| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 238140 | 73 (1.970) | 8 (0.230) | 8/218 | 2.6 | 10.3% | intergenic (+20/+117) | yafT/ykfM | lipoprotein/lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | = 238146 | 72 (2.110) | intergenic (+26/+111) | yafT/ykfM | lipoprotein/lethality reduction protein, putative inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAG > NC_000913/237999‑238285 | ttCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTc < 4:57838‑M2/149‑2 (MQ=255) caccaTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctgg > 7:68491‑M2/1‑145 (MQ=255) ccaTTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctggcg > 6:104859‑M2/1‑143 (MQ=255) ccGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAACGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGGTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaataa > 7:152226/1‑149 (MQ=255) ccGACAAGAATGAAGCCAGTAAGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaataa > 8:172328/1‑149 (MQ=255) aaGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACa > 2:155968/1‑148 (MQ=255) aTGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCGAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAAtt > 7:11870/1‑149 (MQ=255) aGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGa < 3:177483/115‑1 (MQ=255) aGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGa > 4:177483/1‑115 (MQ=255) aCTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCtt > 3:62408/1‑138 (MQ=255) aCTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCtt < 4:62408/138‑1 (MQ=255) tGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTc < 5:165169/148‑1 (MQ=255) tGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCt < 3:57838/149‑1 (MQ=255) gACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaataa < 5:46560/118‑1 (MQ=255) gACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCaataa > 6:46560/1‑118 (MQ=255) aCAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatct < 3:31845‑M2/149‑46 (MQ=255) agagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGAc < 1:155968/149‑1 (MQ=255) gagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCCGCCGCCAGAAATTCctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatctttt > 4:72784‑M2/1‑101 (MQ=255) gagCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCCGCCGCCAGAAATTCctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttt < 3:72784‑M2/148‑48 (MQ=255) agcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttacca > 4:31845‑M2/1‑97 (MQ=255) gcaAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctggc < 6:114341‑M2/101‑6 (MQ=255) aTCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTg < 5:102793/149‑1 (MQ=255) tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa < 5:106060/142‑1 (MQ=255) tGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa > 6:106060/1‑142 (MQ=255) gCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAg > 1:184093/1‑148 (MQ=255) cTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctg < 8:94188‑M2/86‑4 (MQ=255) cTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctg > 7:94188‑M2/1‑83 (MQ=255) cTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCtt > 8:15057/1‑127 (MQ=255) cTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCtt < 7:15057/127‑1 (MQ=255) ttAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCctggcggcagatataatttat > 4:104709‑M2/1‑82 (MQ=255) aaGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCtt < 6:158061/124‑1 (MQ=255) aaGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCtt > 5:158061/1‑124 (MQ=255) aaaaGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCctggcggcaga < 6:177600‑M2/87‑12 (MQ=255) aaaaGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGAAATTCctggcggcaga > 5:177600‑M2/1‑76 (MQ=255) gACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATcc > 3:79103/1‑149 (MQ=255) cccTCTAAAGCGATCGTAAAAGATTTGGGTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCg < 8:152226/148‑1 (MQ=255) ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCg < 4:176549/145‑1 (MQ=255) ataAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCg > 3:176549/1‑145 (MQ=255) taAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGt < 2:184093/148‑1 (MQ=255) aaaGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGtt > 2:158296/1‑148 (MQ=255) aTGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCttt > 4:104238/1‑85 (MQ=255) aTGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCttt < 3:104238/85‑1 (MQ=255) tGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgct > 4:31845‑M1/1‑52 (MQ=255) tGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtg > 7:139421/1‑149 (MQ=255) ggTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgt > 2:3330/1‑149 (MQ=255) gTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCGATAATACAAAATTCTTTGCATaa > 7:53743/1‑88 (MQ=255) gTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCGATAATACAAAATTCTTTGCATaa < 8:53743/88‑1 (MQ=255) aaaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcggatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgctgctc > 4:72784‑M1/1‑48 (MQ=255) aaaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctggcg > 3:99204‑M2/1‑54 (MQ=255) aaaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTctggcg < 4:99204‑M2/60‑7 (MQ=255) aaaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa < 3:133547/108‑1 (MQ=255) aaaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACa > 4:133547/1‑108 (MQ=255) aaaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcggatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgctgctc < 3:72784‑M1/148‑102 (MQ=255) aaGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttgtt < 8:139421/149‑1 (MQ=255) aGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgctgctctgt < 3:31845‑M1/149‑105 (MQ=255) aTTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTa < 8:11870/149‑1 (MQ=255) ggTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGaa > 6:2314/1‑148 (MQ=255) gTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttgt < 2:43542/140‑1 (MQ=255) gTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgtttgt > 1:43542/1‑140 (MQ=255) ttAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACtgt > 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ataataAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGtttt > 6:20585/1‑129 (MQ=255) ataataAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCAGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAAc > 8:29615/1‑149 (MQ=255) ataaATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaa < 3:104709‑M1/103‑83 (MQ=255) ataaATTATATCTGCCGCCAGgaatttctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaa > 4:104709‑M1/1‑21 (MQ=255) ataaATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGaaa < 1:47641/91‑1 (MQ=255) ataaATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGaaa > 2:47641/1‑91 (MQ=255) ataaATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAActgc < 1:158296/149‑1 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tCTGCCGCCAGgaatttctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtctttt > 5:177600‑M1/1‑11 (MQ=255) cTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAg > 1:164648/1‑97 (MQ=255) cTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAg < 2:164648/97‑1 (MQ=255) cgccAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgctgctctgtcatatcagtcgtactggcttcattcttgtcgggcaatgg > 6:104859‑M1/1‑6 (MQ=255) cgccAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatctttt > 3:99204‑M1/1‑6 (MQ=255) cgccAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatctttt < 4:99204‑M1/60‑55 (MQ=255) gccAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgc < 6:114341‑M1/101‑97 (MQ=255) ccAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaagttgcatgatttgctgctctgtcatatcagtcgtactggcttcattcttgtcgggcaatggtg > 7:68491‑M1/1‑4 (MQ=255) ccAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAatta < 5:86187/123‑1 (MQ=255) ccAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAatta > 6:86187/1‑123 (MQ=255) cAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaag > 7:94188‑M1/1‑3 (MQ=255) cAGaaattcctggcggcagatataatttattattgatagcggttaaccaaatcttttaccatcgctttataggtcttttgcttaag < 8:94188‑M1/86‑84 (MQ=255) aGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTaa > 7:74759/1‑126 (MQ=255) aGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTaa < 8:74759/126‑1 (MQ=255) | TTCCACCATTGCCCGACAAGAATGAAGCCAGTACGACTGATATGACAGAGCAGCAAATCATGCAACTTAAGCAAAAGACCTATAAAGCGATGGTAAAAGATTTGGTTAACCGCTATCAATAATAAATTATATCTGCCGCCAGGAATTTCTGGCGGCAATAATACAAAATTCTTTGCATAAGAAATTTTTCTTGACAAAGACAGTGCAAGAAAGGACATGGAATCCGGAGTTAAAAACTGTTTGTTTTAGAATATTTAATTATTTAACTGCTGAATCTTCCTTGCGAG > NC_000913/237999‑238285 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |