| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 2643100 | 101 (1.050) | 5 (0.060) | 5/254 | 8.7 | 5.3% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | NC_000913 | = 2643110 | 89 (1.020) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCAC > NC_000913/2642952‑2643241 | tCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGt < 7:43205/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 8:257031/149‑1 (MQ=255) cTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa > 5:76136/1‑149 (MQ=255) gCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATa > 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aCAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACAt < 4:20768/139‑1 (MQ=255) cAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGt < 4:201487/149‑1 (MQ=255) aaGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTgg < 7:210065/149‑1 (MQ=255) aGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGc < 4:255454/149‑1 (MQ=255) ccACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGt > 2:304006/1‑148 (MQ=255) 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aaTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGAGGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa < 8:183668/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 5:361853/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 8:306151/148‑1 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGAc < 4:332535/148‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTACCCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACca < 2:267409/149‑1 (MQ=255) 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aTTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTc < 2:173578/99‑1 (MQ=255) aTTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa < 4:153388/129‑1 (MQ=255) aTTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGa > 3:153388/1‑129 (MQ=255) gCCACGGTACATACAGTATCGGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCTTCCGGTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGGCGATACAAGCGCCCGCCAACTGACCAGATGCAGCATCGATATCATcac < 2:100488/149‑1 (MQ=255) gCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATcac < 2:273670/149‑1 (MQ=255) | TCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCAC > NC_000913/2642952‑2643241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |