| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,409,013 | C→A | 7.2% | H322N (CAT→AAT) | ydaN → | putative Zn(II) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,409,013 | 0 | C | A | 7.2% | 186.8 / 2.4 | 62 | H322N (CAT→AAT) | ydaN | putative Zn(II) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/28); new base A (2/3); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.97e-01 | |||||||||||
ATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCGATGGGCGTT > NC_000913/1408872‑1409160 | aTGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCgta < 4:77113/148‑1 (MQ=255)aTGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCg > 7:256309/1‑146 (MQ=255) aCCCAGTACCTTTATGACCTGGTTATTTGGCGTCAACCTTTGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGGGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGtt < 1:312437/147‑1 (MQ=255) ccAGTACCTTGCTGCCAGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTa < 1:147485/148‑1 (MQ=255) tACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACa > 1:203130/1‑147 (MQ=255) aCCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaa > 1:266937/1‑147 (MQ=255) aCCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaa > 2:301591/1‑147 (MQ=255) ttCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGc > 6:118208/1‑147 (MQ=255) ttATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaaa > 7:198143/1‑133 (MQ=255) ttATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaaa < 8:198143/133‑1 (MQ=255) cGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGta < 2:203130/148‑1 (MQ=255) cAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaaa < 8:232365/122‑1 (MQ=255) cAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACaaa > 7:232365/1‑122 (MQ=255) cAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGtata > 2:197312/1‑147 (MQ=255) cAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTACGGCTGTCTGtata > 6:190472/1‑147 (MQ=255) 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tGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTc < 1:197312/148‑1 (MQ=255) ggCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGt > 7:53354/1‑135 (MQ=255) ggCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGt < 8:53354/135‑1 (MQ=255) ggCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTc > 6:167924/1‑147 (MQ=255) cAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGa > 7:272199/1‑141 (MQ=255) cAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGa < 8:272199/141‑1 (MQ=255) aaTTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCatt > 3:6427/1‑145 (MQ=255) aTTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATaa < 2:266937/148‑1 (MQ=255) ttCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATaaa > 8:169079/1‑148 (MQ=255) tgcgttttttCAATTTTTTTTATTCTTTGAGTTTTTCTTATTGTTTGTGTTGCTTTATGGTTTAATCGTAGTAAATGGTTGTAAAAAAATATATTTTTCCGGCTGTCTGTATTCAAAATCGGCTCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATaa < 3:79540/141‑1 (MQ=255) tCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTAAGCGAAGTCAATAAAc > 5:56388/1‑148 (MQ=255) 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ttCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAATCTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCa < 3:193712/148‑1 (MQ=255) tATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGt > 2:169142/1‑147 (MQ=255) tATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGAATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCtt > 1:65280/1‑141 (MQ=255) tATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGAATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCtt < 2:65280/141‑1 (MQ=255) tggtgTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACTCCGCAAAGTTTTAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATAACTCTCTTCCAGGTGAATGc > 8:310510/1‑147 (MQ=255) tggtgTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCACTAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCa < 4:6427/148‑1 (MQ=255) tggtgTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCa < 8:184532/148‑1 (MQ=255) tgtTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCa < 6:44646/96‑1 (MQ=255) tgtTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCa > 5:44646/1‑96 (MQ=255) gtTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGt > 2:262435/1‑148 (MQ=255) ttATGGTTGAATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATAtc > 2:298042/1‑119 (MQ=255) ttATGGTTGAATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATAtc < 1:298042/119‑1 (MQ=255) tATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCg < 7:26779/147‑1 (MQ=255) tGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCGATGGGCg > 2:175983/1‑148 (MQ=255) gCATCGTAGTAAATGGTTTTAACAAAAGCAATTTTTCCGGATGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGAGAATTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCGATGGGCg < 3:77871/147‑1 (MQ=255) cATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCGATGGGCGtt < 7:235234/148‑1 (MQ=255) | ATGGTCTTTTTACCCAGTACCTTTCTGACCGGGTTATTTGGCGTCAACCTTGGTGGGATCCCTGGCGGCGGGTGGCAATTCGGATTTTCAATTTTTTGTATTCTGTTAGTTGTTCTTATTGGTGGTGTTGCTTTATGGTTGCATCGTAGTAAATGGTTGTAACAAAAGCAATTTTTCCGGCTGTCTGTATACAAAAACGCCGCAAAGTTTGAGCGAAGTCAATAAACTCTCTACCCATTCAGGGCAATATCTCTCTTGCAGGTGAATGCAACGTCAAGCGATGGGCGTT > NC_000913/1408872‑1409160 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |