| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2977113 = | 120 (1.310) | 4 (0.050) | 4/238 | NT | 3.7% | coding (515/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
| ? | NC_000913 | 2977211 = | 97 (1.150) | coding (613/1032 nt) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
GCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACG > NC_000913/2976965‑2977259 | gCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGAGCGTTACGGTGCCTGGCTGGCACCGCGTCATTTAAt > 5:128915/1‑149 (MQ=255) ccAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAAtt < 6:53444/149‑1 (MQ=255) cAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAAtt > 1:321494/1‑148 (MQ=255) tcgcacccgccgccattgaatcgttataacaggctaccgcagtgaaatttcatcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTCa > 7:345536‑M1/146‑149 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACACATGCCCGGTATGGGGCTGAGCAACCGTATCCTGCCGGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCa < 4:203547/149‑1 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAAtt > 3:91413/1‑147 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCa < 7:267915/149‑1 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCa < 2:364323/149‑1 (MQ=255) aaaaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCAGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAAtt > 6:215133/1‑147 (MQ=255) aaTGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGc < 1:195660/149‑1 (MQ=255) cacccgccgccattgaatcgttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTCAGc < 1:174534‑M1/6‑1 (MQ=255) tGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCaa < 1:200395/149‑1 (MQ=255) cccgccgccattgaatcgttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTCAGCAAg > 2:89674‑M1/141‑149 (MQ=255) aTCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAgg > 3:138184/1‑149 (MQ=255) tCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGt > 4:174356/1‑149 (MQ=255) tCCCGCATGCTGATTTATCCTCATTAAAGAAACAAATGCCCGGTATGGAGCTCATCAACCGTATCCAGCCTAGCTATGAAAACAGATGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCAGGCAACGCGTCATATAATTCAGCAAGGt > 8:139149/1‑149 (MQ=255) cccGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAgtt > 5:206591/1‑146 (MQ=255) attgaatcgttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTc > 4:117049‑M1/132‑134 (MQ=255) attgaatcgttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTc < 3:117049‑M1/3‑1 (MQ=255) tGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCa > 3:36508/1‑149 (MQ=255) tGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCa > 1:413293/1‑149 (MQ=255) aTTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCa < 7:138376/147‑1 (MQ=255) tAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGTTCAACCGTATCCTGGCTGGCTTTGAAAACGGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCGTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTgg < 1:46162/148‑1 (MQ=255) ttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTCAGCAAg > 3:35586‑M1/123‑131 (MQ=255) ttataacaggctaccgcagtgaaatttcttcctcgtcccaaaagctcggtcattgcctgttcgccgccgctttcgtctggttcgccaaatgtcaccagccggtcattggccgcaataccactTTCAGCAAg < 4:35586‑M1/9‑1 (MQ=255) gCCTCATTAATGAAACAACTGCCCGGTATGGTGCTGAGCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGtt < 6:249474/148‑1 (MQ=255) gCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGtt < 5:215133/148‑1 (MQ=255) gCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTa > 2:292424/1‑149 (MQ=255) tCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATCCCCGCATTGGtt > 1:281337/1‑145 (MQ=255) 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aaTGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGCTCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGct > 2:275686/1‑149 (MQ=255) aaTGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGct > 1:296613/1‑149 (MQ=255) aTGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGctc < 4:138184/149‑1 (MQ=255) gAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTTCCTGGCTTTTAAAAACGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGAAACGCGTCATTTAATTCAGAAAGTTCATACCCTCATTGGTTATCTGTGctct > 4:373306/1‑148 (MQ=255) gAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGctct > 3:296033/1‑148 (MQ=255) 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gACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCGTTGCTGAAAGTGGTATTg < 2:434204/148‑1 (MQ=255) aCGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGc > 7:63255/1‑133 (MQ=255) aCGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCg > 7:1636/1‑149 (MQ=255) gATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGaaa > 6:398437/1‑136 (MQ=255) gATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGaaa < 5:398437/136‑1 (MQ=255) tCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGcc > 7:353483/1‑148 (MQ=255) tCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCAGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCTGcc > 6:82382/1‑148 (MQ=255) gTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCaa < 7:25089/148‑1 (MQ=255) gTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAAt < 3:280215/149‑1 (MQ=255) aCGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGAc > 4:392627/1‑149 (MQ=255) ggTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCg > 5:128296/1‑149 (MQ=255) ctggctggCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGGCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTgg < 1:312037/149‑1 (MQ=255) tggctggcAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGt > 3:313275/1‑149 (MQ=255) gctggcAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGt < 1:134722/147‑1 (MQ=255) aaCGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTg < 3:174356/149‑1 (MQ=255) aCGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTgg < 4:313275/149‑1 (MQ=255) tCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAAc < 1:131440/149‑1 (MQ=255) aTTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACg > 8:283445/1‑148 (MQ=255) | GCCAAAATGATCCCGGATGCTGATTTAGCCTCATTAATGAAACAAATGCCCGGTATGGTGCTGATCAACCGTATCCTGCCTGGCTTTGAAAACCGTTGTATTGCTCTGGACGATCGTTACGGTGCCTGGCTGGCAACGCGTCATTTAATTCAGCAAGGTCATACCCGCATTGGTTATCTGTGCTCTAACCACTCTATTTCTGACGCCGAAGATCGTCTGCAAGGGTATTACGATGCCCTTGCTGAAAGTGGTATTGCGGCCAATGACCGGCTGGTGACATTTGGCGAACCAGACG > NC_000913/2976965‑2977259 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |