| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,772,467 | C→T | 6.3% | L63L (CTG→TTG) | mtlA → | mannitol‑specific PTS enzyme: IIA, IIB and IIC components |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,772,467 | 0 | C | T | 6.3% | 196.4 / 2.6 | 63 | L63L (CTG→TTG) | mtlA | mannitol‑specific PTS enzyme: IIA, IIB and IIC components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/33); new base T (2/2); total (28/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.89e-01 | |||||||||||
GTTTCCTCAGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTGGTGCA > NC_000913/3772321‑3772611 | gTTTCCTCAGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCgctgct > 7:51674/1‑148 (MQ=255) cTCAGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCgg < 7:37710/149‑1 (MQ=255) tCAGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGt > 5:78055/1‑149 (MQ=255) aGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGt < 4:305086/147‑1 (MQ=255) aGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGt < 6:307736/147‑1 (MQ=255) aGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTta < 8:51674/149‑1 (MQ=255) aGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTAGCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGGTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCGGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGt < 3:71677/147‑1 (MQ=255) aaCATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATAc < 3:13479/149‑1 (MQ=255) cATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGGGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCg < 1:241356/149‑1 (MQ=255) gTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCggtg < 4:35092/148‑1 (MQ=255) ccAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGACAGCGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCt > 4:75200/1‑149 (MQ=255) cAATTATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCAACGCGTTATTTATTCCAACAGGGTTGTTACCTAACGAGACGCTGGCGAAGCTTGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATAc < 8:168897/136‑1 (MQ=255) atatCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTgg > 2:119368/1‑147 (MQ=255) tCGGCGCGGATATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGAGAAGCTGGTCGGCCCGATGATAACTTAACACCTGCCGCTGCTGAACCGTTATACCGGTGGTAAGCTCGAAgga > 4:204426/1‑148 (MQ=255) cgTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGaa < 6:17711/149‑1 (MQ=255) aTCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCggtg > 4:267516/1‑124 (MQ=255) aTCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCggtg < 3:267516/124‑1 (MQ=255) tCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTggc < 1:119368/149‑1 (MQ=255) gttcatcaCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGGGTAGTCg < 3:204426/147‑1 (MQ=255) tcatcaCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGt > 7:278182/1‑149 (MQ=255) tcatcaCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGt < 8:290399/149‑1 (MQ=255) atcaCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGc > 8:124402/1‑149 (MQ=255) aCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGt < 2:226792/137‑1 (MQ=255) aCCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGAGt > 1:226792/1‑137 (MQ=255) ccGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCAt > 5:182905/1‑148 (MQ=255) cgcgTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAggcggc < 2:48845/121‑1 (MQ=255) cgcgTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAggcggc > 1:48845/1‑121 (MQ=255) gcgTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTATGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATcac > 2:138107/1‑149 (MQ=255) cgTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGACCGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATcacc > 5:56761/1‑149 (MQ=255) ttatttatTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGACGGCCCGAAGAACACTTATCTCCTGCCCCTGCTGATCGCTTATACCGGTGGTAAGCTGGGAGGAGGCGAACCTGGCGCCGTAGTCGGTGCCAAcaccac > 3:65195/1‑149 (MQ=255) tatttattCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTa > 1:66859/1‑102 (MQ=255) tatttattCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTa < 2:66859/102‑1 (MQ=255) tttattCCAACAGGGGGGTTACCGAACGCGACGCTGGCGAAGCTTGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCAccacca < 6:108222/148‑1 (MQ=255) ttCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGc > 8:63422/1‑149 (MQ=255) aCAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTAt < 6:78055/149‑1 (MQ=255) gtTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGAAAACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACAGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGgcg > 8:425329/1‑149 (MQ=255) cGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGa < 1:138107/148‑1 (MQ=255) aaCGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACAt > 4:177050/1‑149 (MQ=255) aCGAGATGCTGGCGATTCGGGTCGGGCCTATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGAGCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGGAGGCGGCGTACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGAct < 6:56761/147‑2 (MQ=255) aCGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGTTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCAccacca > 4:29829/1‑123 (MQ=255) aCGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGTTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCAccacca > 4:24416/1‑123 (MQ=255) aCGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGTTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCAccacca < 3:29829/123‑1 (MQ=255) aCGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGTTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCAccacca < 3:24416/123‑1 (MQ=255) gagaCGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACa > 5:325508/1‑145 (MQ=255) gagaCGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACa < 6:325508/145‑1 (MQ=255) acgcgtgCGAAGCTGGTCGGGCCGATGCTCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGAt < 3:75200/143‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGGCGGCGCAGACATGCCGATGt < 2:373053/147‑1 (MQ=255) cTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGtt > 1:373053/1‑149 (MQ=255) gCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGgcgc > 2:367205/1‑131 (MQ=255) gCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGgcgc < 1:367205/131‑1 (MQ=255) gCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCt > 2:356234/1‑149 (MQ=255) cGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTc < 7:63422/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGt < 7:90022/94‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGt > 8:90022/1‑94 (MQ=255) atCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTc < 3:177050/148‑1 (MQ=255) tCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAg < 1:329927/144‑1 (MQ=255) tCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAg > 2:329927/1‑144 (MQ=255) ttATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTgg > 1:242668/1‑149 (MQ=255) tctcCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGggc < 2:281843/148‑1 (MQ=255) tcgccTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGggc < 2:281846/145‑1 (MQ=255) tGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTgg > 7:11036/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTGGt < 8:11036/148‑1 (MQ=255) cGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAg > 6:140528/1‑129 (MQ=255) cGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAg < 5:140528/129‑1 (MQ=255) gctgctGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTTGTGCa < 7:425329/149‑1 (MQ=255) gctgctGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTGGTGCa > 5:219508/1‑149 (MQ=255) gctgctGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTGGTGCa > 5:192903/1‑149 (MQ=255) | GTTTCCTCAGCAACATGGTGATGCCAAATATCGGCGCGTTTATCGCGTGGGGTATCATCACCGCGTTATTTATTCCAACAGGGTGGTTACCGAACGAGACGCTGGCGAAGCTGGTCGGGCCGATGATCACTTATCTCCTGCCGCTGCTGATCGGTTATACCGGTGGTAAGCTGGTAGGCGGCGAACGTGGCGGCGTAGTCGGTGCCATCACCACCATGGGCGTTATCGTCGGCGCAGACATGCCGATGTTCCTCGGTTCTATGATTGCAGGTCCGCTGGGCGGCTGGTGCA > NC_000913/3772321‑3772611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |