggtcgccggaaacttaaaacagaagcggaagtcatctgtggtctgctcaCGCCAgc > 1:1359601‑M1/276‑282 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |