| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 4 (0.080) | 51 (1.080) | 43/282 | 0.1 | 92.7% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292890‑1293172 | gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt > 2:822068/1‑143 (MQ=255) cgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctt < 2:618164‑M1/2‑1 (MQ=255) tgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTtgtg < 1:786716‑M1/5‑1 (MQ=255) tgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc < 1:717881/143‑1 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg > 1:151774/1‑143 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAAGTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAACTTGTTCTTTATTTAGTgacg > 2:8162/1‑143 (MQ=255) gAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTAGAGATAAAACTAATACCAGAAACGCGTTTGTGCAATAGCCAGGCATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggta < 1:191225‑M2/143‑5 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa > 1:294654‑M2/1‑138 (MQ=255) gcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaata < 1:396851‑M1/14‑1 (MQ=255) ttttAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAACTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatg < 2:7419‑M2/143‑8 (MQ=255) gtgcgtctgccgtgaggtgccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcaccgcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataaat > 2:561596‑M1/127‑143 (MQ=255) aaGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactc > 2:508391‑M2/1‑132 (MQ=255) ttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCGGCCAATAAATATCt < 1:2059‑M1/21‑1 (MQ=255) tttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCAAATAAATATCtt < 2:41985‑M1/22‑1 (MQ=255) ccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAAGAAATATCTTTTCa < 1:661660‑M1/26‑1 (MQ=255) gCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatt > 1:185666‑M2/1‑123 (MQ=255) ttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctccaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa < 2:460344‑M1/29‑1 (MQ=255) tCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattga < 1:659600‑M2/143‑23 (MQ=255) acgcaccaccccgtcaggagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaaaa > 1:479719‑M1/113‑143 (MQ=255) aTTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgata > 1:590348‑M2/1‑119 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcataccctaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 2:95613‑M1/35‑1 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAg < 1:334929‑M1/35‑1 (MQ=255) ccacaccgtcagtagctgaacaggagggacagctgacagaaacagatgccactggagcccctcaaaaactccatcttccactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 2:59120‑M1/108‑143 (MQ=255) cccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTCGCCAGa < 2:41489‑M1/40‑1 (MQ=255) agctcgaACTTATATCGGGGTGGTTTGTTGAGGTAAGAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttat > 2:619144‑M2/3‑110 (MQ=255) aTCTCGAGCTTTTATTGGGTTGGTTTGTTGAGGTGATAATAGGGCCTTAAGTTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgtctccaacttattgatagtgttttat > 2:656870‑M2/1‑110 (MQ=255) tcAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTGTTTGTTGTGGACCGgaaaatgacgccgatgtattgatagtgttttatgtt < 1:185006‑M2/143‑37 (MQ=255) cAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGCTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttc > 1:828611‑M2/1‑106 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATACATATCTTTTCCTAAAATTACCCAGCAAAGAcgc < 2:290838‑M1/48‑1 (MQ=255) gttgtgagcatgagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAcgc > 2:708808‑M1/96‑143 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaaggtggcagcatcagcTTGTGCCGCCAATAATTATACTGCCGTAAAATTAGCTGTAGAAGACGCGGc < 2:579522‑M1/51‑1 (MQ=255) tgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCa < 2:733210‑M1/52‑1 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat < 1:762766‑M1/55‑1 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagtgggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat > 2:770569‑M1/89‑143 (MQ=255) aggagggagagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTGTTCATAAAAGTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAg > 2:351294‑M1/87‑143 (MQ=255) ggtggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgtccgat < 1:175853‑M2/143‑52 (MQ=255) gagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacacaatcatacactaactgagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCAAGAAAAGACGCGGCAGATAGcc < 2:66727‑M1/59‑1 (MQ=255) tggtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTGAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga < 2:791594‑M2/143‑54 (MQ=255) gtTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGACAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTATTTATTTTGTGCCGggtaatgaccccaccttattgatagtgttttatgttcagctaatgcccgctgact < 1:83965‑M2/143‑56 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcaccccaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTAtt > 2:519903‑M1/80‑143 (MQ=255) tgACGTAATCATAGATCCGTAAATTCAGTTGTGCAAGAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:469896‑M2/1‑82 (MQ=255) gTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgcctttgtcatgca < 1:386566‑M2/143‑66 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtacgttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATCTACACCgat < 2:423418‑M1/73‑1 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc < 1:8452‑M2/143‑68 (MQ=255) aaacagcagccactggagcacctcaacaacaccatcctacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGGCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatga > 2:22846‑M1/69‑143 (MQ=255) ataataGGAGCTTAGATGCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagct > 2:654321‑M2/1‑75 (MQ=255) gCCTTAAATGCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgat > 2:622368‑M2/1‑67 (MQ=255) actggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCAc < 1:94387‑M1/86‑1 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGCATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt > 1:26832‑M2/1‑64 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 1:457608‑M2/143‑80 (MQ=255) aaaTTCAGTTGTGCCACAGCCAAGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga > 1:514673‑M2/1‑62 (MQ=255) gtgcacctcaaaaacaccatcttaccgtcaatcattaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTGTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGa > 2:361241‑M1/54‑143 (MQ=255) aTTAAGTTGTGCAATCGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgaggtctttgtcatgcagctccaccgattttgaga > 2:434100‑M2/1‑60 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggccgcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATCAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATCTCGCAGCACGTGAgg < 2:389718‑M1/92‑1 (MQ=255) gcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAgg < 2:389724‑M1/92‑1 (MQ=255) tCAGTTGTCCAATAGCCAGGAATGTAAGGCATTCAAAATTGTTCTTGATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttctatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 1:76918‑M2/1‑58 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATATATATCTTTACATAGAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGt < 1:423304‑M1/93‑1 (MQ=255) tcaagaacaccatcatacactaaatcagtaagttagcagcaacgccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAATATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCTGCACGTGAGGTTaaa > 2:200555‑M1/47‑143 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGACCAGACGCGGAATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACCTCAGGTTaaa < 2:244414‑M1/97‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGCGAGGCTaaa < 2:22583‑M1/97‑1 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaaccagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa > 2:755046‑M1/47‑143 (MQ=255) caaaaacaccatcagacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaaa > 2:334655‑M1/46‑143 (MQ=255) tgCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcg < 1:370455‑M2/143‑93 (MQ=255) aaTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact < 2:519801‑M2/143‑96 (MQ=255) aTAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgactt > 1:447283‑M2/1‑47 (MQ=255) ccAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgt > 2:413031‑M2/1‑43 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc < 2:451067‑M2/143‑102 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaaggactccaacttattgatagtgttatatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgccagcgacttccgtc < 2:96804‑M2/143‑102 (MQ=255) aGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcc < 2:398686‑M2/143‑103 (MQ=255) tgcgctgaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGGCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATg > 2:415561‑M1/32‑143 (MQ=255) gAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca > 1:139197‑M2/1‑39 (MQ=255) gAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca > 1:493481‑M2/1‑39 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCATGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 1:524299‑M1/31‑143 (MQ=255) ggtAAGGAATTCAAGATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcc > 2:501833‑M2/2‑36 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTca > 2:35082‑M1/29‑143 (MQ=255) ctaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTcac < 1:493422‑M1/116‑1 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACAt < 1:828404‑M1/118‑1 (MQ=255) aGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccctgc < 2:464748‑M2/143‑112 (MQ=255) gAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcca < 1:190115‑M2/143‑114 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTa > 2:334929‑M1/22‑143 (MQ=255) agtaagttggcagcctacccTTGTGCCGCCAATAAGTATCTCTTCATAAAATTAGCCAGGAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTAt > 2:188076‑M1/21‑143 (MQ=255) tatgctggcagcatcagcGTGTGCCGCCAGTCAATAGCTTTTCATAAAATTAGCCAGTAAGGACGCGGCATAGAGCCCTATGTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgg > 2:88977‑M1/19‑143 (MQ=255) taagctggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAACGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCCCGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCCTTTCACCTTTTATgg < 2:595040‑M1/125‑1 (MQ=255) agttggcagcatcaccTGGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTGCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgggg > 1:627759‑M1/17‑143 (MQ=255) agcgggcagcaacaccCTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgggg > 1:627766‑M1/17‑143 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagctaatgcccgatgactttgtcatgctgctccgccgattttcagaacgacagcgccttcagtccccgccgtgcccgggggt < 2:70122‑M2/143‑120 (MQ=255) aaaaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct < 1:170769‑M2/143‑120 (MQ=255) aaTTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcggcttccgtcccagccctgccaggtgctgc < 1:33227‑M2/143‑122 (MQ=255) tggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAATATTAGCCAGCTGTGTCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGGGGTTATTTCTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgaga > 2:210592‑M1/14‑143 (MQ=255) ggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAACGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGGCACATTTTATGcggaggt < 2:466419‑M1/131‑3 (MQ=255) ggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGTGAGAt < 2:681685‑M1/131‑1 (MQ=255) cagcatcaccTTCTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTa > 2:414654‑M1/11‑143 (MQ=255) tCTTTATTGTGTGCCGgttaatgactccaacttagtgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcaga > 1:759257‑M2/1‑16 (MQ=255) catcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCg > 1:255624‑M1/8‑143 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 1:687083‑M2/143‑130 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 1:765742‑M2/143‑130 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc < 1:629062‑M1/141‑1 (MQ=255) | GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGC > NC_000913/1292890‑1293172 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |