| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 723,107 | (CAC)4→3 | 2.8% | coding (1306‑1308/2685 nt) | kdpD ← | fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE: signal sensing protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 723100 = | 109 (0.730) | 3 (0.020) | 3/440 | NT | 2.8% | coding (1315/2685 nt) | kdpD | fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE: signal sensing protein |
| ? | NC_000913 | = 723096 | 102 (0.710) | coding (1319/2685 nt) | kdpD | fused sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with KdpE: signal sensing protein | |||||
CCGGCCTCGCGCCGCTGGTGGCGTCGGGAAACGTTTGCTGACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/723382‑723100‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggtggtggCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGATCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCAACGCACACGGCACTTATATGAAATGTCGAAAGCTCTGGCGGTGGGCCGCAGTC < NC_000913/723096‑722833 cttgccacggtccgacgttggctgCGGGTAACGGTTGCTTACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGT < 2:435209/251‑1CCGGCCTCGCGCCGCTGGTGGCGTCTGGAAACGTTTGCTGACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGT < 2:1107153/275‑1 CGGCCTCGCGCCGCTGGTGGCGTCGGGAAACGTTTGCTGACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGCTCTCGATCAGGAGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGACGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGT < 1:1085848/274‑1 GCGCCGCTGGTGGCGTCGGGAAACGTTTGCTGACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGG > 1:1267461/1‑275 gggCGCTGGGGGCGTCGGGAAACGTTTGCGGCCCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGG < 2:145038/271‑1 CGCCGCTGGGGGCGTCGGGAAACGTTGGCTGACCGCCTGGCGCGCAGCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACACCGCGCCGGATAACCGCTCGTTTAGAGACAAGGGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGGTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGG < 2:1570506/274‑1 ATCAGGTGCTGGTCGGGCTTGAGGAACCCCCCGCCCGAACCATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAATGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGGCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGAT < 2:1271269/275‑1 TGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGGGGTGGCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGGTT > 1:1271270/1‑262 AGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGGCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGATCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCAA < 1:1462073/275‑1 tgtgtGTGGCGGTGGTATTTTATGGCGGCCGGCCTGTATGTGTGGCACCCGTCTGTAATGTAGTGGGTTTTGATCTCTTTTTTGTAGCCCCACGGGGCACGCTGGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGTTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCGGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCAACGCACACGGCACTTATATGTAATGTCGAAAGCTCTGGCGGTGGGCCGCAGT < 2:854649/270‑1 GTGGTGGTGGCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGATCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGGGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCAACGCACACGGCCCTTATATCAAATGCCTAAAGCTCTTGCGGGGGGC > 2:1149858/1‑267 GTGGTGGTGGCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGACCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCACCGCACACGGCACGTATATGAAATGTCGAAAGCTCTGGCGGTGGGCCGCAGTC > 1:1456377/1‑274 GCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGATCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCG > 2:478174/1‑191 CCGGCCTCGCGCCGCTGGTGGCGTCGGGAAACGTTTGCTGACCGACTGGCGCGCATCGCCCCCGATCTCGATCAGGTGCTGGTCGCGCTTGATGAACCACCCGCCCGCACGATTAACAACGCGCCGGATAACCGCTCTTTTAAAGACAAGTGGCGTGTACAAATTCAGGGATGCGTGGTTGCCGCCGCGTTATGCGCCGTTATCACCTTAATTGCCATGCAGTGGCTGATGGCGTTTGATGCCGCCAACCTGGTGATGCTGTATCTGCTTGGCGTGGTGGTGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/723382‑723100‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gtggtggtggCGCTATTTTATGGACGCTGGCCTTCAGTGGTTGCCACCGTCATTAATGTAGTGAGTTTCGATCTCTTTTTTATCGCCCCACGCGGCACGCTCGCCGTCTCTGATGTGCAATATCTGCTGACCTTCGCGGTGATGTTAACCGTCGGGCTGGTGATCGGGAACCTTACTGCTGGCGTGCGTTATCAGGCGCGGGTAGCCCGTTACCGCGAGCAACGCACACGGCACTTATATGAAATGTCGAAAGCTCTGGCGGTGGGCCGCAGTC < NC_000913/723096‑722833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |