| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3252203 | NA (NA) | 117 (1.510) | 77/280 | 0.0 | NA | intergenic (+195/‑99) | yqjG/yhaH | putative S‑transferase/DUF805 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 3584194 | NA (NA) | intergenic (+15/‑1) | insB1/yrhA | IS1 transposase B/pseudogene, interrupted by IS1E | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
ATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCG > NC_000913/3252061‑3252345 | gTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATAAGACTTAACTCGCCTTCACGGCACTgg > 1:1007824‑M1/1‑141 (MQ=255) ggATGCGGCATGACCGCCCTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaa < 2:463769‑M1/143‑6 (MQ=255) cggtgttgttgcggttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTttatta > 1:942548‑M1/129‑143 (MQ=255) cggtgcttttgccgttacgcacccccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTttatta > 2:1331680‑M1/129‑143 (MQ=255) gtgGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCCTGCCCCGCTCATACCAGATACGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgac < 2:986726‑M1/143‑10 (MQ=255) tgcccggtccgccacaccgcgtcggtagctgaacgggagggacagccgatagaaacagaagccactggagtacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTg > 1:1350525‑M1/121‑143 (MQ=255) aTGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaa > 2:1132542‑M1/1‑129 (MQ=255) aTGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaa > 1:1199277‑M1/1‑129 (MQ=255) aTGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTgggaatgactccaa > 1:248414‑M1/1‑129 (MQ=255) tGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGACGATTTTGCGGTTGTCATCAGTCTTAGCGCGGCTTCGCGGCACTggtgctgtctccgac > 1:85469‑M1/1‑128 (MQ=255) cgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACg < 1:577772‑M1/27‑1 (MQ=255) cGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgcctccaacttat > 2:804235‑M1/1‑124 (MQ=255) gCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttatt > 2:1067830‑M1/1‑123 (MQ=255) gCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgacccccactcatc > 1:1252762‑M1/1‑123 (MQ=255) ttATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGGGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgat > 2:852026‑M1/1‑120 (MQ=255) aTCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatag > 1:445618‑M1/1‑118 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTGGAACGAATATTTa < 2:76922‑M1/35‑1 (MQ=255) accaccccgtcagtagctgaacagcagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTa > 2:735006‑M1/109‑143 (MQ=255) cATACAAAACATTTTACATTCAATAGTTTGCATTACCCGCGCAGACCACATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:835371‑M1/143‑32 (MQ=255) cATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgtttt < 1:832941‑M1/143‑32 (MQ=255) cATACAAAACAGTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgacgccaacttattgatagtgtttt < 2:785537‑M1/143‑32 (MQ=255) aaaaCATGGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagaggatgaagtt > 1:671631‑M1/1‑107 (MQ=255) gagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATttcatt > 2:275070‑M1/96‑143 (MQ=255) aCATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag < 2:712983‑M1/143‑40 (MQ=255) cATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcaga < 2:1310224‑M1/143‑41 (MQ=255) ctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCAc > 2:863311‑M1/93‑143 (MQ=255) tGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactcccacttattgatagtgttttatgttcagataa > 2:734392‑M1/1‑100 (MQ=255) gTACATTCAATAGATTGCATAACCCGAGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCCTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataat < 2:349859‑M1/143‑45 (MQ=255) tACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttctgttcagataatg > 2:178353‑M1/1‑98 (MQ=255) aCATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgc < 2:1252534‑M1/143‑47 (MQ=255) ttCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg > 2:816163‑M1/1‑94 (MQ=255) ttCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatcactccaacctatcgatagtgtaatataataagataaagcccg > 2:603294‑M1/1‑94 (MQ=255) aaTAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 2:880323‑M1/1‑91 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTGTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCACTCACGTCTATTCTtaag < 2:154340‑M1/64‑2 (MQ=255) aTTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt < 2:440622‑M1/143‑58 (MQ=255) aTTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt < 2:1117381‑M1/143‑58 (MQ=255) gctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactacatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACATCTATTCTTAATTt‑g < 1:130999‑M1/67‑1 (MQ=255) ctgatcgaaacaggtgccagtggagcagctcaaaaacaccatcagacactacatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTt‑gc > 1:258023‑M1/76‑143 (MQ=255) cATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 2:541987‑M1/1‑82 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCtt > 1:51098‑M1/71‑143 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactacatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCttt < 1:200043‑M1/74‑1 (MQ=255) aaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTa < 1:404677‑M1/75‑1 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacagcagcatacacaaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTaaaa < 1:166380‑M1/78‑1 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactgaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCGCGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTaaaa < 2:954893‑M1/78‑1 (MQ=255) cgcAGACCAGGTAAGCGTAGCGCATCTGGCGATGTTGCGCGTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 1:976327‑M1/143‑71 (MQ=255) cgcAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcc < 2:676885‑M1/143‑71 (MQ=255) atccactggagcacctcaaaaccaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACaa > 1:103873‑M1/62‑143 (MQ=255) agccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactcaatcagtaaggtggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACaa > 1:29778‑M1/62‑143 (MQ=255) gccactggagcgcctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAAGTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAg > 1:1265988‑M1/61‑143 (MQ=255) gccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAg > 2:577772‑M1/61‑143 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGt > 1:1287084‑M1/60‑143 (MQ=255) tAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttga < 1:682076‑M1/143‑82 (MQ=255) aagaaaaaagcatctggcgaTTATGCACATGTCATCAGTCTCAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:469757‑M1/134‑83 (MQ=255) aaGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgag < 2:1172018‑M1/143‑83 (MQ=255) cGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac < 2:1045192‑M1/143‑86 (MQ=255) cGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 1:33016‑M1/1‑58 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTGAAAACAAGTGATTGAgcaaact < 2:326525‑M1/97‑3 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAAt < 1:1146331‑M1/97‑1 (MQ=255) gcgcATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagcgccaccgattttgagcacgaca > 1:78144‑M1/1‑54 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCGTTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACCAGTGATTGGgcaaaagt < 2:215797‑M1/98‑3 (MQ=255) ggcttcgggcgattttGCGTCTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACCGCACTggtaatgactccaacttattgctagtgttttatgttcagattatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacag < 1:371391‑M1/136‑91 (MQ=255) gcATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagc < 1:1059305‑M1/143‑92 (MQ=255) aaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGa > 1:801997‑M1/44‑143 (MQ=255) cTGGCGATTTATCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact < 1:1230426‑M1/143‑96 (MQ=255) gggcGGTTTTGCGCTCGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgtcttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcaactt < 1:1019763‑M1/142‑97 (MQ=255) ggCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgcctttgtatggcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc > 2:1275516‑M1/1‑46 (MQ=255) ggCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttc > 2:1319129‑M1/1‑46 (MQ=255) tcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAAt > 2:455971‑M1/35‑143 (MQ=255) aTTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc < 2:9753‑M1/143‑102 (MQ=255) tacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCCAAATTGAGGCAACAATGGa < 1:754129‑M1/112‑1 (MQ=255) gcgcTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccggc > 2:825921‑M1/1‑37 (MQ=255) actaaatcggtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTg > 2:972886‑M1/29‑143 (MQ=255) actaaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTg > 1:934822‑M1/29‑143 (MQ=255) taaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGt > 1:7190‑M1/27‑143 (MQ=255) cTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt < 1:816163‑M1/143‑110 (MQ=255) aaatcagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATGGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTa < 1:316641‑M1/118‑1 (MQ=255) tGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgtgttatgttcagataatgcacgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgc < 1:541987‑M1/143‑112 (MQ=255) cagtaagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTACTTT‑GCTGCTTTAAAAACACGTGATTGAGCCACATTGTGTCAAAAAAGAACTGGTATctc < 2:616888‑M1/122‑2 (MQ=255) aagttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAg > 2:404677‑M1/18‑143 (MQ=255) ttggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCCCGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAACTGGACTGGTATCTGACAGTAc < 1:1177927‑M1/129‑1 (MQ=255) ttAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggcgctgcc > 2:1034636‑M1/1‑21 (MQ=255) ttAGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaaagacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcc > 1:615667‑M1/1‑21 (MQ=255) ggcagcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATCCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGATAGCTGAAAGTACTa < 1:464063‑M1/131‑1 (MQ=255) aGCGCGCCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctc < 2:1057142‑M1/143‑125 (MQ=255) gcgcgcCTGCACGGGACTggtaatgactccaacttatggatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 1:749306‑M1/143‑126 (MQ=255) gcatcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTACTTTTGCT‑CTCTAAAAACAAGAGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTaaaaa < 1:735495‑M1/135‑1 (MQ=255) gaaaaacccACGGCACTTTATTAATTCATAAAACGATTCTTTACAACCAAATCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTACTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAAAAAAAAAAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTaaaaa < 1:149750/135‑1 (MQ=255) gcgcCTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 2:83416‑M1/1‑16 (MQ=255) catcaccCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTCTTCGTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTaaaaaa < 2:1211724‑M1/136‑1 (MQ=255) atcaccCACGGCACTTTATTAAGTCCTTGAACGCATACTTACTGGCAGTTCAGTCGCGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAA‑GTACTAAAAAAtt > 1:954893‑M1/7‑143 (MQ=255) cgtcaCGGCACTggtagtgactccgacttattgagagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca < 1:1129949‑M1/141‑132 (MQ=255) cTTCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgcccggtgctgcctcagattca > 2:911037‑M1/1‑12 (MQ=255) ttCACGGCACTggtaatgcctccagcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag < 1:23607‑M1/143‑133 (MQ=255) ttCACGGCACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagatcatgcgtcacctcgttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag < 2:309999‑M1/143‑133 (MQ=255) tgcacGGTACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag < 1:1341344‑M1/141‑133 (MQ=255) gtcACGGCAGTggtaatgactccgacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcag < 1:9469‑M1/142‑133 (MQ=255) aCGGCACTggtaacgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcccccgattttgagaacgacagcgactgccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtt < 2:957846‑M1/143‑136 (MQ=255) cACTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgc > 1:305679‑M1/1‑4 (MQ=255) tttATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCg > 2:136400/1‑143 (MQ=255) tggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagcttcaggttatgccgc > 2:376527‑M1/1‑1 (MQ=255) | ATGTCGGATGTGGCATGAACGCCTTATCTGACATACAAAACATTGTACATTCAATAGATTGCATAACCCGCGCAGACCAGATAAGCGTAGCGCATCTGGCGATTTTGCGCTTGTCATCAGTCTTAGCGCGCCTTCACGGCACTTTATTAATTCCTTGAACGAATATTTACTGCCATTTCATTCACGTCTATTCTTAATTT‑GCTGCTTTAAAAACAAGTGATTGAGCAAAATTGAGGCAAAAATGGACTGGTATCTGAAAGTACTAAAAAATTATGTCGGTTTCCG > NC_000913/3252061‑3252345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |