Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_000913 2099836 2101302 1467 32 [31] [30] 32 gnd gnd

GTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTAT  >  NC_000913/2099693‑2099899
                                                                                                                                              |                                                                
gttgttCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGcc                                                                  <  1:775469/143‑1 (MQ=255)
      cGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCAGGTGCAATATACGCCGGGCCGCAAtt                                                            >  2:1042595/1‑143 (MQ=255)
         tGGTCAACACAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGAAATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTa                                                         <  2:60080/143‑1 (MQ=255)
            tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAttg                                                      <  1:968858/143‑1 (MQ=255)
            tCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCCGTGCACTATACGCCGGGCCTCAATTCTAttg                                                      >  1:342340/1‑143 (MQ=255)
              aacgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCATTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTTGCTAAAAAAAGCCCGGTGTAATATACGCCGGGCCTCTATTTTAttgtt                                                    >  1:666299/1‑143 (MQ=255)
               acgcaacgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTAgtgttg                                                   <  2:975737/143‑1 (MQ=255)
                     cgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATGTTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATAGACGCCGGGCCTGAATTTTAGTGTTGGTTaag                                             >  1:941971/1‑142 (MQ=255)
                     cgAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGCTGGTTaaa                                             >  2:204483/1‑143 (MQ=255)
                      gAAAAGCTATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt                                            <  1:885387/143‑1 (MQ=255)
                      gAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCAGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAACAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAAt                                            <  1:1125304/143‑1 (MQ=255)
                          aaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGGTATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCAGTCCTCAAATTAATTGTAGGTTAAATCAGa                                        >  2:960750/1‑143 (MQ=255)
                          aaCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCACAGTGCAATATACGCCAGGCCTCAATCATATTGATGGTTCACTCAgc                                        >  2:759043/1‑142 (MQ=255)
                           aCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATATGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATATTATTGTTGGTTACATcggca                                       >  2:1176373/1‑139 (MQ=255)
                           aCAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGAt                                       >  2:315820/1‑143 (MQ=255)
                               ttCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAACGCCCGGTGCAACATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAAt                                   >  1:266232/1‑143 (MQ=255)
                                    aTTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAGTATACGCCGGGCCTAAGTTTTATTGTCGGTTAAATCAGATTAATCCAGc                              >  1:311664/1‑143 (MQ=255)
                                     ttttCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGACGGGCGTCGGATGTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGcc                             >  2:242562/1‑143 (MQ=255)
                                     ttttCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGATGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGcc                             >  1:1050591/1‑143 (MQ=255)
                                         cTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTc                         <  1:1012242/143‑1 (MQ=255)
                                          tttATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCg                        <  1:995118/143‑1 (MQ=255)
                                          tttATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCg                        >  1:827330/1‑143 (MQ=255)
                                               aaGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCCGCCATTCGGTATg                   >  1:751236/1‑143 (MQ=255)
                                                 gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa                 >  1:239474/1‑143 (MQ=255)
                                                 gAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGa                 >  1:818762/1‑143 (MQ=255)
                                                  aaTAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGaa                >  2:193034/1‑143 (MQ=255)
                                                       cagagatttattAAGTCAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgt           <  2:752753/138‑3 (MQ=255)
                                                         gATATTTAGTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgt         <  1:400079/143‑5 (MQ=255)
                                                            attaattaGTTTAATATTAAGCACTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtagg      <  1:93179/143‑8 (MQ=255)
                                                              ttattaAGTTAATATTAAACATTGAAATTGAGTCTATAAGATATTTGGAAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtaggct    <  2:796843/143‑10 (MQ=255)
                                                               tattaAGTATATAGGAAAGAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtaggctg   <  2:192067/143‑11 (MQ=255)
                                                                attaAGTTAATATCAAGCAGTGAAATTGAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATGTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAacacgtgtaggctgg  <  1:1042551/143‑12 (MQ=255)
                                                                                                                                              |                                                                
GTTGTTCGATGGTCAACGCAACGAAAAACAATTCAGATTTTCTTTATAAGAATAGCTGATATTTATTAAGTTAATATTAAGCAGTGAAATTTAGTCTATAAGATATTTGGCAAAAAAAAGCCCGGTGCAATATACGCCGGGCCTCAATTTTATTGTTGGTTAAATCAGATTAATCCAGCCATTCGGTATGGAACACACCTTCTTTAT  >  NC_000913/2099693‑2099899

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: