New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 951207 = | 112 (1.510) | 5 (0.070) | 5/270 | 9.5 | 4.5% | intergenic (‑127/+65) | pflA/pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme, [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme, PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic, pyruvate formate‑lyase 1 |
? | NC_000913 | 951233 = | 104 (1.470) | intergenic (‑153/+39) | pflA/pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme, [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme, PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic, pyruvate formate‑lyase 1 | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
CTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG > NC_000913/951091‑951373 | ctcCAGATGTGGCCCATCTGCGGTCGGGTTCGCGTCCTTCTTGAAGTCTAAGTCGAGTCCGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa < 1:908577/143‑1 (MQ=255) ctcCAGACGTGGCCCATCTGAGGGCGTGTTGGTGCGCAGCTCGATGGCAGCTTCTATTGGGATTCGGCCGGCAGCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa < 1:914884/143‑1 (MQ=255) tcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAACAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTa > 1:1050240/1‑143 (MQ=255) ccAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑tt > 2:753830/1‑143 (MQ=255) ccAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑tt < 2:734281/143‑1 (MQ=255) aGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAACGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑ACTTTA‑TTGt > 1:625430/1‑143 (MQ=255) gATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTa < 1:273794/143‑1 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAGGCATATATAGCTGAC‑AATAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGAGGAG‑CCGTTA‑TTGTACGCttt > 1:697522/1‑143 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAACGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCCTGGAG‑CCCTTA‑TCGTACGCttt > 1:588050/1‑143 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCttt > 2:1009798/1‑143 (MQ=255) cccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCtttt < 1:1177831/143‑1 (MQ=255) ccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTGACCTTCAAATATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCCCTAAAAAAGGCCACACTTCCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGAtattt > 1:663615/1‑143 (MQ=255) ccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCttttt > 2:1199193/1‑143 (MQ=255) tCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATCGTTGTG‑TTGTTGTAGACACACGCTAAAAAAAGCCCCAAATTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACt > 2:592711/1‑143 (MQ=255) tCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACt < 2:333902/143‑1 (MQ=255) tCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAACGCTCTCGCGCTAAAAACGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACt > 1:552419/1‑143 (MQ=255) cTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGGTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCGCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTg < 1:934352/143‑1 (MQ=255) tGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGt > 1:496183/1‑143 (MQ=255) ggCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGtgtg > 2:1138199/1‑140 (MQ=255) gCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGa > 2:768174/1‑143 (MQ=255) cGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTCCTTTGAGTGTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGAtt > 1:783477/1‑143 (MQ=255) cGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGAtt > 1:362469/1‑143 (MQ=255) tgtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTc > 2:838342/1‑143 (MQ=255) gtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGGAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGCGGAG‑CCCTTA‑TTTTACGCTTTTTACTGTACGCTTTCa > 1:921806/1‑143 (MQ=255) gctGGTGCGCAGCTCGAAGACTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAATGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa < 2:1233694/141‑1 (MQ=255) ctGGTGCGCAGCTCGAAGACTACGTCGAGACTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCGCTCACGCTAAAAAAGGCCCGACTCTCGTGGAG‑ACTTTA‑TTGTACGCTTTTTCCTGTACGAGTGCAg > 1:1191653/2‑143 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCGCTTTAAAGTATAGATCGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGGG‑CCTTTC‑TTGTACCGTTTTTACTGTACCATTTCAGTCaa > 1:706358/1‑143 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa < 1:983318/143‑1 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa > 2:448755/1‑143 (MQ=255) tGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa < 2:1238330/143‑1 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATc < 1:326332/143‑1 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACCTTCGTGGCG‑CCTTTA‑TCGTACGCTTTTTACTGTACGaataaaaacaaaac > 2:1058099/1‑130 (MQ=255) gcgcGAAGCCCACGCCGAGTCTGTTTTGCCACTCACCTTAACGCATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTTGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTaa < 2:219123/140‑1 (MQ=255) gCTCTAAGGCTAAGTCGAGGCTGTTTTGGCAGTGACCTTCAAGGATAGATAGCAGAC‑TAATAAGGCTCACGCCCTCAAATACGTCCTACATAAGTGGAG‑CCTTTA‑TTGGACGCTTCTGACTGTACGATTTCAGTCAAAGCTaa < 1:1234088/143‑1 (MQ=255) gCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCCAATCtca > 1:461794/1‑141 (MQ=255) cTCGAATGCTACGTCGAGTCTGTTTTGCGAGTCACATTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTACAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 1:166952/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt > 1:28187/1‑143 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 1:856500/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt < 1:855717/143‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCCCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAAt > 1:127888/1‑143 (MQ=255) cGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTa < 1:858484/143‑1 (MQ=255) aaGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACa > 1:355128/1‑143 (MQ=255) gCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAC‑GCGTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAAtcaaatcaaaaaaaatag > 2:111366/1‑135 (MQ=255) tACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGAGCCACGCACGAGG‑C‑CATTCACATGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCCAACCTAATTACCTAGAt > 1:569171/1‑143 (MQ=255) cGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTg > 2:793563/1‑143 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGCC‑AAAAAAGGCTCTCACGCTAAAACAAGACCGACTTTCGTACAA‑CCAATA‑TTGTGCGCTTTTTACTCTACGACTTCCGTCTAATATAATTACCTatatggct > 1:151238/1‑139 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAg < 1:245146/143‑1 (MQ=255) tCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACATTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATGGAg > 1:158282/1‑143 (MQ=255) gAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTCTAGATAGATGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAACACGGCTCACAGTTCGTTGAG‑CCTTTA‑TTGCACGCGTTTTACTGTAAGATTTCAGTACAGTCTAATTCCaggtcatcagcg > 1:125982/1‑132 (MQ=255) aGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGa < 2:1268470/143‑1 (MQ=255) ctccgTTTCGGCCGTCACCTTAAAGTATCGCTAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGaa < 1:307460/139‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCCCTTTCGTGGAGACATATA‑AT‑TTCGTGTTTTACTGTACGAGTCCCGTCCGATCTAATTACCTAGATTGAGTCAAg > 2:940599/1‑143 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAGTTACATAGCTTGAGGGAAg > 2:1116228/1‑143 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 2:496183/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 2:1107993/143‑1 (MQ=255) tCTGTTTTGACAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 2:156654/143‑1 (MQ=255) tGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGt < 1:712842/143‑1 (MQ=255) tttGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATATAATTACATAGATTGAGTGGAGGTACg > 1:480961/1‑143 (MQ=255) ttGGCATTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGTAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGa < 1:40810/143‑1 (MQ=255) ttGGCAGTCACCTTAAAGTATAGAGAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGa < 2:1292112/143‑1 (MQ=255) ccTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGt > 2:1215446/1‑143 (MQ=255) ttAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc > 1:544687/1‑143 (MQ=255) acaaaGTATTGATGGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc < 2:928564/141‑1 (MQ=255) aaaGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGATACGAGTAATAACGTCctg > 2:1130658/1‑143 (MQ=255) gTATAGATTGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg < 1:805992/143‑1 (MQ=255) gTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg > 1:1117874/1‑143 (MQ=255) gTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg < 1:886805/143‑1 (MQ=255) gTAGAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCGCACGCGGTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTCCCTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg < 2:481395/143‑1 (MQ=255) tctagatagCTGAC‑AACAAGGGCTCTCGGGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCcagctgt < 1:1206140/141‑2 (MQ=255) tataGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctgc > 2:399526/1‑143 (MQ=255) agatagCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGt < 2:557993/143‑1 (MQ=255) tagCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCt < 2:362469/143‑1 (MQ=255) cTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTa < 2:1267482/143‑1 (MQ=255) aC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGCTTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACATCCTGCTGCTCTTCTTTAGta > 1:606010/1‑142 (MQ=255) aaaaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTCTGATTGCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTCCTTTACTCAg > 1:847352/1‑143 (MQ=255) aaaaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAAACTCCTGCCGCTGTGCTCTAGTCAg > 1:259617/1‑143 (MQ=255) aaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGa > 1:1152685/1‑143 (MQ=255) tctcGCGCTAAATCAGGCCCCACTTTCTTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGAGTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGaa < 2:1050240/143‑1 (MQ=255) tctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCGGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGCTAGCGAGTTGaa > 1:479120/1‑143 (MQ=255) tctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTCGaa > 2:876326/1‑143 (MQ=255) ctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGaaa > 2:82350/1‑143 (MQ=255) gcgcT‑AAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGATTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTGTAGTCAGCGAGTTGAAAAGTa > 1:703848/1‑143 (MQ=255) tAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGGAACGTACTg > 2:949781/1‑143 (MQ=255) aatataGGCTCCACGTTCGTGGAT‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTTGTCAGCGAGTTTAAACGTACTGc < 1:341251/138‑1 (MQ=255) aaaaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCg > 2:262551/1‑143 (MQ=255) aaaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGt < 1:399526/143‑1 (MQ=255) aaaGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATCACGTCCTGCTGCTAGTGTTTTGTCCACAAGTTAAAACGTACTGCGTa > 1:1111699/1‑143 (MQ=255) ggCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTAATGTTGTTGAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGcc > 2:42906/1‑143 (MQ=255) gctccACTTTCCTGGAG‑CATTTT‑TTCTACGCTTTTTACGGGACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGCTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCa < 1:119470/140‑1 (MQ=255) gCCCCACTTTCGTTGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCa < 1:472531/143‑1 (MQ=255) ccccACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAACCAg > 2:663509/1‑143 (MQ=255) ccccACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGCACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGCGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGcccg > 1:1291695/1‑141 (MQ=255) cccACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTTCTGCGTCGcccgc > 2:1015372/1‑140 (MQ=255) cccACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGa < 2:783477/143‑1 (MQ=255) ccACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATATATTGTTTTAAGTTACGAGTAATAACGTCCTGCTTCTGTTCTTGAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGAt < 2:327126/143‑1 (MQ=255) aCTTACGTGTAT‑CGTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGACTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGAGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCCGCTac > 1:1204316/1‑143 (MQ=255) tttCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGACGCTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTCCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTTCTGCTTCGCCAGATacac > 2:411410/1‑143 (MQ=255) g‑CCTTTT‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCTGTCAAATCTAATTACATAGAGTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCa < 2:615711/143‑1 (MQ=255) tttA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCNAATCTANTTACATNGATTGAGTGAAGGTACGANTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTAAGTCNGCGAGTTGAAACGTACAGCGTAGCCAGATACAAGGATGGTCAgat > 1:801124/1‑141 (MQ=255) ttA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATACATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCCGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCCGCTg > 2:814684/1‑143 (MQ=255) | CTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGAC‑AAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAG‑CCTTTA‑TTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTCAGCTG > NC_000913/951091‑951373 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |