| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,507,472 | T→C | 5.2% | K77R (AAA→AGA) | yhfU ← | DUF2620 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,507,472 | 0 | T | C | 5.2% | 316.6 / 2.5 | 101 | K77R (AAA→AGA) | yhfU | DUF2620 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/47); new base C (2/3); total (49/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
ATACAGATCCATAGTCGTGCCTTTTATTTCAGATGGTTAATCAGCATCGGAATCGCGTGTTCGACGTGCTCAACGGAAAGGCCAAACGCCACTTTTCCTTCAGCGATCATTTTGGCGATATGCTCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGTGAATGAAA > NC_000913/3507325‑3507618 | attcAGATCCATAGTCGTGCCTTTTATTTCAGATGGTTAATCAGCATCGGAATCGCGTGTTCGACGTGCTCAACGGAAAGGCCAAACGCCACTTTTCCTTCAGCGATAATTTTGGAGATATGCTCCTCTTTCGCATTAATGCCTGGtt > 4:196689/4‑148 (MQ=255) cAGATCCATAGTCGTGCCTTTTATTTCAGATGGTTAATCAGCATCGGAATCGCGTGTTCGACGTGCTCAACGGAAAGGCCAAACGCCACTTTTCCTTCAGCGATCATTTTGGCGATATGCTCGTCTTTCGCTTTAATGCGTGGTTTgg < 6:251207‑M2/148‑3 (MQ=255) cAGATACATAGTCGTGCGTTTTAATTCAGATGGTTAATCAGCATCGGAAACGCGTGTTCGACGTGCTCAACGCAAAGCCCAAACGCCACTTTTCCTTCAGAGATCATTTTGGCGATATGCTCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTATgg < 8:443655‑M2/148‑3 (MQ=255) 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tatGCTCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCAt < 3:138710/148‑1 (MQ=255) tCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTATTAATCCAGTTGCCCGGATTTCa < 8:451029/136‑1 (MQ=255) tCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTACTAATCCAGTTGCCCGGATTTCa > 7:451029/1‑136 (MQ=255) tCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGAACCGGTATTACAAGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCg > 3:337275/1‑148 (MQ=255) cGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGc > 8:55075/1‑148 (MQ=255) gTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTac > 2:322987/1‑98 (MQ=255) 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gCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGt < 1:433447/148‑1 (MQ=255) ttAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATGGCCTATCACCGCGATGGCaa > 7:355493/1‑58 (MQ=255) ttAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATGGCCTATCACCGCGATGGCaa < 8:355493/58‑1 (MQ=255) aTGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGGCGCTTCCATGTCGTtg < 3:114166/147‑1 (MQ=255) ccTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCgg < 1:37384/76‑1 (MQ=255) cTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGtgaat > 8:437545/1‑148 (MQ=255) ggTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGtgaatg > 4:302537/1‑147 (MQ=255) ggTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGtgaatg > 2:394531/1‑147 (MQ=255) ggTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGtga > 7:55754/1‑144 (MQ=255) ggTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGtga < 8:55754/144‑1 (MQ=255) tttGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGTGAATGaaa < 3:28025/148‑1 (MQ=255) tttGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGTGAATGaaa < 5:134878/148‑1 (MQ=255) | ATACAGATCCATAGTCGTGCCTTTTATTTCAGATGGTTAATCAGCATCGGAATCGCGTGTTCGACGTGCTCAACGGAAAGGCCAAACGCCACTTTTCCTTCAGCGATCATTTTGGCGATATGCTCGTCTTTCGCTTTAATGCCTGGTTTGGCAATGGTGCAACTTTTGTTATAGCCTATCACCGCGATGGCAATCGACAATGCCGCGCCCGCACCGGTATTACACGCGCCGATGTAATAATCCAGTTGCCCGGATTTCACCTTCATTGCCGCTTCCATGTCGTTGTGAATGAAA > NC_000913/3507325‑3507618 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |