| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1685320 | 61 (1.210) | 6 (0.120) | 6/472 | NT | 10.3% | coding (1269/1404 nt) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II |
| ? | NC_000913 | = 1685547 | 46 (0.940) | coding (1042/1404 nt) | fumC | fumarate hydratase (fumarase C),aerobic Class II | |||||
ATTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTT > NC_000913/1685036‑1685608 | aTTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTcg > 1:95270/1‑288 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 2:390573/289‑1 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 2:209604/289‑1 (MQ=255) aCTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCt < 1:196428/289‑1 (MQ=255) tGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCttt > 2:228296/1‑289 (MQ=255) aTTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCCACCCCGGCCGCTTTGt > 1:211448/1‑289 (MQ=255) ggATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAAcc < 2:201131/288‑1 (MQ=255) aTAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAAt > 2:412495/1‑289 (MQ=255) tGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTgg < 2:95270/289‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTggg > 2:8253/1‑289 (MQ=255) 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aCCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGCCgttca > 2:304793/1‑289 (MQ=255) aCCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACgttca > 2:490329/1‑289 (MQ=255) gCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGc > 2:138855/1‑142 (MQ=255) gCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGc < 1:138855/142‑1 (MQ=255) 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gcAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTgatcg > 2:14656‑M2/1‑281 (MQ=255) cAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGAcag < 2:418952/289‑1 (MQ=255) aGCCCTTCTTTATGCGTTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCCTTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCACATGTTGACCGCCACGTCGTTACCAATCACCTCAcag > 1:379068/1‑288 (MQ=255) 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ttgtttGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTAACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGcc < 2:322610/286‑1 (MQ=255) tGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGGTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGGTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCGTGTTGTTCGCCACGTCGTTCCCCGGCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 1:127112/289‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTCCGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGGTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTcaca < 1:123539/289‑1 (MQ=255) cGATCaacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgc > 2:14656‑M1/1‑5 (MQ=255) tCaacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgcgctggg < 1:14656‑M1/289‑288 (MQ=255) caacatggggggcgcttccggtaactttgaactgaacgtcttccgtccaatggtgatccacaatttcctgcaatcggtgcgcttgctggcagatggcatggaaagttttaacaaacactgcgcagtgggtattgaaccgaatcgtgagcgaatcaatcaattactcaatgaatcgctgatgctggtgactgcgcttaacacccacattggttatgacaaagccgccgagatcgccaaaaaagcgcataaagaagggctgaccttaaaagctgcggcccttgcgctgggg < 2:123539‑M1/289‑289 (MQ=255) | ATTGCACTGATTAATCGGGATAATGGCGCGGGCGTGCCGGACGTTGGTGAGTTGTTAAATTACGATGCCGACAATGTGCAGCACCGTTATAAACCTCAGGCGCAGCCGCTTCGTTTGATCATTCCACGGCTGCACCTGTATGTTGCAGATTAACGCCCGGCTTTCATACTGCCGACCATCTGTTCTGGCCGTACCCAGCTGTCAAACTCGGCTTCGCTAAGATACCCCAGCGCAAGGGCCGCAGCTTTTAAGGTCAGCCCTTCTTTATGCGCTTTTTTGGCGATCTCGGCGGCTTTGTCATAACCAATGTGGGTGTTAAGCGCAGTCACCAGCATCAGCGATTCATTGAGTAATTGATTGATTCGCTCACGATTCGGTTCAATACCCACTGCGCAGTGTTTGTTAAAACTTTCCATGCCATCTGCCAGCAAGCGCACCGATTGCAGGAAATTGTGGATCACCATTGGACGGAAGACGTTCAGTTCAAAGTTACCGGAAGCGCCCCCCATGTTGATCGCCACGTCGTTCCCCATCACCTGACAGCAGAGCATGGTTAATGCCTCACACTGTGTT > NC_000913/1685036‑1685608 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |