| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 2,133,285 | A→T | 3.1% | I38N (ATC→AAC) | wcaA ← | putative glycosyl transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,133,285 | 0 | A | T | 3.1% | 444.4 / 4.4 | 134 | I38N (ATC→AAC) | wcaA | putative glycosyl transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (69/59); new base T (2/2); total (71/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.78e-01 | |||||||||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
ACTTCGCCCTGGCAAACGTAGTCGTTAGCGTACAAAAAGGCGTGTGTGACCAGTTGCTGTTTATGGGCGAGGAAGACGCTCAGACGGTTGGGTGTCCATTCGTCATCGTCATCAATCCCGGTGATATATTCCCCTTGCGCCAGCATAATCGCCTGGTTACGTACCGCGCACGCCCCGCTGTTAATGTCGTTGTGAATGTAAGTGATACGCGGATCGTTGAGGGCGGTGACGTACTGTTGCAGTTGTTCCCAGGAGGTGGAGCAATCATCCACGATGATCATCTCCCAGTTGCTGTAGTCCTGGCGCAAAACCGATTTTATTGCCCGAATCGCCAGTTGTTGGCGGTTCCAGGTCGGCATATAGATTGAGATCAGCGGATTGTTTTTCATAGGTTGTTCTCCCGGCTTATGAGCTGGTTTGCTTGCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCCTACGGGGCGGTGCGAATGCAGGCGTCGTTATTTCGCATCCGACTTATATTCGTATTCGTAATAGCCATAATCCTGATACGCGCTGGCGCGGCGGAAGATGGA > NC_000913/2133009‑2133564 | aCTTCGCCCTGGCAAACGTAGTCGTTAGCGTACAAAAAGGCGTGTGTGACCAGTTGCTGTTTATGGGCGAGGAAGACGCTCAGACGGTTGGGTGTCCATTCGTCATCGTCATCAATCCCGGTGATATATTCCCCTTGCGCCAGCATAATCGCCTGGTTACGTACCGCGCACGCCCCGCTGTTAATGTCGTTGTGAATGTAAGTGATACGCGGATCGTTGAGGGCGGTGACGTACTGTTGCAGTTGTTCCCAGGAGGTGGAGCAATCATCCACGCTGatcatc > 1:1114552/1‑282 (MQ=255)aCTTCGCCCTGGCAAACGTAGTCGTTAGCGTACAAAAAGGCGTGTGTGACCAGTTGCTGTTTATGGGCGAGGAAGACGCTCAGACGGTTGGGTGTCCATTCGTCATCGTCATCAATCCCGGTGATATATTCCCCTTGCGCCAGCATAATCGCCTGGTTACGTACCGCGCACGCCCCGCTGTTAATGTCGTTGTGAATGTAAGTGATACGCGGATCGTTGAGGGCGGTGACGTACTGTTGCAGTTGTTCCCAGGAGGTGGAGCAATCATCCACGATGatcatc > 1:574656/1‑282 (MQ=255) cGCCCTGGCAAACGTAGTCGTTAGCGTACAAAAAGGCGTGTGTGACCAGTTGCTGTTTATGGGCGAGGAAGACGCTCAGACGGTTGGGTGTCCATTCGTCATCGTCATCAATCCCGGTGATATATTCCCCTTGCGCCAGCATAATCGCCTGGTTACGTACCGCGCACGCCCCGCTGTTAATGTCGTTGTGAATGTAAGTGATACGCGGATCGTTGAGGGCGGTGACGTACTGTTGCAGTTGTTCCCAGGAGGTGGAGCAATCATCCACGATGATCAtct > 2:1425371/1‑279 (MQ=255) cggggaaaCGTAGGCGTTAGGGTGCAGAAAGGGGTGGTTGGCCAGTTGCTGTTTATGGGCGAGGAAGACGGTCAGACCGTGGGGTGTCCATTCGTCATCGTCATCAACCCCGAGGATATATTCCCCTTGCGCCAGCATAATCGCCTGGTTACGTACCGCGCACGCCCCGCTGTTAATGTCGTTGTGAATGTAAGTGATACGCGGAGCGTTGAGGGCGGGGACGTACTGTTGCAGTTGTTCCCAGGAGGTGGAGCAATCATCCACGATGATCATCTccc < 2:365177/273‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |