| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 466,420 | T→C | 5.4% | E298G (GAG→GGG) | ybaE ← | putative ABC transporter periplasmic binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 466,420 | 0 | T | C | 5.4% | 349.3 / 5.6 | 111 | E298G (GAG→GGG) | ybaE | putative ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/52); new base C (3/3); total (56/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
TCAAATAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTGCAATAGCTCGC > NC_000913/466277‑466565 | tCAAATAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAAc > 7:64436/1‑148 (MQ=255) cAAATAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAAcc > 4:86285/1‑148 (MQ=255) aTAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCt < 2:235420/148‑1 (MQ=255) aTAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCt > 5:376444/1‑148 (MQ=255) tAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCtt < 8:27526/148‑1 (MQ=255) gCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTa < 1:25547/148‑1 (MQ=255) aaaaCCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAag > 1:329227/1‑147 (MQ=255) caCTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTCGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGa < 5:243528/145‑1 (MQ=255) cTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGAc > 8:447592/1‑148 (MQ=255) tGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTaa < 3:86285/148‑1 (MQ=255) tGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTaa < 3:370333/148‑1 (MQ=255) gCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTaa < 5:200219/147‑1 (MQ=255) cGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATg > 7:406092/1‑148 (MQ=255) tACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGt > 4:373482/1‑147 (MQ=255) aCTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCAAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGtaa > 5:296340/1‑148 (MQ=255) tGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGCTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAATCAGCGGATCACGTAAATGGtaat > 5:285202/1‑147 (MQ=255) ccTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATc < 1:288993/148‑1 (MQ=255) ggCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATg > 7:34043/1‑148 (MQ=255) gCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCAt < 8:406092/146‑1 (MQ=255) 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ccGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACTGTATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGATTTATCCAGTACCCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAAAGGTAATAATCa < 1:417557/139‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTcc < 2:329227/148‑1 (MQ=255) ccGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGAGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTcc < 1:243549/148‑1 (MQ=255) cGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGtaa > 1:189410/1‑132 (MQ=255) cGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGtaa < 2:189410/132‑1 (MQ=255) cGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACCCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCa < 1:417558/138‑1 (MQ=255) cGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACCCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCa > 2:417558/1‑138 (MQ=255) cGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTACCAAATCTATTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCACTACCCAACCGCTATAAGCAGCGGATGACGTAAATGGAAATAATCATgagatagg > 2:417557/1‑140 (MQ=255) ttGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACCACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAgg < 2:303296/148‑1 (MQ=255) ttGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGCATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAgg > 4:214812/1‑148 (MQ=255) tGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTTATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGc < 7:10598/101‑1 (MQ=255) tGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGc > 8:10598/1‑101 (MQ=255) 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ctcctcCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCAc > 1:372097/1‑147 (MQ=255) tcctccGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCAc > 3:246371/1‑146 (MQ=255) ccGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAagcagc > 3:307666/1‑101 (MQ=255) ccGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAagcagc < 4:307666/101‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGctc > 8:373923/1‑148 (MQ=255) ccGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGctc > 7:130486/1‑148 (MQ=255) 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ccGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGAccc < 6:178119/148‑1 (MQ=255) cGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTATATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCg > 2:335069/1‑148 (MQ=255) aCTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCTGATGACGTAAAAGGTAATAATCATGTAATTCCAGGCGCACAAGCTCTGCTTTGAAGTTTGTTAAGACAAAAGGACACGTGcc > 3:265411/1‑147 (MQ=255) gTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCa < 8:34043/148‑1 (MQ=255) ttCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATtgtg > 6:34253/1‑120 (MQ=255) tCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGaaa > 7:235154/1‑129 (MQ=255) tCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGaaa < 8:235154/129‑1 (MQ=255) cccAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCGCTGCTGTGAATTGTGTTACGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGt < 3:58859/147‑1 (MQ=255) accAAATCTTTTTCGAAAAGCGGAGGAGTTATCCAGTACTCAAACGATTTAAGCAGCGGATGACGTAAATTGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACAAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGt < 4:265411/146‑1 (MQ=255) ccAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTgg < 4:246371/148‑1 (MQ=255) ccAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTg < 7:447592/147‑1 (MQ=255) cAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTg > 5:45216/1‑146 (MQ=255) cAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTg < 6:45216/146‑1 (MQ=255) aaaTCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTggg > 6:400311/1‑147 (MQ=255) aaTCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGaa > 3:401309/1‑148 (MQ=255) tCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAAtt > 8:115369/1‑148 (MQ=255) ttttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTc > 4:31909/1‑80 (MQ=255) ttttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTc < 3:31909/80‑1 (MQ=255) ttttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGaaaa > 8:252276/1‑120 (MQ=255) ttttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGaaaa < 7:252276/120‑1 (MQ=255) tttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCg < 7:15023/147‑1 (MQ=255) ttCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCgg < 2:404237/147‑1 (MQ=255) aaaaGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTTCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATgcg > 2:145159/1‑148 (MQ=255) aaaaGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATgcg > 2:415879/1‑148 (MQ=255) aaaaGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGAAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGAGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATgcg > 3:91232/1‑148 (MQ=255) aaGCGGCGGAGTTATCCAGTACCCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCTCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATgcgc < 6:187934/147‑1 (MQ=255) aGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTg > 4:139277/1‑148 (MQ=255) ttATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTGCa < 1:145159/148‑1 (MQ=255) tCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTGCAAt < 2:372097/147‑1 (MQ=255) aGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCAACAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTg < 7:130082/104‑1 (MQ=255) aGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCAACAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTg > 8:130082/1‑104 (MQ=255) gTACTCAACCGCTTTAAGCAGCCGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTTTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCCATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATTGCTGCAATAGcac > 8:244082/1‑146 (MQ=255) aCTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGa < 1:41481/114‑1 (MQ=255) aCTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGa > 2:41481/1‑114 (MQ=255) aCTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTGCAATAGCTCGc > 3:14608/1‑148 (MQ=255) | TCAAATAGCAAAAACCTAAACTGATGCCGCTACTGACCTGGCTGACCCGTTGCAGCTCCTCCGGTTTGCCGATGGTGATTTGCACGGGATGCCGACAACTGGTTCCCAAATCTTTTTCGAAAAGCGGCGGAGTTATCCAGTACTCAACCGCTTTAAGCAGCGGATGACGTAAATGGTAATAATCATGGCTTTCCAGGCGCACCAGCTCTGCTGTGAATTGTGTTAAGCGAAAAGGACCCGTGCCGATCAGTGGGAATTGCGGATGCGCCAGATGGCTGCAATAGCTCGC > NC_000913/466277‑466565 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |