| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,393,704 | G→A | 7.5% | A160T (GCA→ACA) | mppA → | murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,393,704 | 0 | G | A | 7.5% | 248.2 / 6.6 | 80 | A160T (GCA→ACA) | mppA | murein tripeptide (L‑ala‑gamma‑D‑glutamyl‑meso‑DAP) transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/34); new base A (3/3); total (42/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGAAACCCGGAAATCTGATCGGC > NC_000913/1393559‑1393850 | ggCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCa < 2:394856/148‑1 (MQ=255) gcgcAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAg < 5:407194/148‑1 (MQ=255) cAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTg < 3:349621/148‑1 (MQ=255) aCAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACttt > 7:39031/1‑148 (MQ=255) gCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGa > 8:303475/1‑147 (MQ=255) cGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGc < 6:172549/148‑1 (MQ=255) gtggACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTg < 8:39031/145‑1 (MQ=255) gtggACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGa < 3:173093/146‑1 (MQ=255) aCCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAAcc > 8:427914/1‑148 (MQ=255) cAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGtt > 1:266340/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGc > 1:395595/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGc > 7:381561/1‑148 (MQ=255) aaaaCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGc > 7:106471/1‑148 (MQ=255) aaaCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGc < 2:158493/132‑1 (MQ=255) aaaCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGc > 1:158493/1‑132 (MQ=255) aaCATTGTCTCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCg > 4:14111/1‑148 (MQ=255) aCATTGTCGCCATTTGCATGGTTTACCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGt > 7:442669/1‑148 (MQ=255) gTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGtt < 3:14111/147‑1 (MQ=255) cATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGaa > 1:137895/1‑148 (MQ=255) ttGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAAtt > 5:147064/1‑147 (MQ=255) ttGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAAtt > 7:231553/1‑147 (MQ=255) cATGGTTTACCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTTGTTTGTGAATTTaa < 8:442669/147‑1 (MQ=255) aTGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAAcc > 5:181760/1‑148 (MQ=255) ttGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTaa > 7:253503/1‑141 (MQ=255) ttGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTaa < 8:253503/141‑1 (MQ=255) tGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTaa < 2:266340/147‑1 (MQ=255) gCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACt > 3:36840/1‑148 (MQ=255) ccGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACtt < 7:427914/148‑1 (MQ=255) cgcgCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACttt > 5:1902/1‑148 (MQ=255) cgcgCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACttt > 6:328921/1‑148 (MQ=255) cgcTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGc < 1:207735/148‑1 (MQ=255) gcTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGcc < 6:181760/148‑1 (MQ=255) gCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCcttct < 2:137895/148‑1 (MQ=255) caacaaCGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTg > 1:46220/1‑148 (MQ=255) acaacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGc > 3:340787/1‑147 (MQ=255) caacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCa > 7:252489/1‑147 (MQ=255) caacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTtg > 2:154787/1‑110 (MQ=255) caacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTtg > 2:160756/1‑110 (MQ=255) caacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTtg < 1:154787/110‑1 (MQ=255) caacGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCACAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTtg < 1:160756/110‑1 (MQ=255) acGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCaaaa < 8:252489/148‑1 (MQ=255) cacaGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAACCCGTAGCCGTGGTTTGTGAAGTTAACCGCGAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGc > 5:420104/1‑148 (MQ=255) ggCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTg < 2:199797/122‑1 (MQ=255) ggCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTg > 1:199797/1‑122 (MQ=255) ggCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGGTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAAc < 6:429742/148‑1 (MQ=255) cGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACg > 8:158858/1‑147 (MQ=255) attattGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAAc > 5:190494/1‑144 (MQ=255) attattGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAAc < 6:190494/144‑1 (MQ=255) ttattGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCg < 2:308498/128‑1 (MQ=255) ttattGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGACTTCTTCCCg > 1:308498/1‑128 (MQ=255) tGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGc > 5:380103/1‑148 (MQ=255) gATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGc < 5:328921/147‑1 (MQ=255) gATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGc < 6:1902/147‑1 (MQ=255) aTGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGaa < 6:301015/94‑1 (MQ=255) aTGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGaa > 5:301015/1‑94 (MQ=255) tGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGATGGTGATGCCGATACTTTGAAAATTGAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTTACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGGAAAAACCCAACGTAGAAAGCgg < 6:420104/147‑1 (MQ=255) gTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAAttt > 5:20093/1‑94 (MQ=255) gTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAAttt < 6:20093/94‑1 (MQ=255) gTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTaa < 2:46220/148‑1 (MQ=255) gTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTaa < 7:303475/148‑1 (MQ=255) aaGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAag < 8:231553/147‑1 (MQ=255) gCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGt < 2:395595/148‑1 (MQ=255) cTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTg > 4:146029/1‑148 (MQ=255) tACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCTGTGAAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGAAAAGAGTg > 6:16853/1‑147 (MQ=255) cGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCg > 7:130293/1‑90 (MQ=255) cGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCg < 8:130293/90‑1 (MQ=255) ccTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCct > 8:322160/1‑100 (MQ=255) ccTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCct < 7:322160/100‑1 (MQ=255) ccTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACg > 2:364580/1‑147 (MQ=255) ccAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCATTCTTCACAGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGGGGACGAAAccc > 6:103732/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCTAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGGAAACCGGAAAt > 2:368772/1‑148 (MQ=255) tGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGAAACCCGGAAAt > 7:404940/1‑148 (MQ=255) gTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGAAACCCGGAAATCTGa < 6:147064/148‑1 (MQ=255) tCACCTCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCa < 5:289922/105‑1 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACt > 7:435740/1‑77 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACt < 8:435740/77‑1 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGt < 5:320319/108‑1 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGt > 6:320319/1‑108 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTaa > 5:267744/1‑120 (MQ=255) cACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTaa < 6:267744/120‑1 (MQ=255) gCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGAAACCCGGAAATCTGATCGGc > 7:139431/1‑147 (MQ=255) | GGCGCAAGATTTTGTCTACAGCTGGCAACGTCTGGTGGACCCAAAAACATTGTCGCCATTTGCATGGTTTGCCGCGCTGGCGGGAATCAACAACGCACAGGCGATTATTGATGGTAAAGCTACGCCTGACCAGCTTGGCGTCACCGCAGTTGATGCCCATACTTTGAAAATTCAGCTTGATAAACCGTTGCCGTGGTTTGTGAATTTAACCGCTAACTTTGCCTTCTTCCCGGTGCAAAAAGCCAACGTAGAAAGCGGTAAAGAGTGGACGAAACCCGGAAATCTGATCGGC > NC_000913/1393559‑1393850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |