| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,034,691 | G→A | 5.0% | pseudogene (641/663 nt) | yedS → | pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,034,691 | 0 | G | A | 5.0% | 254.8 / 2.3 | 79 | pseudogene (641/663 nt) | yedS | pseudogene, outer membrane protein homology; putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/33); new base A (2/2); total (44/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 | |||||||||||
GCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATG > NC_000913/2034544‑2034839 | gCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGt > 4:37676/1‑149 (MQ=255) ttGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATTGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGCCTTCGGtt > 5:10687/1‑148 (MQ=255) gAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGttt < 4:111517/147‑1 (MQ=255) aCTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGt > 7:262706/1‑149 (MQ=255) tttgctttgcAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCt > 8:270130/1‑149 (MQ=255) tttgcAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGtg > 7:319792/1‑149 (MQ=255) tatCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTaa < 4:759/133‑1 (MQ=255) tatCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTaa > 3:759/1‑133 (MQ=255) atCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGAGTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCatat > 7:315207/1‑149 (MQ=255) atCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGtgc > 5:390188/1‑142 (MQ=255) atCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGtgc < 6:390188/142‑1 (MQ=255) gggTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGATTTAAGTCTGGGtgctgc < 5:380607/141‑1 (MQ=255) gggTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGATTTAAGTCTGGGtgctgc > 6:380607/1‑141 (MQ=255) ggTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCt > 1:399501/1‑131 (MQ=255) ggTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCt < 2:399501/131‑1 (MQ=255) taatGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGa > 5:34784/1‑149 (MQ=255) aatGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGAt > 1:378571/1‑149 (MQ=255) atGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGAt < 5:178228/148‑1 (MQ=255) atGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGGTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATc < 7:380404/149‑1 (MQ=255) gAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGt > 6:266289/1‑149 (MQ=255) aGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCa < 2:378571/149‑1 (MQ=255) gtggACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATc < 5:266289/149‑1 (MQ=255) gACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGt > 8:214209/1‑148 (MQ=255) gACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGt > 4:94932/1‑148 (MQ=255) cATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAgg > 5:57612/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGATTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGtt > 6:92266/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGtt > 7:144053/1‑149 (MQ=255) aGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTTAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTg < 5:130527/149‑1 (MQ=255) ggAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTgg > 6:145378/1‑149 (MQ=255) gAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGt < 3:37676/149‑1 (MQ=255) gAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATAGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGt < 3:346501/149‑1 (MQ=255) ggTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGttt > 6:39375/1‑148 (MQ=255) cGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGa < 6:34784/149‑1 (MQ=255) cGGTAGTGGTGATGGCCCTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGCTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCAAATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGa > 4:202032/1‑149 (MQ=255) gTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAACTGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATc < 3:116311/149‑1 (MQ=255) gTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATc < 8:144053/149‑1 (MQ=255) ggtgATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAAc > 8:230515/1‑149 (MQ=255) gTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCaa > 7:343852/1‑147 (MQ=255) gTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCaa > 7:153501/1‑147 (MQ=255) tAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCaa > 8:83914/1‑146 (MQ=255) aGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCa < 8:314948/101‑1 (MQ=255) aGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCa > 7:314948/1‑101 (MQ=255) cTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAAt > 5:34985/1‑149 (MQ=255) tttCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATg > 3:145865/1‑149 (MQ=255) tCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATg < 7:214209/147‑1 (MQ=255) tCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGc < 3:94932/148‑1 (MQ=255) ccAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCt < 8:262706/148‑1 (MQ=255) cAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCtgg > 6:272130/1‑149 (MQ=255) aaaGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCtggt > 2:4369/1‑149 (MQ=255) aGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCTGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCtggtgg < 7:327772/149‑1 (MQ=255) gAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTggtggt > 7:272313/1‑149 (MQ=255) aaaTGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGa < 6:34985/149‑1 (MQ=255) aaTTGTGATGGTGTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCGTGTTGCTGCATATCATACTCTGATCGTTCAGATCGTAAGTTTGGAGTTGGGTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGa < 2:357583/148‑1 (MQ=255) aTGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGaaa < 5:145378/149‑1 (MQ=255) ggTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAAcc > 7:247257/1‑149 (MQ=255) ggTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAAcc > 5:122674/1‑149 (MQ=255) aTGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTg > 7:158314/1‑92 (MQ=255) aTGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTg < 8:158314/92‑1 (MQ=255) gTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGaa < 8:153501/148‑1 (MQ=255) gTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGaa < 7:75784/148‑1 (MQ=255) ttCGGTATGTAAACCTCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCGGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCATATCGTCAGGTAGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAAGAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGATGAAGCa > 6:158965/1‑149 (MQ=255) ggTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGATTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATg < 5:92266/148‑1 (MQ=255) gTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGa > 4:360589/1‑149 (MQ=255) aTGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACt > 3:394005/1‑149 (MQ=255) aaCATCCTCCGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGGCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTgg > 6:115557/1‑149 (MQ=255) aaCATACTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTgg > 3:81914/1‑149 (MQ=255) aCATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGt < 7:83914/149‑1 (MQ=255) aCATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGt < 7:270130/149‑1 (MQ=255) tCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGc > 6:117953/1‑148 (MQ=255) ccTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCa > 4:99416/1‑148 (MQ=255) tACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCaaaa > 4:373064/1‑149 (MQ=255) cgacttcgacttCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAata < 8:272313/149‑1 (MQ=255) cttcgacttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATatga < 4:394005/149‑1 (MQ=255) cttcgacttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATatga < 3:99416/149‑1 (MQ=255) cttcgacttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATatga < 8:319792/149‑1 (MQ=255) cttcgacttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATatga < 8:343852/149‑1 (MQ=255) cttcgacttcgGTTTAAGTCTGGCTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGGTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCGGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATatga < 6:10687/149‑1 (MQ=255) gacttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGc > 5:345808/1‑148 (MQ=255) ttcgGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCtaa > 8:180772/1‑148 (MQ=255) ggTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCtaataa < 7:152397/148‑1 (MQ=255) gTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAAtg > 2:361915/1‑149 (MQ=255) | GCTTGAACTTTGCTTTGCAATATCAGGGTAATAATGAAAGTGGTGGACCATTCGGGCAGGAAGGTTCCGGTAGTGGTGATGGCCGTAGCCTTTCCAAAGAAAATGGTGATGGTTTCGGTATGTCAACATCCTACGACTTCGACTTCGGTTTAAGTCTGGGTGCTGCATATCAAACTCTGATCGTTCAGATCGTCAGGTTGGAGTTGGTTTAAATGATCGTAACCATAGCAACAGAAATGCTGGTGGTGAAACCGCTGAAGCATGGACTGTTGGTGCAAAATATGATGCTAATAATG > NC_000913/2034544‑2034839 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |