| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3252195 = | 6 (0.080) | 84 (1.080) | 60/280 | 0.2 | 93.3% | intergenic (+187/‑107) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 3583427 = | NA (NA) | intergenic (+10/‑55) | yrhA/insA | pseudogene, interrupted by IS1E/IS1 repressor TnpA | |||||
ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3252334‑3252195‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > NC_000913/3583427‑3583567 ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGT > 1:994486/1‑143ATAATTTTTTAGGACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATGTTGCTCAATAACCTCTCGTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGT < 2:437544/143‑1 AATTTTTTAGTAC‑TTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGCGACTGAACTGCCAGTAAGTATGCGTTCAAGGACTTAATAAAGTGCCGTGGGTGAT > 1:954893/1‑143 TTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTACGAAGAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATG < 2:1211724/143‑1 TTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCTCTTGTTTTTAGAG‑AGCAAAAGTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGC < 1:735495/143‑1 TTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑ACATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAACTATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGC > 1:751290/1‑143 TAGTACTTTCAGCTATCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGGATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCC < 1:464063/143‑1 GTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAA < 1:357052/143‑1 GTACTGTCAGATACCAGTCCAGTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGGGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAA < 1:1177927/143‑1 CTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTT > 2:404677/1‑143 gAGATACCAGTTCTTTTTTGACACAATGTGGCTCAATCACGTGTTTTTAAAGCAGC‑AAAGTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTG < 2:616888/142‑1 AGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGA < 1:204422/143‑1 GATACCAGTCCATTTTAGCCTCAATTTTGCTCCATCACTTGTGTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGGAGTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGAT < 1:663126/143‑1 ATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTCAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATTGCAGTAAATCTTCGTTCTAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGAGATGCAGACAACTTACTGATT > 1:1244313/1‑143 TACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCCATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTT < 1:316641/143‑1 ACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA > 1:7190/1‑143 ACCAGTCCATTTTTGCCTCAATGTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTA < 1:145366/143‑1 ctcttCATTTTTTCCTCAATTTTTCTCAATCACTTGTTTTTCAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGTAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 1:944746/138‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 1:934822/1‑143 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT > 2:972934/1‑143 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:1311511/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:45940/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGT < 2:934822/143‑1 CAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACCGATTTAGT > 2:972886/1‑143 AGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAACTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTG < 2:876962/143‑1 GTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGT > 1:1180846/1‑143 TCCATTGTTGCCTCAATTTGGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTA < 1:754129/143‑1 ATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 1:266536/1‑143 ATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGA > 2:455971/1‑143 gcaagcagccgCAACCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGGGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT < 2:37709/132‑1 TCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:80725/1‑143 TCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTT > 1:801997/1‑143 acTTTTGCCCAATCACTGGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAACGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTG < 2:215797/141‑1 agTTTGCTCAATCACTTGTTTTCAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 2:326525/141‑1 ATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGA < 1:1146331/143‑1 TTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCTAACTTATTGATTTAGTGTATGATGTTGTTTTTGAG > 1:1253101/1‑143 TTTGCTCGATCACTTGTTTTTAACGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGG < 1:252794/143‑1 TCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGT < 1:247400/143‑1 TCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCGCCAct > 2:232632/1‑141 ACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGG > 1:1287084/1‑143 CTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGACTTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGCGCTCCAGTGGC > 1:1265988/1‑143 CTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGC > 2:577772/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCACCTTACTGATTGAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCT > 1:29778/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTCCTGATTTAGTGTACGATGATGTTTTTGAGCTGCTCCAGTGGCT > 2:128341/1‑143 TTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTCCAGTGGat > 1:103873/1‑141 TTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTTGTGTATGCTGCTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 1:166380/143‑1 TTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGCGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTCAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTG < 2:954893/143‑1 TTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 2:748900/1‑143 TTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTT > 1:1344185/1‑143 TAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTT < 1:404677/143‑1 AAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTC < 1:200043/143‑1 AAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCT > 1:51098/1‑143 AGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTAAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGTGGTGCTCCAGTGGCGTCTGTTTCTA > 2:813142/1‑143 GC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTCTGATGGTGTTTTTGAGCTGCTCCACTGGCACCTGTTTCGATCAG > 1:258023/1‑143 C‑AAATTAAGAATAGATGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATGTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGC < 1:130999/143‑1 AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCT < 1:748900/143‑1 cTTAAGAATAGACGTGAGTGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATACAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGT < 2:154340/142‑1 AAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCC > 2:1322421/1‑143 ATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCTCTCCT > 1:963945/1‑143 GTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG > 2:863311/1‑143 GTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCGGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAG < 2:626129/143‑1 AATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTc > 2:275070/1‑142 AATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTA < 2:801997/143‑1 aaggcacgacATATTCGTGCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 2:178323/133‑1 ATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACG < 2:30178/143‑1 GCAGTAGATATTCGGTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGG < 1:608165/143‑1 TAAATATTCGTTCCAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 2:76922/143‑1 TAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCTAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT < 2:994486/143‑1 TAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTGCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGT > 2:735006/1‑143 TATTCGATCAAGCAATTAATAAAGTGCCGTGGGGGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGT < 1:1158722/143‑1 ctTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTAACTGATTTAGTGTATGATGGTGGTTTTGAGGTGCTGCAGTGGCGTCTGTGTCTATCAGCTGGCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 1:880012/141‑1 CGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 1:577772/143‑1 CGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACG < 2:1344185/143‑1 TTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGC < 2:193576/143‑1 CAAGGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTACTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCGGCTGTCCCTCCCGTTCAGCTACCGACGCGGTGtggcggaccgggca > 1:1350525/1‑129 GGAATTAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGCGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAG > 2:849954/1‑143 ATTACTAATGTGCCGTGGGTGCTGCTGCCGTCTTACTGATTTAGGGTATGATGTTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCAC < 2:501178/143‑1 TAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACCGCAACAACACCG > 1:942548/1‑143 TAATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGGGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCG > 2:1331680/1‑143 ATAAAGTGCCGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCC > 1:567025/1‑143 CGTGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAACAGCCCCCCCGCACAcccg > 1:489982/1‑139 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTGTGATGGCGTTTGTGTCTTACCCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG < 2:51098/143‑1 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > 2:212492/1‑143 TGGGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > 1:168043/1‑143 ATAATTTTTTAGTACTTTCAGATACCAGTCCATTTTTGCCTCAATTTTGCTCAATCACTTGTTTTTAAAGCAGC‑AAATTAAGAATAGACGTGAATGAAATGGCAGTAAATATTCGTTCAAGGAATTAATAAAGTGCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3252334‑3252195‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTGATGCTGCCAACTTACTGATTTAGTGTATGATGGTGTTTTTGAGGTGCTCCAGTGGCTTCTGTTTCTATCAGCTGTCCCTCCTGTTCAGCTACTGACGGGGTGGTGCGTAACGGCAAAAGCACCGCCGGACATCAGCG > NC_000913/3583427‑3583567 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |