| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2630917 | 100 (0.870) | 5 (0.050) | 5/270 | 15.1 | 5.1% | intergenic (+52/+41) | yfgI/guaA | nalidixic acid resistance protein, putative periplasmic protein/GMP synthetase (glutamine aminotransferase) |
| ? | NC_000913 | = 2630921 | 95 (0.900) | intergenic (+56/+37) | yfgI/guaA | nalidixic acid resistance protein, putative periplasmic protein/GMP synthetase (glutamine aminotransferase) | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGAGGAAATCGTAC > NC_000913/2630776‑2631069 | gCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATAGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGAACCAAAACCCTCTGTAGTAACag > 3:296439/1‑150 (MQ=255) ccAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACaga > 1:44689/1‑150 (MQ=255) aGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGtt > 1:423616/1‑150 (MQ=255) aaaTATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGtttt > 1:1348557/1‑150 (MQ=255) atatGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGt > 4:476095/1‑150 (MQ=255) atGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttc > 2:1000930/1‑150 (MQ=255) gACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttcat > 2:1182755/1‑150 (MQ=255) aCTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttcatt > 1:999659/1‑150 (MQ=255) tGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGttcattca > 3:507212/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATa > 4:153596/1‑150 (MQ=255) aaGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATa > 2:880531/1‑150 (MQ=255) ggaggTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCTGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGt < 4:548788/147‑1 (MQ=255) ggCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGt > 1:816141/1‑150 (MQ=255) gCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTg > 3:87565/1‑150 (MQ=255) gcgATCTGCGGACAGGGGTTGGTATAGCAGAAGAGAAGAAATCGGACAGATCGTTTCATTAAACGTTGTTAGTAACTTCAGTCCTATAATTCTTGAAGATAAACGACCCTCTGTAGTACCAGATGGTTTTTTTCATTCATAGTGCTGGGt < 4:532112/150‑1 (MQ=255) cgATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAACCCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTc < 2:1154598/150‑1 (MQ=255) gATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCa > 2:686686/1‑150 (MQ=255) tgatgaAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTGGTATCTTCAATCCTATCATTCCAACCGATACAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATc < 3:84348/150‑1 (MQ=255) 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aaaGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTccc > 1:1077421/1‑150 (MQ=255) aaGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCa < 1:202775/150‑1 (MQ=255) aaGCGGGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCa < 3:442038/150‑1 (MQ=255) aGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCAc < 4:191768/150‑1 (MQ=255) gTGGGCAAACCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAACCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAAAAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATAATTCCCACTCa > 4:156265/1‑150 (MQ=255) tGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCaa < 1:701574/150‑1 (MQ=255) tGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCaa > 3:162361/1‑150 (MQ=255) tGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCaa > 2:830571/1‑150 (MQ=255) aaaGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTa < 1:178105/150‑1 (MQ=255) agaagaGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTgg < 2:1137099/150‑1 (MQ=255) gaagaGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTAAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATGCCCACTCAATGGTAGCTggc > 2:1172379/1‑150 (MQ=255) aagaGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTggcg > 2:306176/1‑150 (MQ=255) aaTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGc > 1:658498/1‑150 (MQ=255) aaTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGc < 4:302036/150‑1 (MQ=255) aaTCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGATTTGTTAATTCACCGCAAAGGGACAAATCATCGACGCTGAATGGGGGCTGGCGGCTTGCCGc > 1:1075592/1‑150 (MQ=255) 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aaaaCCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGAc > 3:327254/1‑150 (MQ=255) aaaaCCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATGCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGAc < 4:400612/150‑1 (MQ=255) aaCCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTACACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCg > 1:1265331/1‑150 (MQ=255) aCCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGa < 3:272448/150‑1 (MQ=255) cccTCAGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGAg < 3:543804/150‑1 (MQ=255) 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GCCAACAGAAATATGACTGAAGGCGGTCGCGATCTGATGAAAAGCGTGGGCAAAGCAGAAGAGAACAAATCGGACAGCTGGTTTAATTAATCGATGTTAGTAACTTCAATCCTATAATTCTTGAAGATAAAAAACCCTCTGTAGTAACAGAGGGTTTTGTTCATTCATAGTGCAGGGTCAAATCATTCCCACTCAATGGTAGCTGGCGGCTTGCCGCTGATGTCATACACCACGCGGGAAATACCGTTCACTTCATTGATAATGCGGTTGGAAACGCGACCGAGGAAATCGTAC > NC_000913/2630776‑2631069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |