New junction evidence | |||||||||||
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tAGCCCGCGGTAATGGAAGTTAACCCGGCATAAGCGGGCAATGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTa < 1:290420/256‑1 (MQ=255) tAGCCCGCGGTAATGGAAGTTAACCCGGCATAAGCGGGCAATGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTa > 2:290420/1‑256 (MQ=255) gCCCGCGGTAATGGAAGTTAACCCGGCATAAGCGGGCAATGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTACTAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTCCAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTACCCATAATTCCCTCTGGCGTTCg > 1:242719/1‑289 (MQ=255) 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cgattagcccccccccctttcctctttgttttccgaccacattcaccggataaattttattctccTGTACGGATAAGTTTTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAg > 1:687060‑M2/66‑241 (MQ=255) cgattagcccccccccctttcctctttgttttccgaccacattcaccggataaattttattctccTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAg < 2:687060‑M2/176‑1 (MQ=255) gCAATGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAGCGATAATTCCCTCTGGAGTTCGAACAGACACGGGCTGTTCATCCAGACGATGAtt > 1:286743/1‑287 (MQ=255) 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tGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAGCGATAATTCCCTCTGGAGtt > 2:142514/1‑248 (MQ=255) tGCGCTAAAAATGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAGCGATAATTCCCTCTGGAGtt < 1:142514/248‑1 (MQ=255) aaaaaTGGCCGCCGCTAATAACGTCCGTTTTATCATTTTAATCTCCTGTACGGATAAGTTCTTGTCGGAGTGAATAAGTTCCGGTAGGTAAATTACGTTCTACAATCACGCGCGGGCCAAGTTGCGTGTTCGGGGAAATAATTCGCCCAGGCAAAATAATAACTTGTACGCCAAGGCGTGAACGCTGCCCGATATAACAACCTAATTTATCGCATCCGGTAGCGATAATTCCCTATGGAGTTCGAACAGACACGGGCTGTTCATCCAGACTATGATTACTGgtacgt > 2:643311/1‑287 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |