New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 1153312 = | 73 (1.380) | 3 (0.060) | 3/478 | NT | 4.6% | coding (13/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
? | NC_000913 | 1153646 = | 54 (1.050) | coding (347/810 nt) | pabC | 4‑amino‑4‑deoxychorismate lyase component of para‑aminobenzoate synthase multienzyme complex |
CAACCTGGATAACCCGGATGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGAGGGTACAGCACATT > NC_000913/1153039‑1153583 | cAACCTGGATAACCCGGAGGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCttaattaa < 2:286686/275‑1 (MQ=255) 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aTGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAAt > 2:82805/1‑275 (MQ=255) aaGGTGGCGATCTTGATTTCGTAACGCACGAATCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGATGCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGGTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTGCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGc < 1:234467/275‑1 (MQ=255) ggTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTAGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGCTCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATCAAAGGTCCGATTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTACCAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGATCTTAATTAACGGTTCTCAGCAGGAATCGTTg > 1:136751/1‑275 (MQ=255) 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tttATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACa < 2:27278/205‑1 (MQ=255) aCTTTTTCCGTAGTGAACATGCTTCCCCACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGaa < 2:396130/275‑1 (MQ=255) tAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCt > 2:116575/1‑229 (MQ=255) 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gctgcCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAGGAGATGAAAACGCTGCCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGaa > 2:174732/1‑275 (MQ=255) gctgcCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGAATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGCTGATTTCCTGTGGCTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGGTGAAAACGCTGGCCGCAGCACAGAAAAATGGTGTTCTGaa > 2:344359/1‑275 (MQ=255) aaTTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTc > 1:371486/1‑275 (MQ=255) 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ccGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGa > 1:161985/1‑275 (MQ=255) tATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGgt < 2:362409/232‑1 (MQ=255) gTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGTGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGAGGGTACa < 1:10108/275‑1 (MQ=255) 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aattaaCGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCCGCAGAACAGCAAAATGGTTTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGAGGGTACAGCACAt > 1:71864/1‑275 (MQ=255) ttaaAGGTCGTAAGCAGAGATCGCTGGCAGTAAACGTTCTGGCAACGCAGTTTTGTTATGTTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAATTCAGTGTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACATGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGAGGGTACAGCACAtt < 2:136751/274‑1 (MQ=255) | CAACCTGGATAACCCGGATGAAGGTTGCGATCTGGATTTCGTACCGCACGAAGCGCGTCAGGTTAGCGGAATGGAATACACTCTGTGTAACTCCTTCGGCTTCGGTGGCACTAATGGTTCTTTGATCTTTAAAAAGATCTAAGTTGTCATTTTCCACCCTTATAAAAGGTCCGCTTGCGGGCCTTTTTTCTTAGCTTTTATTCCGACTTGTTCCGTAGTGAACATGCTGCCACACTAACAATTCTCTGATAAGGAGCCGGTATGTTCTTAATTAACGGTCATAAGCAGGAATCGCTGGCAGTAAGCGATCGGGCAACGCAGTTTGGTGATGGTTGTTTTACCACCGCCAGAGTTATCGACGGTAAAGTCAGTTTGTTATCGGCGCATATCCAGCGACTACAGGATGCTTGTCAGCGGTTGATGATTTCCTGTGACTTCTGGCCTCAGCTTGAACAAGAGATGAAAACGCTGGCAGCAGAACAGCAAAATGGTGTGCTGAAAGTCGTGATCAGTCGCGGTAGTGGCGGGCGAGGGTACAGCACATT > NC_000913/1153039‑1153583 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |