| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,292,003 | G→A | 5.1% | S221S (TCG→TCA) | yraK → | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,292,003 | 0 | G | A | 5.1% | 312.6 / 4.2 | 97 | S221S (TCG→TCA) | yraK | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (44/48); new base A (3/2); total (47/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.90e-01 | |||||||||||
CCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAA > NC_000913/3291876‑3292149 | ccATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGAt > 6:237875/1‑149 (MQ=255) cATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATg > 5:192277/1‑149 (MQ=255) ccGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGtta < 2:404951/148‑1 (MQ=255) cGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttat > 1:382049/1‑148 (MQ=255) cGAAAACGGATATTCCCGTCATTTAAGGCTCGTGGGTCGATTGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGttatt < 4:214681/149‑1 (MQ=255) aaaaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTaa < 7:371199/149‑1 (MQ=255) aaaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAg < 4:1576/149‑1 (MQ=255) aaaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAg > 7:36635/1‑149 (MQ=255) aaCGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAgg < 6:192277/149‑1 (MQ=255) ggATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGtt > 8:109772/1‑148 (MQ=255) gATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGGGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGTCGATGTTATTAAGGTTaa < 2:266791/149‑1 (MQ=255) atatTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGc > 7:341460/1‑131 (MQ=255) atatTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGc < 8:341460/131‑1 (MQ=255) atTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAttt > 7:4603/1‑149 (MQ=255) ttGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtttt < 8:36635/149‑1 (MQ=255) gCCGTCCTTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTg < 1:96300/148‑1 (MQ=255) gCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTg < 3:237706/148‑1 (MQ=255) ccGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGa < 3:319297/149‑1 (MQ=255) ccGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGa < 1:198733/149‑1 (MQ=255) ccGGCATTAACGGCGCGTGGGGCGATGGAAGGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGGTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGa < 5:349863/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtcat < 3:100578/149‑1 (MQ=255) aTTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtca > 3:172433/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCa < 5:159705/115‑1 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCa > 6:159705/1‑115 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtttt > 1:384543/1‑140 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtttt < 2:384543/140‑1 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtcat > 4:219109/1‑148 (MQ=255) ttAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATtcat > 1:228416/1‑148 (MQ=255) aaGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCaa < 4:45095/148‑1 (MQ=255) ggCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCAGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCAAAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATgg < 6:320787/149‑1 (MQ=255) gTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGtt < 4:208577/149‑1 (MQ=255) cGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTa < 2:382049/149‑1 (MQ=255) aTGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTac > 8:396554/1‑148 (MQ=255) aTGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTac > 5:146211/1‑148 (MQ=255) ggAATGGCAAGCCCGTCGACAGGTGACTTCCATGATTTACTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCCCCGCCCCACAGTCGAGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGACATCAGTTTacgca > 4:4865/1‑146 (MQ=255) aaTGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCAccc > 4:225934/1‑149 (MQ=255) gAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCAACCGCAat > 6:356522/1‑149 (MQ=255) ccGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccat < 8:4603/149‑1 (MQ=255) ccGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccat > 7:289147/1‑149 (MQ=255) cGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccatg < 8:289147/149‑1 (MQ=255) cGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACAGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtt < 5:5755/105‑1 (MQ=255) cGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACAGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAAtt > 6:5755/1‑105 (MQ=255) gTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCATGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAatgccatgc > 2:136661/1‑149 (MQ=255) cAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCaaaa > 3:348395/1‑69 (MQ=255) cAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCaaaa < 4:348395/69‑1 (MQ=255) cAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAAtgccatgcca < 7:396554/146‑1 (MQ=255) ggTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACgg > 3:362978/1‑149 (MQ=255) gTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGt > 3:204839/1‑149 (MQ=255) aCTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGttt > 1:89536/1‑148 (MQ=255) cTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTa < 5:237875/149‑1 (MQ=255) cTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTa < 2:228416/149‑1 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCCCCCGCAATGCACTGCCAGACGGTTTTAc > 5:364481/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTAc > 7:286336/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGAAAAATTAATCAGGGCGATGTTAGTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGACAGAAGTTTTCCACCCGCAATGCCAGGCCAGACGCTTTTAc > 2:267212/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCATGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTAc > 2:392592/1‑149 (MQ=255) ttCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCATGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTAc > 8:4299/1‑149 (MQ=255) cATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTc < 8:286336/148‑1 (MQ=255) cATGAGTTAGTCAATTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCAACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTc < 4:489/148‑1 (MQ=255) aTGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTc > 1:27275/1‑147 (MQ=255) gATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAg > 7:380217/1‑148 (MQ=255) gATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTAATCCAg > 1:246832/1‑148 (MQ=255) aTTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAg > 2:212818/1‑147 (MQ=255) tCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACttt < 4:362978/149‑1 (MQ=255) tCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACttt > 2:79017/1‑149 (MQ=255) ttATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGatat > 2:344065/1‑149 (MQ=255) tCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCAc > 1:272171/1‑149 (MQ=255) tCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCAc < 7:266046/149‑1 (MQ=255) ttCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTAt > 4:120567/1‑149 (MQ=255) aGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGa < 7:218240/148‑1 (MQ=255) aGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGAc > 3:369900/1‑149 (MQ=255) gggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCAccc < 8:232581/95‑1 (MQ=255) gggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCAccc > 7:232581/1‑95 (MQ=255) gggAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACt > 3:15335/1‑149 (MQ=255) aaaTCTCACCGCCGCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTTAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGTTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGACATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTTGACTTTGATATCACTTATGACtgtg < 3:4865/149‑1 (MQ=255) aTCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtggt < 7:53728/149‑1 (MQ=255) tctcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTgtggt > 5:243196/1‑148 (MQ=255) tcACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGa > 3:278476/1‑148 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGTGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtg < 7:158904/140‑1 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGTGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACtg > 8:158904/1‑140 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGa < 7:109772/146‑1 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATa < 5:356522/148‑1 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATAc > 7:255792/1‑149 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCATGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGa < 7:4299/146‑1 (MQ=255) aCCGCCCCACAGTCATGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGa < 1:392592/146‑1 (MQ=255) cGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACtt < 4:172433/149‑1 (MQ=255) gCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTc < 4:15335/149‑1 (MQ=255) gCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTGATGCCTGTGGTGATACtt > 1:210420/1‑148 (MQ=255) gCCCCACAGCCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTc < 2:422495/149‑1 (MQ=255) cccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCa > 8:28324/1‑148 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGAc < 2:255584/114‑1 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGAc > 1:255584/1‑114 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGTTACTTCaaa < 7:410347/149‑1 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCaaa < 8:156596/149‑1 (MQ=255) ccACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCaaa < 1:79017/149‑1 (MQ=255) acaGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGa < 1:344065/149‑1 (MQ=255) tCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaa < 8:380217/149‑1 (MQ=255) tCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTaa < 1:212818/149‑1 (MQ=255) | CCATTCCGAAAACGGATATTGCCGTCATTAAAGGCGCGTGGGTCGATGGAATGGGAAGCCCGTCTACAGGTGACTTCCATGATTTAGTCAAGTTATCGATTCAGGGAAATCTCACCGCCCCACAGTCGTGCAAAATTAATCAGGGCGATGTTATTAAGGTTAATTTTGGATTCATCAATGGTCAGAAGTTTACCACCCGCAATGCCATGCCAGACGGTTTTACTCCAGTAGACTTTGATATCACTTATGACTGTGGTGATACTTCAAAGATTAA > NC_000913/3291876‑3292149 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |