| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,158,626 | G→A | 100% | G253D (GGC→GAC) | ptsG → | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,158,626 | 0 | G | A | 100.0% | 242.6 / ‑6.7 | 72 | G253D (GGC→GAC) | ptsG | fused glucose‑specific PTS enzymes: IIB component/IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base A (33/38); minor base C (1/0); total (34/38) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGAT > NC_000913/1158482‑1158767 | tGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTCCCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATAGGGCGGGAGACCCGACTGCGGGTAAACTGGCTGGTGACTTc > 4:236209/1‑149 (MQ=255)tGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTc > 4:216706/1‑149 (MQ=255) gTACCGTTTGGTCTTCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGGTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTc < 6:27482/147‑1 (MQ=255) gTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTc < 7:372879/147‑1 (MQ=255) gTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCt < 6:357506/149‑1 (MQ=255) gTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCt > 5:279632/1‑149 (MQ=255) ccGTTTGTTCTGCACCAGATCAGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGGAGCAGGTCATGTTTTCGACGTCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGt < 5:98403/148‑1 (MQ=255) ccGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTTAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCTTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGt < 2:302551/148‑1 (MQ=255) ggTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCaaaa < 7:290946/148‑1 (MQ=255) tGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTAc > 1:124924/1‑149 (MQ=255) tGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTAc > 7:60806/1‑149 (MQ=255) caccacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTATTCAAAATGTAc < 5:85562/147‑1 (MQ=255) accacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGCCTTCCTGTTCAAAATGTACGGt > 3:116776/1‑149 (MQ=255) accacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGGGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGt < 5:97903/149‑1 (MQ=255) ccacATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGTGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTc > 1:18736/1‑149 (MQ=255) cacaTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCt > 5:126558/1‑149 (MQ=255) aTCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGc > 6:162551/1‑148 (MQ=255) cTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAg > 6:98504/1‑149 (MQ=255) ggAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCt > 7:108467/1‑149 (MQ=255) ggAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACGTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCt > 8:99708/1‑149 (MQ=255) gAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCa < 6:279632/145‑1 (MQ=255) gAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCa < 2:2304/145‑1 (MQ=255) aCCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCaa > 2:31854/1‑149 (MQ=255) aCCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTAAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAATATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCaa > 7:182341/1‑149 (MQ=255) ccTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCaa < 2:18736/148‑1 (MQ=255) tCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGc < 1:168327/148‑1 (MQ=255) cAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTa < 2:195729/148‑1 (MQ=255) aGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATc < 2:124924/149‑1 (MQ=255) aGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATc > 7:122941/1‑149 (MQ=255) gCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTAc < 2:309340/118‑1 (MQ=255) aTTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCActc < 8:60806/149‑1 (MQ=255) ttGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCActct < 1:31854/149‑1 (MQ=255) ggttactACACCATCGCAGCAGGTCAGGTTATCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGAGCGGACTGCGGGTAAACTGGCTGGGGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTTCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTg < 4:116776/142‑1 (MQ=255) ggTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTg < 4:328431/148‑1 (MQ=255) gTGACTACACCAACGCAGCAGGTCAGGGTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAATCTGGCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGc < 3:236209/148‑1 (MQ=255) gAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTa > 2:393340/1‑148 (MQ=255) gAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTa > 5:150254/1‑148 (MQ=255) tACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAAcc < 1:197429/149‑1 (MQ=255) caccGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAATCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTCCGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGaa > 3:246614/4‑148 (MQ=255) cGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAAcc < 5:98504/149‑1 (MQ=255) tcaggtTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCGATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAg > 2:130571/1‑149 (MQ=255) tcaggtTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGATATCTGGCActct > 7:433553/1‑124 (MQ=255) tcaggtGTTCCACGGCGACATTCCGCTTTATATGGCGGGTGAACCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCActct < 8:433553/124‑1 (MQ=255) aCGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtat > 4:193148/1‑148 (MQ=255) gCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATg < 8:122941/149‑1 (MQ=255) cGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTgg < 4:397589/137‑1 (MQ=255) cGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTgg > 3:397589/1‑137 (MQ=255) gACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGTTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtatt > 5:116767/1‑144 (MQ=255) gACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGTTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGtatt < 6:116767/144‑1 (MQ=255) cgcgTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCcgcg > 2:234328/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGAc < 3:193148/148‑1 (MQ=255) ggTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGtt > 8:8930/1‑149 (MQ=255) gTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGGCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTc < 3:216706/149‑1 (MQ=255) cccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGa > 3:143622/1‑149 (MQ=255) ccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc > 7:169771/1‑149 (MQ=255) ccGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc > 3:337326/1‑149 (MQ=255) gACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCTAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGAGCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCg < 6:126558/149‑1 (MQ=255) cGGGTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTAt < 8:108467/148‑1 (MQ=255) ggTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc < 6:27381/140‑1 (MQ=255) ggTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGAc > 5:27381/1‑140 (MQ=255) ggTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCAc < 8:169771/149‑1 (MQ=255) gTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCAcc > 2:135288/1‑149 (MQ=255) gTAAACTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCAcc > 2:225431/1‑149 (MQ=255) aaaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGt < 7:420055/95‑1 (MQ=255) aaaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGt > 8:420055/1‑95 (MQ=255) aaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGa < 1:393340/148‑1 (MQ=255) aaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGa < 1:234328/148‑1 (MQ=255) aaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAg < 1:135288/149‑1 (MQ=255) aaCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAg > 7:17110/1‑149 (MQ=255) aCTGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTTCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGc < 5:162551/149‑1 (MQ=255) tGTCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGcc > 5:193710/1‑148 (MQ=255) tCTGGTGACTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGAt < 7:8930/149‑1 (MQ=255) tggtgaCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGa < 4:182996/141‑1 (MQ=255) tggtgaCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGa > 3:182996/1‑141 (MQ=255) | TGGTACCGTTTGGTCTGCACCACATCTGGAACGTACCTTTCCAGATGCAGATTGGTGAATACACCAACGCAGCAGGTCAGGTTTTCCACGGCGACATTCCGCGTTATATGGCGGGTGACCCGACTGCGGGTAAACTGTCTGGTGGCTTCCTGTTCAAAATGTACGGTCTGCCAGCTGCCGCAATTGCTATCTGGCACTCTGCTAAACCAGAAAACCGCGCGAAAGTGGGCGGTATTATGATCTCCGCGGCGCTGACCTCGTTCCTGACCGGTATCACCGAGCCGAT > NC_000913/1158482‑1158767 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |