New junction evidence | |||||||||||
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atgggtatccggcacgttgatcacggcaaccccgtcggcatgcgggtaaacagggtgaatatgcaattcgccaaaacgctgggccaGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTAc > 1:58013‑M1/87‑289 (MQ=255) gggTGAATTTCTCGCAACTGACGTGGTGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGGTCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATAAACCCTTTAcgccg > 1:61678/1‑288 (MQ=255) gggTGAATTTCTCGCAACTGACGTGGTGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCCTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATAGCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGCCCTGACGCGCCCGTTAAGCGATCATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCGGCGCCATCAGTCGGTGTTTCTAcgccgtctcttatccacttctc > 1:421197/1‑270 (MQ=255) gtctgGCAACTGACGTGGTGCTGGCGGGGGTCGCGGGGATTGGGGTTATCGCCTTTCTTTTAGACATGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCaa < 1:282873/288‑1 (MQ=255) gggggCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTGGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCAACGCGCGCTGGCCCa < 1:424756/284‑1 (MQ=255) tGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCAACGCGCGCTGGCCCAGCGTTTTGGCGAATTGCATATTCAcc < 2:375288/289‑1 (MQ=255) tCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCAACGCGCGCTGGCCCAGCGTTTTGGCGAATTGCATATTCACCCTGTTTa > 2:143333/1‑288 (MQ=255) taacgcGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCgcagcagc > 1:209455‑M1/7‑220 (MQ=255) taacgcGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCgcagcagc < 2:209455‑M1/214‑1 (MQ=255) gggTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATACTCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGCGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCAACGCCCGCTGGCCCAGCGTTTTGGCGAATTGCCTCTTCACCCTGATTACCCGCATGCCGAAGGGGTTg > 1:33477/1‑289 (MQ=255) | AAAAGCGTGCAGCAGGTTCGCATTCGTGCCGCCCAGTCGCTGGGTGCCAGCCGTGCGCAGGTGCTGTGGTTTGTCATTTTGCCCGGTGCGCTGCCGGAAATCCTCACCGGATTACGTATTGGTCTGGGGGTGGGCTGGTCTACGCTGGTGGCGGCGGAGCTGATTGCCGCGACGCGCGGTTTAGGATTTATGGTTCAGTCAGCGGGTGAATTTCTCGCAACTGACGTGGTGCTGGCGGGGATCGCGGTGATTGCGATTATCGCCTTTCTTTTAGAACTGGGTCTGCGCGCGTTACAGCGCCGCCTGACGCCCTGGCATGGAGAAGTACAATGAGTGAACG‑TCTGAGCATTACCCCGCTGGGGCCGTATATCGGCGCACAAATTTCGGGTGCCGACCTGACGCGCCCGTTAAGCGATAATCAGTTTGAACAGCTTTACCATGCGGTGCTGCGCCATCAGGTGGTGTTTCTACGCGATCAAGCTATTACGCCGCAGCAGCAACGCGCGCTGGCCCAGCGTTTTGGCGAATTGCATATTCACCCTGTTTACCCGCATGCCGAAGGGGTTG > NC_000913/387466‑388032 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |