Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,649,036 | 0 | A | C | 4.2% | 358.2 / 3.3 | 98 | F1084V (TTT→GTT) | yfhM | bacterial alpha2‑macroglobulin colonization factor ECAM, anti‑host protease defense factor, periplasmic inner membrane‑anchored lipoprotein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/46); new base C (2/3); total (48/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCTTTGATATAACGTGCGATGTTCAGCGGTGGTTTGCCGCTCAACAACAATTGCCCTTCCAGCGTAACAGGCGAGAAGTTTTGCAATCCATCCGCCGGAATCGCCCATGTCTCACCAGGCTGTAACGCCGTACCGTAATTAACCGTTTGTGCCGGGAACGCCGGACGGACGCCGATTTTCCACTGCTTATGCTGATCGGCAACGGTTTCACCCGGTAACGCTAACCCGCTAATGGTGGCCTGAATTTCTCCATCGCCATAACCCGGCAATGCTCGCACCGGGATAAACAGCGTAGTACGCACACCTGGCGCTAATTCAACGGCTGCGGGTGAATCGCTGACCAGTTCAAGCAAACCACTGGCGGTCAGGGCAACGTTCAGTTTTTGCGGTTTATCGGTAAGATTAGTGATATCCAGCGTCAGACGCGAGGTATCGCCACTCGCCATAAAGCGCGGCATGTTCAGTTCAGCAATCACCGGTGCGGCAACTATCACTTTACTTTCGTTGCTACCGAAGTCATCTGCCGTCCAGGCTTGCGCCATGACGCGCAATTCACCGTTAAAATCGCCA > NC_000913/2648750‑2649319 | tctTTGATATAACGTGCGATGTTCAGCGGTGGTTTGCCGCTCAACAACAATTGCCCTTCCAGCGTAACAGGCGAGAAGTTTTGCAATCCATCCGCCGGAATCGCCCATGTCTCACCAGGCTGTAACGCCGTACCGTAATTAACCGTTTGTGCCGGGAACGCCGGACGGACGCCGATTTTCCACTGCTTATGCTGATCGGCAACGGTTTCACCCGGTAACGCTAACCCGCTAATGGTGGCCTGAATTTCTCCATCGCCATAACCCGGCAATGCTCGCACCGGGATAAACa < 1:262838/289‑1 (MQ=255) 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gATAAACAGCGTAGTACGCACACCTGGCGCTAATTCAACGGCTGCGGGTGAATCGCTGACCAGTTCAAGCAAACCACTGGCGGTCAGGGCAACGTTCAGTTTTTGCGGTTTATCGGTAAGATTAGTGATATCCAGCGTCAGACGCGAGGTATCGCCACTCGCCATAAAGCGCGGCATGTTCAGTTCAGCAATCACCGGTGCGGCAACTATCACTTTACTTTCGTTGCTACCGAAGTCATCTGCCGTCCAGGCTTGCGCCATGACGCGCAATTCACCGTTAAAATCGCCa > 1:489460/1‑289 (MQ=255) | TCTTTGATATAACGTGCGATGTTCAGCGGTGGTTTGCCGCTCAACAACAATTGCCCTTCCAGCGTAACAGGCGAGAAGTTTTGCAATCCATCCGCCGGAATCGCCCATGTCTCACCAGGCTGTAACGCCGTACCGTAATTAACCGTTTGTGCCGGGAACGCCGGACGGACGCCGATTTTCCACTGCTTATGCTGATCGGCAACGGTTTCACCCGGTAACGCTAACCCGCTAATGGTGGCCTGAATTTCTCCATCGCCATAACCCGGCAATGCTCGCACCGGGATAAACAGCGTAGTACGCACACCTGGCGCTAATTCAACGGCTGCGGGTGAATCGCTGACCAGTTCAAGCAAACCACTGGCGGTCAGGGCAACGTTCAGTTTTTGCGGTTTATCGGTAAGATTAGTGATATCCAGCGTCAGACGCGAGGTATCGCCACTCGCCATAAAGCGCGGCATGTTCAGTTCAGCAATCACCGGTGCGGCAACTATCACTTTACTTTCGTTGCTACCGAAGTCATCTGCCGTCCAGGCTTGCGCCATGACGCGCAATTCACCGTTAAAATCGCCA > NC_000913/2648750‑2649319 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |