| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1293032 = | 6 (0.090) | 67 (0.990) | 52/284 | 0.2 | 91.8% | intergenic (‑110/‑495) | hns/tdk | global DNA‑binding transcriptional dual regulator H‑NS/thymidine kinase/deoxyuridine kinase |
| ? | NC_000913 | = 1979270 | NA (NA) | intergenic (‑55/‑483) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 | gATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGCTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAttt < 2:636491/143‑1 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcacctcc < 1:417046‑M1/3‑3 (MQ=255) ttgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTtgtg < 1:513780/143‑1 (MQ=255) tgttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTAAGTTGTGCAATAGCAAGGAATGTAAGGAATTAAAAATTGTTCTTTATTTTGTgc > 1:324777/1‑143 (MQ=255) gttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGCGGATCAGCCGGGAATGTACGGATTTAAAAATTGTTCTTTATTTAGTgcc > 2:698925/1‑143 (MQ=255) atgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagatggcagcatcaccTTGTgcc < 2:1156110‑M1/7‑1 (MQ=255) ttCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg > 1:684670/1‑143 (MQ=255) tgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccg < 1:12633‑M1/8‑1 (MQ=255) gtCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACGTATATTGGGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTgccg < 2:410535/142‑1 (MQ=255) gtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc < 1:656412‑M1/9‑1 (MQ=255) gcccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggaggtcctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgc > 2:196294‑M1/135‑143 (MQ=255) tccggcggtgctttggccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTgccgcc > 2:626339‑M1/134‑143 (MQ=255) cAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgg < 1:352782‑M2/143‑3 (MQ=255) aGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTAGTTTGTGCCGggt < 1:30038‑M2/143‑4 (MQ=255) aaTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAGATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaa < 1:439203‑M2/143‑6 (MQ=255) aTTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaat < 1:585133‑M2/143‑7 (MQ=255) cggtgctttcgccgtgacgcaccaccccgccagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagatggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 2:948957‑M1/129‑143 (MQ=255) cggggcttttgccgttacgcaccaccccggcagtagctgaacaggagggccagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCaataa > 1:412143‑M1/129‑143 (MQ=255) tttAGTGTGTCGGTCATTGTCGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAAGGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgac > 2:466240‑M2/1‑134 (MQ=255) gcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcagcaccTTGTGCCGCcaataaatac < 2:328472‑M1/19‑2 (MQ=255) cttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcgcctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGACAAGAAGTATc < 1:265710‑M1/20‑1 (MQ=255) tGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTGGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaa < 2:172660‑M2/143‑15 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCttt > 1:491788‑M1/121‑143 (MQ=255) gCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATGGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaac > 1:140885‑M2/1‑128 (MQ=255) tgccttaactcgaaaccccgccagtaggtgagtaggaggtagagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatataataaatcagtaagttggcagcatcatcTTGTGCCGCCAATAAATATCtttt > 2:689998‑M1/120‑143 (MQ=255) tCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATCCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaactta > 1:647051‑M2/1‑125 (MQ=255) cgttacgcaccaccccgtcagtcgctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaacaccaccgtcatacactaactcagtaatttggcagcatcaccTTGTGCCGCCCATAAATATCTTTTCAt < 2:465427‑M1/27‑1 (MQ=255) gCTCATGGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTGGTTGATGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttatt > 2:1050097‑M2/1‑123 (MQ=255) ttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATaa < 2:655377‑M1/29‑1 (MQ=255) cTCGTTGTAGTAATCTCAAACTTATAGTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattg > 1:228465‑M2/1‑122 (MQ=255) tagtaATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTCACGtgtaatgactcccacttatcgacagtga < 2:41386‑M2/143‑29 (MQ=255) ccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGc > 1:969065‑M1/108‑143 (MQ=255) caccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactgcagcacctcaaaaaccacaccacacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATACAattaccc < 2:415688‑M1/37‑4 (MQ=255) taATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 1:529044‑M2/1‑112 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATACATATCTTTTCATAAAATTAGCCAg < 1:96364‑M1/39‑1 (MQ=255) aaaCTTATCTTGGGCTGGTGTGTTGAGCTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAATATTGTTCTTTATTTTGTGCCGtgtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttca > 1:382612‑M2/1‑105 (MQ=255) aaCTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCACGTTTTTGATCAATTCAACATTTTGCTTGATGTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcag > 1:861827‑M2/1‑104 (MQ=255) atctTGGGGTGGTTTGTTGAGATAATAATAGAGCCTTAAATTCAGCTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAACATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtcatgactccatcttattgatagtgttttatgttcagataat > 1:868884‑M2/1‑99 (MQ=255) gaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCat < 1:565895‑M1/53‑1 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagccggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCata > 2:591991‑M1/90‑143 (MQ=255) acaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCatat < 1:203132‑M1/55‑1 (MQ=255) caggagggacagctgatagaaacagaagccactggaacacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCAtata < 1:761510‑M1/56‑1 (MQ=255) ggggTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccg > 2:455662‑M2/1‑94 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGCCGCGGCATATAGCCCTa < 2:712500‑M1/62‑1 (MQ=255) gtTGGTGGAGGGAATAATAGCGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgact > 1:1141036‑M2/1‑88 (MQ=255) ttgttgAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttt > 1:936397‑M2/1‑86 (MQ=255) ttgGGGTAATAATAGATCGTTAGATTCAGTTGTGCAATGGCCAGGAATGTAAGGAATTCAGAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGtgtaatgactccaacttatggatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtc > 2:1088086‑M2/1‑83 (MQ=255) ctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTaca < 1:916203‑M1/68‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac < 1:177298‑M1/69‑1 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTacac > 1:277428‑M1/75‑143 (MQ=255) gAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcat < 1:975417‑M2/143‑63 (MQ=255) tagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGATGCGGCATATAGCCCTATTTACACCga > 1:1025658‑M1/72‑143 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgat < 1:1060238‑M1/73‑1 (MQ=255) gaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCgatg < 1:311624‑M1/74‑1 (MQ=255) aataatAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagc > 1:878653‑M2/1‑76 (MQ=255) ataGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcca < 1:984923‑M2/143‑72 (MQ=255) taGAGTCTTAAATTCAGTTGTGCACTAGACAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTATGTGCCGtgcaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccac > 2:77957‑M2/1‑71 (MQ=255) tgccactgcaacaccccaactgcaccatcataccctaaagtagtaagttggcatcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATCTCGTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGTCGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgca > 2:530376‑M1/62‑143 (MQ=255) ccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaaggtggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCgcagc > 1:379604‑M1/60‑143 (MQ=255) ccTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatt < 1:1143860‑M2/143‑78 (MQ=255) ttAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttt < 1:1125169‑M2/143‑80 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGt < 2:426277‑M1/88‑1 (MQ=255) gagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggaagcatcacaTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGAATATAGCCATATTTACACAGATGATTACGCAGCACGTGa < 2:958974‑M1/90‑1 (MQ=255) agcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGGTTTCGCAgcacgaacg < 2:567150‑M1/91‑5 (MQ=255) tCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaccttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac > 2:851756‑M2/1‑58 (MQ=255) acctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGcacgtgggggt < 2:740827‑M1/94‑6 (MQ=255) tgtcggtcactagccAGGACGGTCAGGAATTTTAAATTGTTCTTTATTGTGTGCCGggtaatgactccaccttattgatagggttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctcccccgattttgagaacga > 2:62202‑M2/8‑56 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaa < 2:142848‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGCTaa < 2:601871‑M1/96‑1 (MQ=255) ctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGACTTCGCAGCACGTGAcgttca < 2:331259‑M1/96‑3 (MQ=255) ttGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca < 1:543493‑M2/143‑90 (MQ=255) tcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCTAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTaaa < 1:1059767‑M1/97‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACTCATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAAc < 2:1160711‑M1/99‑1 (MQ=255) aaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAAc < 1:793026‑M1/99‑1 (MQ=255) aacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTc > 1:383463‑M1/42‑143 (MQ=255) aaTAGCCAGAAAGGTAAGGAATGCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGgggaatgactacaacatatcgataatgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattgggaacacgccagcgacc < 2:658733‑M2/143‑96 (MQ=255) accatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAACAAGGGAGGTGAAAACTTCctc < 2:147681‑M1/105‑2 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTCGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTCTTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGAt < 2:295992‑M1/107‑1 (MQ=255) cAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatttggagcacgacagcgacttccgtc < 1:928155‑M2/143‑102 (MQ=255) acactaaatcaggaagttgcaagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGt > 1:890839‑M1/31‑143 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcctgcagctccaccgattttgaacacgacagcgactcacgtcccagcc < 2:963794‑M2/143‑108 (MQ=255) tGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcc > 1:758472‑M2/1‑36 (MQ=255) tAATGTATTCAATTTTGTTCTTTATTTTTTGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgt > 1:235644‑M2/1‑34 (MQ=255) aaTGCAAAAGTGTTCTTGAGTTTGAGCCGggtaatgactccaacgtattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccag > 2:837536‑M2/1‑29 (MQ=255) gtcactcggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATg > 1:937638‑M1/20‑143 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTatc < 1:581713‑M1/124‑2 (MQ=255) gtaagttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATg < 1:1037400‑M1/124‑1 (MQ=255) agttggcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATgggg > 2:912359‑M1/17‑143 (MQ=255) ttggcgtcatcaccTTGTGCTGCCAATAAATATCGTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGgag > 2:688233‑M1/15‑143 (MQ=255) gcagcatcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATggggagctg < 2:595337‑M1/132‑4 (MQ=255) tCTTTATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcaga < 1:1174869‑M2/143‑128 (MQ=255) tttATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccccgccgtgccaggtgctgcctcaggtt < 2:1148941‑M2/143‑130 (MQ=255) atcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGt < 2:819173‑M1/137‑1 (MQ=255) atcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGt < 2:227735‑M1/137‑1 (MQ=255) tcaccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTa > 1:718546‑M1/6‑143 (MQ=255) tATTTTGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattca > 1:734652‑M2/1‑12 (MQ=255) caccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATGCATGTCACATTTTATGGGGTGATTATCGTAg < 1:138786‑M1/139‑1 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGAGGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc > 1:755193‑M1/3‑143 (MQ=255) ccTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGc > 1:761192‑M1/3‑143 (MQ=255) tttGTGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgccgcggattcaggt < 1:1023358‑M2/143‑135 (MQ=255) | GATGTTGTTCAGAATTTTAAGTGCTTCGCTCATTGTAGTAATCTCAAACTTATATTGGGGTGGTTTGTTGAGGTAATAATAGAGCCTTAAATTCAGTTGTGCAATAGCCAGGAATGTAAGGAATTCAAAATTGTTCTTTATTTTGTGCCGCCAATAAATATCTTTTCATAAAATTAGCCAGAAAAGACGCGGCATATAGCCCTATTTACACCGATGATTTCGCAGCACGTGAGGTTAAAACTTCCTGATTCATGTCACATTTTATGGGGAGATTATCGTAGGCT > NC_000913/1292890‑1293173 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |