| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 169,716 | Δ2,672 bp | [fhuA]–[fhuB] | [fhuA], fhuC, fhuD, [fhuB] | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 169716 | 172387 | 2672 | 115 [0] | [0] 115 | [fhuA]–[fhuB] | [fhuA],fhuC,fhuD,[fhuB] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 169715 | 0 (0.000) | 115 (1.010) | 87/270 | 0.2 | 100% | coding (2232/2244 nt) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter |
| ? | NC_000913 | 172388 = | 0 (0.000) | coding (927/1983 nt) | fhuB | iron(3+)‑hydroxamate import ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
ATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCA > NC_000913/169573‑169860 | aTGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtca < 5:312832‑M1/148‑6 (MQ=255) tGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgtt > 5:63598‑M1/1‑137 (MQ=255) cgcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgat < 5:256348‑M1/149‑16 (MQ=255) gcgAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatc < 8:246318‑M1/149‑17 (MQ=255) aGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggt < 1:507593‑M1/149‑20 (MQ=255) ctggctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgc > 6:254764‑M1/1‑119 (MQ=255) tggctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggt > 4:353815‑M1/1‑118 (MQ=255) tggctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggt < 3:353815‑M1/137‑20 (MQ=255) ctCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactg > 2:333070‑M1/1‑115 (MQ=255) tCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgt > 2:96927‑M1/1‑114 (MQ=255) tCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgt > 3:445922‑M1/1‑114 (MQ=255) cAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGTTCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtgg < 6:351685‑M1/149‑38 (MQ=255) cAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtg < 6:391125‑M1/148‑37 (MQ=255) cAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCCTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgt < 5:158805‑M1/147‑36 (MQ=255) aaCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggc > 6:38865‑M1/1‑111 (MQ=255) aaCGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggc > 8:346637‑M1/1‑111 (MQ=255) tGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgtt < 5:330051‑M1/149‑43 (MQ=255) gcTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCATAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccg > 3:348292‑M1/1‑103 (MQ=255) 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caacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcag > 7:418567‑M1/1‑91 (MQ=255) caacCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcag > 6:35204‑M1/1‑91 (MQ=255) acCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgttta < 6:40575‑M1/141‑53 (MQ=255) cTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcagcatta < 8:131104‑M1/149‑63 (MQ=255) cTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTATAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcagcat > 5:430131‑M1/1‑87 (MQ=255) 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gcaaccggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcagcattagcgcgccggatatgaaggtcaacgatcgtgtcgcggctgaacgccaacatgtgctggcgtttgccctcgcgggcggcgtgc < 7:287046‑M1/149‑144 (MQ=255) aaccggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcagcattagcgcgccggatatgaaggtcaacgatcgtgtcgcggctgaacgccaacgtgtgctggcgtttgccctcgcgggcggcgtgctg < 2:205086‑M1/149‑146 (MQ=255) aaccggtcactgcgttgatcggtgcgccgctgctactgtggctgttgccgcgtttacgcagcattagcgcgccggatatgaaggtcaacgatcgtgtcgcggctgaacgccaacatgtgctggcgtttgccctcgcgggcggcgtgctg > 2:310027‑M1/1‑4 (MQ=255) | ATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGATCGTGAATACGTCGCCAGCTGCTTTAACACTTATGGCTGCTTCTGGGGCGCAGAACGTCAGGTCGTTGCAACCGCAACCTTCCGTTTCTAATTTCTCTTTTGGGGCACGGATTTCCGTGCCCATTTCACAAGTTGGCTGTTATGCAGGAATACACGAATCATTCCGATACCACTTTTGCACTGCGTAATATCTCCTTTCGTGTGCCCGGGCGCACGCTTTTGCA > NC_000913/169573‑169860 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |