| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,815,858 | Δ82 bp | [rph]–[rph] | [rph], [rph] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3815858 | 3815939 | 82 | 66 [0] | [0] 67 | [rph]–[rph] | [rph], [rph] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3815857 | 0 (0.000) | 60 (0.870) | 46/262 | 0.4 | 100% | pseudogene (24/48 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH |
| ? | NC_000913 | 3815940 = | 0 (0.000) | pseudogene (609/669 nt) | rph | ribonuclease PH (defective),enzyme, Degradation of RNA, RNase PH | |||||
AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTT > NC_000913/3815800‑3816082 | acctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatagggctccttaaacatcagtcggccagcgccgccttctgcCGt > 2:474788‑M2/141‑143 (MQ=255)acctgcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgcccctcatcctaccttcctacagacaaaacaaacccgacccaccagacgccttaaaaatcagtttaccagagccgccttctgcCGt > 2:275290‑M2/141‑143 (MQ=255) gcttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTcccc > 2:817926‑M2/137‑143 (MQ=255) cttgctaagcgcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCt < 2:1255191‑M2/8‑1 (MQ=255) cttaagcgcaaattcaatatgctggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCa < 2:379504‑M2/11‑1 (MQ=255) cgcgcaaattcaataaactggcgctgatatgttttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaagtcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTc < 1:396691‑M2/15‑1 (MQ=255) cgcaaattctataaactggcgcagagatggagtcatgcctacgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCaa < 2:120074‑M2/17‑1 (MQ=255) gcacatgcagttacctggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaagaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAat < 1:550455‑M2/18‑1 (MQ=255) gcaaattcaataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatccgtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAat > 2:126101‑M2/126‑143 (MQ=255) aaactcacaaaactgccgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttactttgctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAatga < 1:352002‑M2/20‑1 (MQ=255) ttcaataaactggcgctgatatggttacatgccttcgctcctcatcttacctttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgc < 2:396453‑M2/23‑1 (MQ=255) caataaccgggcgctgatatgctttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 1:362337‑M2/25‑1 (MQ=255) caataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATgcgc < 2:837886‑M2/25‑1 (MQ=255) aataaactggcgctgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCACTGATGCGcc > 2:1121170‑M2/118‑143 (MQ=255) gtggctgagaggttttcatgccttcgctcgtcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 1:43283‑M2/34‑1 (MQ=255) ggcgctgatatggtttcaggccgtcgcgcgtcatcttacttgtctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCg < 1:1205100‑M2/34‑1 (MQ=255) gctgatatggtttcatgccttcactcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtc > 2:189611‑M2/107‑143 (MQ=255) tgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttcttcagacgaaaaaaagcccactcatctgccgctttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACCTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcat < 2:48218‑M2/39‑1 (MQ=255) tgatatggtttcatgccttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGtcat > 2:1004857‑M2/105‑143 (MQ=255) 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ttcgctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCgg > 2:915060‑M2/88‑143 (MQ=255) gctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGtct > 1:886857‑M2/85‑143 (MQ=255) gctcctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcaatttaccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCCCTTCAATGATGCGCCCGTCTTCCGTCCTCactacc‑ttcacttcgtccg > 1:157359‑M2/85‑134 (MQ=255) ctcatcttacttttctacagacaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCAGCAATGAAATGATTCGCGCGTATGAGCGCAGCACTACG‑TTAATGTCGGTCTCTGc > 1:967887‑M2/81‑143 (MQ=255) tcttacttttctccagacaaaaaaaaggcgactcgtcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCa < 1:160831‑M2/67‑1 (MQ=255) 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acaaaaaaaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCAGAACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGACGCCGCGTCTTCGACgtact > 1:246336‑M2/61‑141 (MQ=255) aaaggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 1:189611‑M2/90‑1 (MQ=255) aaaggcgactcatcagtcgccttaaaaagcaggttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATc < 2:403422‑M2/90‑1 (MQ=255) ggcgactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCa < 1:1274562‑M2/93‑1 (MQ=255) gactcatcagtcgccttaaaaatcagtttgccagcgccgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTCCG‑TTCCTATCCATCTCTGCGGCAGAGTCTTCCACCAATTCCAGATCGCacac > 1:293196‑M2/48‑143 (MQ=255) 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gccgccttctgcCGTCCCCTGCACTGCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCTGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCgg < 1:180265‑M2/131‑1 (MQ=255) cgccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCACTGCGCCGGTCACAATTCCGCCAGAGACTGCGgcc > 2:1237489‑M2/11‑142 (MQ=255) ctttctgcTGTTCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATGCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTAc < 2:157359‑M2/135‑1 (MQ=255) ccttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAGCGGATTGGACATCCCAAACCGCTTCGGCGTGCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCCAc > 1:1120319‑M2/9‑143 (MQ=255) ttctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCAACAGTAAATGCGgctaaaa > 2:156614‑M2/7‑140 (MQ=255) ctgcCGTCCCCTGCACTTCAATTATGTCTCCGTCTTCTGTCATCACAACG‑TTCATGTCGGTCTCGGCGGCAGAGGCGTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATc < 2:651856‑M2/139‑1 (MQ=255) ctgcCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATc < 2:403455‑M2/139‑1 (MQ=255) cGTCCCCTGCCCTTCATTGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCCATACGATTGCTGTCTG‑CTCTGCGGCAGTGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCtt < 1:915060/143‑1 (MQ=255) | AAAAAAAAGGCGACTCATCAGTCGCCTTAAAAATCAGTTTGCCAGCGCCGCCTTCTGCGTCGCTACAATGGATTCGATTCCCCTCGGGCCAGAGCCAACAAGATGAGTAGCTCTTCATGGGTGAACGGCTCGCCTTCTGCCGTCCCCTGCACTTCAATGATGCGCCCGTCTTCGGTCATCACTACG‑TTCATGTCGGTCTCTGCGGCAGAGTCTTCAACGTATTCCAGATCGCAAACCGCTTCGCCGTTCACAATTCCGACAGAAACTGCGGCTACCATCCCTT > NC_000913/3815800‑3816082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |