| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,212,074 | T→C | 5.5% | intergenic (‑71/+629) | iraM ← / ← ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,212,074 | 0 | T | C | 5.5% | 226.5 / 2.2 | 73 | intergenic (‑71/+629) | iraM/ycgX | RpoS stabilzer during Mg starvation, anti‑RssB factor/DUF1398 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (42/27); new base C (2/2); total (44/29) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTA > NC_000913/1211932‑1212219 | atTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTatat > 8:300/1‑147 (MQ=255) atGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCt > 8:442448/1‑148 (MQ=255) atGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCt > 7:186245/1‑148 (MQ=255) aaaaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑aaaaaaa < 2:261077/148‑1 (MQ=255) aaGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAaaat > 6:416217/1‑147 (MQ=255) tataCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGtat < 5:388654/121‑1 (MQ=255) tataCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGtat > 6:388654/1‑121 (MQ=255) aCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAaattaat > 6:118741/1‑148 (MQ=255) aCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAaattaa < 1:387834/147‑1 (MQ=255) aCCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAaattaa > 2:387834/1‑147 (MQ=255) ccACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAaattaatt < 8:426096/148‑1 (MQ=255) cacaTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAaattaatt > 8:141094/1‑147 (MQ=255) caTGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCGCCGC‑AAAAAAATAAAttaattaa > 2:370382/1‑147 (MQ=255) tAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAatga > 1:353187/1‑148 (MQ=255) ggTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATATAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAatgat < 7:236757/147‑1 (MQ=255) ttGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGc > 7:225380/1‑148 (MQ=255) ttGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGc > 3:3381/1‑148 (MQ=255) aaTTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTta > 7:367795/1‑148 (MQ=255) aTTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTAATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCATC‑AAAAAAAAAAATAAATAAAAATCATggggta > 6:13193/1‑143 (MQ=255) ccGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTtatata > 7:265674/1‑147 (MQ=255) cGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaa > 1:31505/1‑148 (MQ=255) tgtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGATTATATTAGACCCCCATA‑AAAAAAATTATTTAATTTATCTGATGGCTTATataaaa > 5:239544/1‑147 (MQ=255) tgtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGGTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATataaaa > 4:135960/1‑147 (MQ=255) gtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGtat > 3:309347/1‑94 (MQ=255) gtCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGtat < 4:309347/94‑1 (MQ=255) ttACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAAtt > 2:338247/1‑148 (MQ=255) cTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTa < 7:442448/147‑1 (MQ=255) aTCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAg > 3:32634/1‑148 (MQ=255) ccACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAAATAAAATGATGGCTTAATTAATAAAAAATTTAAAGc > 4:344147/1‑147 (MQ=255) caaatCATTTGGTTAGTCGTTTCCCACGGTATTTAAATTTGTTCATTACTATTTTTAATTCTTGATTTTTCATATGATTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCaa < 5:13193/144‑1 (MQ=255) cACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCa < 4:3381/147‑1 (MQ=255) cACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCa < 8:265674/147‑1 (MQ=255) cTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAgg < 5:416217/148‑1 (MQ=255) cTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAAGTAAAATGATGGCTGTTATAAAATAAAATTTAAAGCAAg > 4:277316/1‑147 (MQ=255) ttCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAATTTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAgg > 4:236017/1‑147 (MQ=255) ttCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGGTGGCTTATATAAAATAAAATTTaaa > 6:405567/1‑141 (MQ=255) ttCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGGTGGCTTATATAAAATAAAATTTaaa < 5:405567/141‑1 (MQ=255) tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTaa > 2:280180/1‑139 (MQ=255) tCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTaa < 1:280180/139‑1 (MQ=255) gTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCa < 5:118741/147‑1 (MQ=255) gTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCa < 1:338247/147‑1 (MQ=255) tGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGa < 8:186245/148‑1 (MQ=255) tGTCTTATCCAACGGTATTTAATATGTGTCATTATGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGa < 6:239544/148‑1 (MQ=255) tCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGCCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATg > 8:260378/1‑148 (MQ=255) cACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACa > 1:386752/1‑147 (MQ=255) ggTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAAt > 3:345586/1‑148 (MQ=255) atatGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGAttt < 8:225380/147‑1 (MQ=255) atGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTTCCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAATATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGTATGTTAAACAAAATGATATTTtgt > 1:391162/1‑148 (MQ=255) ggTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGATTATATAAAATAAAATTTAAAGAAAGGAATATAAATGGATGTTAAACAAAATTTGATTTtgtg > 2:394468/1‑147 (MQ=255) gTTCATTAGTATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACACCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGaa < 5:340714/148‑1 (MQ=255) ttCATTAGGATTTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCACCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTtg < 4:43537/143‑1 (MQ=255) tCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTTCCCCCCCCTC‑AAAAAATTAATTTAATTTAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGATTGTCTATGGATGTTAATCTATATGAGATTTTGTGagat > 3:43537/1‑145 (MQ=255) ttAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCaa > 8:356830/1‑148 (MQ=255) ttAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCaa > 2:359381/1‑148 (MQ=255) aGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAAt > 7:379721/1‑147 (MQ=255) ggATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATaa < 4:345586/148‑1 (MQ=255) gTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAatta > 7:188808/1‑148 (MQ=255) tttATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAattat < 2:31505/148‑1 (MQ=255) tATTTCTTGATTTTGCATATGAGCATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCaa < 7:291090/103‑1 (MQ=255) tATTTCTTGATTTTGCATATGAGCATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCaa < 7:298212/103‑1 (MQ=255) tATTTCTTGATTTTGCATATGAGCATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCaa > 8:291090/1‑103 (MQ=255) tATTTCTTGATTTTGCATATGAGCATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATATCaa > 8:298212/1‑103 (MQ=255) aTTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAattatt > 4:411286/1‑146 (MQ=255) aTTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTg < 3:236017/147‑1 (MQ=255) tGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCaa < 6:103595/86‑1 (MQ=255) tGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCaa > 5:103595/1‑86 (MQ=255) tGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATATCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTgcgttggt > 4:39213/1‑141 (MQ=255) aTTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACaa > 3:133948/1‑108 (MQ=255) aTTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACaa < 4:133948/108‑1 (MQ=255) tttGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGttt > 7:212354/1‑146 (MQ=255) tGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAg < 7:141094/147‑1 (MQ=255) gCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAATTTATTGACTTCGTTTTAGa < 1:359381/147‑1 (MQ=255) atGAGTATATTACCCCCACCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATCGCTTATATAAAATAAATTTTAAAGAAAGGAATATCAATGGATGTTAAACAAAAATAGATTTTCTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGt > 4:185358/1‑148 (MQ=255) tGAGTATATTACCCCCCCCTCAAAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGt > 7:287844/1‑148 (MQ=255) tGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGtt < 4:32634/148‑1 (MQ=255) aGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTTTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTTGATTTGtt > 5:232561/1‑146 (MQ=255) aGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTa < 3:277316/148‑1 (MQ=255) | ATTACCCCATATGGCTGAAAAAGATATACCACATGTAGGTTGAATTACCGTGTCAATTACTATCCACTTCATTTGTTATGTCTTATCCCACGGTATTTAATATGGTTCATTAGGATGTTTATTTCTTGATTTTGCATATGAGTATATTACCCCCCCCTC‑AAAAAAATAAATTAATTAAAATGATGGCTTATATAAAATAAAATTTAAAGCAAGGAATCTCAATGGATGTTAAACAAAATGAGATTTTGTGAAAGCAATAAATTATTGACTTCGTTTTAGATTTGTTTA > NC_000913/1211932‑1212219 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |