| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2671660 | 79 (0.980) | 3 (0.040) | 3/488 | NT | 3.7% | coding (438/813 nt) | hcaB | 2,3‑dihydroxy‑2,3‑dihydrophenylpropionate dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 2671669 | 81 (1.030) | coding (447/813 nt) | hcaB | 2,3‑dihydroxy‑2,3‑dihydrophenylpropionate dehydrogenase | |||||
GCGGTGGAAGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGCGCGGCCCACAGGCGCTCGGGCAAAGTGAAACCTCGATAATGCAGTCTCTGACGCCGGAGAAAATTGCCGCCATTTTACCGCTGCAATTTTTCCCGCAACCGGCGGATTTTACGGGGCCGTATGTGATGTTGACATCGCGGCGCAATAATCGCGCA > NC_000913/2671388‑2671954 | gCGGTGGAAGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGCGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGGCTGGTAACCTGgcggcg > 1:702542/1‑289 (MQ=255) gTGGAAGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTg > 1:131846/1‑289 (MQ=255) tGGAAGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTg < 1:137666/288‑1 (MQ=255) tGGAAGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTg < 1:362692/288‑1 (MQ=255) aGGTAACGTGACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCg < 2:131846/289‑1 (MQ=255) gACCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTacac < 1:261908/288‑1 (MQ=255) aCCTGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACAcc > 2:474988/1‑288 (MQ=255) ccTGGTAGGCCGAGTATCAACGCGCGGTCGATCAGAGCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCg < 2:195041/288‑1 (MQ=255) tGTTATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCg < 1:463204/286‑1 (MQ=255) ttATGCCGATTATCAACGCGCGGTCGATCAGATCCTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGCTGCCCGCTGTACCCCGCCAg > 2:354627/1‑288 (MQ=255) 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ccTGACTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTg > 1:670083/1‑289 (MQ=255) aCTCGTTCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCtt > 2:598698/1‑289 (MQ=255) tCCGGCAAGCTGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGa > 2:366911/1‑287 (MQ=255) tGGATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGTCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAGACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGa < 2:197762/288‑1 (MQ=255) gATTGTTTTATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAg > 1:487097/1‑289 (MQ=255) ttttATCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCgg < 1:740887/289‑1 (MQ=255) tCGGCAATGCGGAGATTTGGGATCACAAGTCCGCATGGGTTAATACTCCCGCGGAGACGCTCGAACCCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGaa < 2:710679/289‑1 (MQ=255) tCGGCAATGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGTGGGTGaa < 1:53236/289‑1 (MQ=255) aaTGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCg > 1:660885/1‑289 (MQ=255) tGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTc < 1:70265/289‑1 (MQ=255) tGCAGGCATCTGGGATCACAATGCCTCACAGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGCAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCTACAGTGCGGGTGAATGCCGTc > 2:602888/1‑289 (MQ=255) ggCAGGCATCTGGGAGCACAAGGCCTAAATGGTTAATACTCCCGAAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCGGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCggg < 2:341961/277‑1 (MQ=255) aTCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCgt < 1:366911/289‑1 (MQ=255) aTCTGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCgt > 1:205628/1‑289 (MQ=255) tGGGATCACAATGCCTCACTGGTTAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGt > 1:341961/1‑278 (MQ=255) 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ggTGAATCCTCCCGCGGAGAAGACCGAAACCGGCGTCCACGAGCTGTTTAACGTGAAGGGTCTCGGGTACCTGGTGGGCGGAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAGGGCAGCATGATTTTCAGACTGTCAAATGCCGCCTGGTAGCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTgcg < 2:583534/288‑1 (MQ=255) ttAATACTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGcgcg > 1:606849/1‑288 (MQ=255) cTCCCGCAGAGACGCTCGAAACCGGCTTCCACGAGCTGTTTAACGTCAATGTTCTCGGTTACCTGCTGGGCGCAAAAGCCTGCGCTCCGGCGTTAATCGCCAGTGAAGGCAGCATGATTTTCACACTGTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGCGCGGCCcaca < 1:474988/289‑1 (MQ=255) 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gTCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGCGCGGCCCACAGGCGCTCGGGCAAAGTGa < 1:109704/180‑1 (MQ=255) tCAAATGCCGCCTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCCGCTGTACACCGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCGTCGGCCCGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGCGCCGCCCACAGGCGCTCGCGCAAAGTGAAACCTCGATAATGCAGGCTCTGACGCCGGAGAAAATTGCCGCCATTTTCCCGCTGCAATTTTTACCGCAACCGCCGGATTTTACGGGTCCGTATGTTATGTTGACATcc > 1:678893/1‑287 (MQ=255) cgccTGGTATCCTGGCGGCGGTGGCCGGCTGTACACAGCCAGTAAACATGCCGCAACCGGACTTATTCGCCAACTGGCTTATGAACTGGCACCGAAAGTGCGGGTGAATGGCTTCGGCACGTGTGGTATGGCCAGCGACCTGCGCGGCCCACAGGCGCTCGGGCAAAGTGAAACATCGATAATGCAGTCTCTGACGCCGGAGAAAATTGCCGCCATTTTACCGCTGCAATTTTTCCCGCAACCGGCGGATTTTACGGGGCTGTATGTGATGTTGACATCGCGGCGCcat > 1:417454/1‑289 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |