| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 3632752 = | 125 (1.080) | 6 (0.060) | 6/270 | 14.4 | 5.0% | intergenic (‑162/+100) | yhiJ/yhiL | DUF4049 family protein/pseudogene, DUF4049 family protein |
| ? | NC_000913 | 3632789 = | 112 (1.060) | intergenic (‑199/+63) | yhiJ/yhiL | DUF4049 family protein/pseudogene, DUF4049 family protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ACGTGATAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3632912‑3632752‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctctacaatcGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCC > NC_000913/3632789‑3632936 ACGTGATAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTAATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACG > 2:1299986/1‑150 CGTGATAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGC < 2:1068797/150‑1 GTGATAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCC > 3:34048/1‑150 TAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGGCGCCTCTA > 3:66154/1‑150 TAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTA > 3:140241/1‑150 TAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTA < 1:794817/150‑1 AAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTAC > 3:130067/1‑150 AAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAA > 2:1190775/1‑150 AAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTGCTGATGACGCCTCTACAA < 1:1197166/150‑1 ATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATC < 4:383838/150‑1 CTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCT > 2:124150/1‑116 CTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCT < 1:124150/116‑1 TAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTGTTAATGTAATTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAAT > 2:1354447/1‑150 TCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTAT > 2:461818/1‑150 ATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTA < 2:205820/106‑1 ATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTA > 1:205820/1‑106 TCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATT > 3:242406/1‑150 ATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATT > 3:205030/1‑150 GCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGACTAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGA > 4:349507/1‑150 GCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGc > 2:100976/1‑149 GCCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGA > 1:39123/1‑150 CCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAA < 1:618884/150‑1 CCTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAA < 2:422732/150‑1 CTCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAAT > 1:379085/1‑150 TCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGATTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATT > 1:1159559/1‑150 TCTACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATT < 2:923488/150‑1 TACAATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTA > 2:426560/1‑150 AATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCC < 2:279358/150‑1 AATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCC > 1:1042346/1‑150 ATCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCC > 2:617751/1‑150 TCGATTAAGAGAACCTATGAAATACGGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAGTTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCC < 2:810871/150‑1 TCGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCC < 2:530209/150‑1 TCGATTAAGAAAACCTATGAAATAATGGCAGGATTAAAAAGACATACTACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGATGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCC < 4:344566/150‑1 ACGTGATAAAAATAATAAAATAATTTATTCCTCAGGGCTTAGTTGTTTTCAACTACATTAAAACTCCATGAATACGGTGGTATGTCTTTTTAATCCTGCCAGTATTTCATAGGTTTTCTTAATCGATTGTAGAGGCATGTTCTGATGACGCCTCTACAATC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/3632912‑3632752‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcctctacaatcGATTAAGAAAACCTATGAAATACTGGCAGGATTAAAAAGACATACCACCGTATTCATGGAGTTTTAATGTAGTTGAAAACAACTAAGCCCTGAGGAATAAATTATTTTATTATTTTTATCACGTGCTTCCTTCAGGGAATTTAGCCCC > NC_000913/3632789‑3632936 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |