| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,158,626 | G→A | G253D (GGC→GAC) | ptsG → | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,158,626 | 0 | G | A | 100.0% | 86.1 / NA | 26 | G253D (GGC→GAC) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (16/10); total (16/10) | |||||||||||
CTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACC > NC_000913/1158481‑1158759 | cTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACtt > 6:113544/1‑149 (MQ=255)cTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACtt > 4:58265/1‑149 (MQ=255) caatctgcaTCTGGAAAGGTACGTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTAc > 8:100027/8‑149 (MQ=255) caTCTGGAAAGGTACGTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGc > 6:82958/1‑149 (MQ=255) cAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTAt > 5:132915/1‑149 (MQ=255) aTGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCt > 1:60853/1‑148 (MQ=255) aTGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCt < 2:60853/148‑1 (MQ=255) aTGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTg < 3:58265/149‑1 (MQ=255) aaTACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTAt > 1:172081/1‑133 (MQ=255) aaTACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTAt < 2:172081/133‑1 (MQ=255) cAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGaaa < 7:100027/149‑1 (MQ=255) aCGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAAc > 8:47211/1‑149 (MQ=255) gtcaggtTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGaaa < 6:132915/149‑1 (MQ=255) tcaggtTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAg > 6:92984/1‑149 (MQ=255) gtTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTggg < 5:92984/149‑1 (MQ=255) aCGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtat > 7:115957/1‑148 (MQ=255) ggCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCa > 2:67693/1‑84 (MQ=255) ggCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCa < 1:67693/84‑1 (MQ=255) ggCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCt > 7:130979/1‑149 (MQ=255) gggTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGt < 7:47211/149‑1 (MQ=255) ccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGATAGTGGGCGGTAATATGAGCTCAGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc > 3:101983/1‑149 (MQ=255) ccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGta > 7:49844/1‑115 (MQ=255) ccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc > 1:83385/1‑149 (MQ=255) ccGACTGAGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGta < 8:49844/115‑1 (MQ=255) gggTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCa < 8:115957/149‑1 (MQ=255) aaaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCAcc > 1:100148/1‑147 (MQ=255) | CTGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACC > NC_000913/1158481‑1158759 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |